More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_1691 on replicon NC_008784
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010086  Bmul_4597  formate dehydrogenase, alpha subunit  92.66 
 
 		 810 aa  651    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.654701  normal  0.94372 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3879  formate dehydrogenase, alpha subunit  92.35 
 
 		 810 aa  653    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.319379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0730  formate dehydrogenase, alpha subunit  100 
 
 		 822 aa  712    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2100  formate dehydrogenase alpha subunit  92.63 
 
 		 822 aa  672    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2396  formate dehydrogenase-O, major subunit, selenocysteine-containing  100 
 
 		 822 aa  712    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0707  formate dehydrogenase, alpha subunit, selenocysteine-containing  97.05 
 
 		 1023 aa  696    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2553  formate dehydrogenase alpha subunit  87.32 
 
 		 821 aa  636    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4382  formate dehydrogenase, alpha subunit, anaerobic  92.63 
 
 		 822 aa  673    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2259  formate dehydrogenase-O, major subunit, selenocysteine-containing  99.71 
 
 		 1023 aa  712    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181302  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1898  formate dehydrogenase-O, major subunit  100 
 
 		 339 aa  711    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364587  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3377  formate dehydrogenase, alpha subunit  92.63 
 
 		 822 aa  676    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.365346  normal  0.791414 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3984  formate dehydrogenase, alpha subunit  92.63 
 
 		 822 aa  673    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3544  formate dehydrogenase, alpha subunit  92.66 
 
 		 810 aa  651    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1691  formate dehydrogenase, nitrate-inducible, major subunit  100 
 
 		 339 aa  711    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4518  formate dehydrogenase, alpha subunit  88.69 
 
 		 810 aa  620  1e-176  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.101955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6560  formate dehydrogenase, alpha subunit  85.63 
 
 		 809 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22445  normal  0.0150185 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1818  formate dehydrogenase alpha subunit  76.99 
 
 		 820 aa  561  1.0000000000000001e-159  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.266188 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5531  formate dehydrogenase subunit alpha  75.44 
 
 		 825 aa  554  1e-157  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63605  formate dehydrogenase-O, major subunit  75.15 
 
 		 1026 aa  553  1e-156  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3261  formate dehydrogenase, alpha subunit  73.75 
 
 		 1022 aa  544  1e-154  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0523  formate dehydrogenase, alpha subunit  72.06 
 
 		 821 aa  533  1e-150  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2698  formate dehydrogenase alpha subunit  71.18 
 
 		 820 aa  521  1e-147  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0271863 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3490  formate dehydrogenase, alpha subunit  72.78 
 
 		 808 aa  522  1e-147  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.657613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0544  formate dehydrogenase, alpha subunit  71.95 
 
 		 809 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0932731 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2008  formate dehydrogenase, alpha subunit  68.44 
 
 		 824 aa  507  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.715291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0532  formate dehydrogenase, alpha subunit  70.73 
 
 		 809 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.170319  normal  0.968416 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2863  formate dehydrogenase, alpha subunit  66.76 
 
 		 824 aa  494  1e-139  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.202456  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2183  formate dehydrogenase, alpha subunit  66.37 
 
 		 1015 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.668487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3754  formate dehydrogenase alpha subunit  66.96 
 
 		 828 aa  493  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01432  formate dehydrogenase-N, alpha subunit, nitrate-inducible  65.78 
 
 		 1015 aa  488  1e-137  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3810  formate dehydrogenase, alpha subunit  66.67 
 
 		 1028 aa  489  1e-137  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3894  formate dehydrogenase, alpha subunit  66.67 
 
 		 1028 aa  489  1e-137  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4119  aerobic formate dehydrogenase subunit alpha  66.37 
 
 		 1015 aa  490  1e-137  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3770  formate dehydrogenase, alpha subunit, selenocysteine-containing  66.37 
 
