More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0454 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_1868  formate dehydrogenase, alpha subunit  65.36 
 
 		 1020 aa  1110    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2088  formate dehydrogenase  65.36 
 
 		 812 aa  1111    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.207847  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1789  formate dehydrogenase, alpha subunit  65.36 
 
 		 1020 aa  1110    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3043  formate dehydrogenase  66.17 
 
 		 812 aa  1127    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4271  formate dehydrogenase, alpha subunit  52.95 
 
 		 1016 aa  845    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.12828  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0454  formate dehydrogenase  100 
 
 		 816 aa  1700    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0891729  normal  0.433565 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1825  formate dehydrogenase  49.32 
 
 		 808 aa  778    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0283  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.9 
 
 		 803 aa  633  1e-180  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.105016  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0643  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.07 
 
 		 1012 aa  631  1e-179  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0165738 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0777  formate dehydrogenase, major subunit, selenocysteine-containing  42.63 
 
 		 1010 aa  625  1e-177  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3388  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.39 
 
 		 1010 aa  620  1e-176  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1955  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.34 
 
 		 1009 aa  615  1e-175  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2638  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.18 
 
 		 1059 aa  615  1e-175  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.409853 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2267  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.22 
 
 		 802 aa  614  9.999999999999999e-175  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1059  formate dehydrogenase alpha subunit  41.72 
 
 		 1010 aa  612  9.999999999999999e-175  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.080154 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1575  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.75 
 
 		 842 aa  613  9.999999999999999e-175  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0036  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.46 
 
 		 804 aa  602  1.0000000000000001e-171  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0129417  normal  0.222699 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1274  formate dehydrogenase, alpha subunit  42 
 
 		 816 aa  601  1e-170  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1580  formate dehydrogenase  42.84 
 
 		 808 aa  596  1e-169  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3510  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.62 
 
 		 1015 aa  591  1e-167  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.722583  normal  0.530799 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1570  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.08 
 
 		 1014 aa  588  1e-166  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0501  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.23 
 
 		 1012 aa  588  1e-166  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.662776 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3513  formate dehydrogenase alpha subunit  40.72 
 
 		 808 aa  579  1e-164  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3374  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.88 
 
 		 1061 aa  581  1e-164  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2008  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.97 
 
 		 824 aa  577  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.715291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1114  formate dehydrogenase  40.07 
 
 		 811 aa  572  1.0000000000000001e-162  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0761  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.58 
 
 		 1003 aa  573  1.0000000000000001e-162  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.109779  normal  0.059567 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0646  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.24 
 
 		 1013 aa  570  1e-161  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.166325 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3754  formate dehydrogenase alpha subunit  40.83 
 
 		 828 aa  568  1e-160  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0971  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.07 
 
 		 1011 aa  562  1.0000000000000001e-159  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.893461  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0226  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.45 
 
 		 1005 aa  561  1e-158  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.174026  normal  0.0776388 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0555  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.55 
 
 		 1012 aa  559  1e-158  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3810  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.07 
 
 		 1028 aa  561  1e-158  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3894  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.95 
 
 		 1028 aa  561  1e-158  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2533  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.19 
 
 		 1010 aa  559  1e-158  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0102  formate dehydrogenase alpha subunit  39.71 
 
 		 794 aa  555  1e-157  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01432  formate dehydrogenase-N, alpha subunit, nitrate-inducible  39.26 
 
 		 1015 aa  553  1e-156  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2173  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.38 
 
 		 803 aa  554  1e-156  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.309024  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4085  formate dehydrogenase alpha subunit  40.24 