 		 1015 aa  490  1e-137  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4090  formate dehydrogenase, alpha subunit  65.78 
 
 		 1016 aa  484  1e-136  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4280  formate dehydrogenase-O, major subunit, selenocysteine-containing  65.78 
 
 		 1016 aa  485  1e-136  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3325  formate dehydrogenase, alpha subunit  67.06 
 
 		 1023 aa  484  1e-136  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.723924 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1557  formate dehydrogenase, nitrate inducible, alpha subunit, selenocysteine-containing  65.78 
 
 		 1015 aa  487  1e-136  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.468579  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1700  formate dehydrogenase, nitrate inducible, alpha subunit, selenocysteine-containing  65.78 
 
 		 1015 aa  487  1e-136  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.3444  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03779  formate dehydrogenase-O, major subunit  65.78 
 
 		 1016 aa  484  1e-135  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4123  molybdopterin oxidoreductase alpha subunit  65.78 
 
 		 1016 aa  484  1e-135  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4122  formate dehydrogenase-O, major subunit, selenocysteine-containing  65.78 
 
 		 1016 aa  484  1e-135  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2829  formate dehydrogenase, alpha subunit  64.39 
 
 		 820 aa  478  1e-134  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.500302  normal  0.743867 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1210  formate dehydrogenase, alpha subunit  65.29 
 
 		 1066 aa  476  1e-133  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1092  formate dehydrogenase, alpha subunit  67.99 
 
 		 811 aa  477  1e-133  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.525887 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2662  formate dehydrogenase, alpha subunit  64.01 
 
 		 1015 aa  475  1e-133  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.613089  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2173  formate dehydrogenase, alpha subunit  65.14 
 
 		 803 aa  468  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.309024  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0038  formate dehydrogenase, alpha subunit  65.75 
 
 		 803 aa  469  1.0000000000000001e-131  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1335  formate dehydrogenase, alpha subunit  62.54 
 
 		 1015 aa  469  1.0000000000000001e-131  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0662  formate dehydrogenase, alpha subunit  65.85 
 
 		 812 aa  468  1.0000000000000001e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.457174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1655  formate dehydrogenase, nitrate inducible, alpha subunit, selenocysteine-containing  65.44 
 
 		 803 aa  467  9.999999999999999e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1286  formate dehydrogenase, alpha subunit  62.54 
 
 		 1015 aa  463  1e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1427  formate dehydrogenase, alpha subunit  61.95 
 
 		 1016 aa  462  1e-129  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.50627  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1750  formate dehydrogenase alpha subunit  62.24 
 
 		 1016 aa  461  1e-129  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00182445 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2519  formate dehydrogenase, alpha subunit  61.06 
 
 		 1016 aa  458  9.999999999999999e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0084  formate dehydrogenase, alpha subunit  64.22 
 
 		 803 aa  458  9.999999999999999e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4085  formate dehydrogenase alpha subunit  64.22 
 
 		 804 aa  456  1e-127  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3045  formate dehydrogenase, alpha subunit  60.47 
 
 		 1015 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03810  formate dehydrogenase, alpha subunit  59 
 
 		 1018 aa  452  1.0000000000000001e-126  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2054  formate dehydrogenase alpha subunit  63.3 
 
 		 803 aa  450  1e-125  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2089  formate dehydrogenase alpha subunit  61.72 
 
 		 1005 aa  443  1e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000081067 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0099  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  58.88 
 
 		 1004 aa  437  1e-121  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0104  formate dehydrogenase, alpha subunit  58.88 
 
 		 1004 aa  437  1e-121  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0101  selenium-containing formate dehydrogenase, nitrate inducible, alpha subunit  57.99 
 
 		 1004 aa  428  1e-119  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0105  formate dehydrogenase, alpha subunit  57.98 
 
 		 794 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0102  formate dehydrogenase alpha subunit  57.36 
 
 		 794 aa  409  1e-113  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0438  formate dehydrogenase, alpha subunit  58.15 
 
 		 796 aa  410  1e-113  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0097  formate dehydrogenase alpha subunit  57.36 
 
 		 794 aa  408  1e-113  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0643  formate dehydrogenase, alpha subunit  52.52 
 
 		 1012 aa  374  1e-102  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0165738 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2638  formate dehydrogenase, alpha subunit  51.49 
 
 		 1059 aa  368  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.409853 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3374  formate dehydrogenase, alpha subunit  52.08 
 
 		 1061 aa  362  4e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1570  formate dehydrogenase, alpha subunit  50.45 
 
 		 1014 aa  357  9.999999999999999e-98  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1575  formate dehydrogenase, alpha subunit  51.54 
 
 		 842 aa  355  5.999999999999999e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1217  formate dehydrogenase, alpha subunit  52.25 
 
 		 1008 aa  352  5e-96  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0663541 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0777  formate dehydrogenase, major subunit, selenocysteine-containing  51.36 
 
 		 1010 aa  352  8e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0501  formate dehydrogenase, alpha subunit  48.07 
 
 		 1012 aa  350  3e-95  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.662776 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3510  formate dehydrogenase, alpha subunit  49.55 
 
 		 1015 aa  349  4e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.722583  normal  0.530799 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1955  formate dehydrogenase, alpha subunit  50.15 
 
 		 1009 aa  347  2e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0036  formate dehydrogenase, alpha subunit  50.77 
 
 		 804 aa  346  3e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0129417  normal  0.222699 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1274  formate dehydrogenase, alpha subunit  51.71 
 
 		 816 aa  346  3e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3513  formate dehydrogenase alpha subunit  50.15 
 
 		 808 aa  345  8e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0226  formate dehydrogenase, alpha subunit  48.97 
 
 		 1005 aa  343  2e-93  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.174026  normal  0.0776388 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0799  formate dehydrogenase  47.41 
 
 		 851 aa  343  2.9999999999999997e-93  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3388  formate dehydrogenase, alpha subunit  48.67 
 
 		 1010 aa  336  2.9999999999999997e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2365  formate dehydrogenase, alpha subunit  50.75 
 
 		 1005 aa  334  1e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.1698 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1059  formate dehydrogenase alpha subunit  49.4 
 
 		 1010 aa  333  2e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.080154 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0971  formate dehydrogenase, alpha subunit  47.45 
 
 		 1011 aa  331  1e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.893461  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1580  formate dehydrogenase  48.65 
 
 		 808 aa  331  1e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19190  formate dehydrogenase, alpha subunit  46.05 
 
 		 1100 aa  330  3e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.525812  normal  0.681395 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0646  formate dehydrogenase, alpha subunit  49.26 
 
 		 1013 aa  328  6e-89  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.166325 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2267  formate dehydrogenase, alpha subunit  48.93 
 
 		 802 aa  324  1e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0813  formate dehydrogenase alpha subunit  47.81 
 
 		 1014 aa  324  1e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2533  formate dehydrogenase, alpha subunit  46.85 
 
 		 1010 aa  324  2e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0555  formate dehydrogenase, alpha subunit  49.85 
 
 		 1012 aa  318  7e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0761  formate dehydrogenase, alpha subunit  47.15 
 
 		 1003 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.109779  normal  0.059567 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0717  formate dehydrogenase, alpha subunit, anaerobic  48.6 
 
 		 798 aa  313  2.9999999999999996e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0021  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.58 
 
 		 1084 aa  310  2e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.12847 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0344  molybdopterin dinucleotide-binding region  43.77 
 
 		 905 aa  310  2e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.632041  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04200  uncharacterized anaerobic dehydrogenase  44.1 
 
 		 920 aa  308  6.999999999999999e-83  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0456011 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2291  formate dehydrogenase  43.01 
 
 		 870 aa  307  2.0000000000000002e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>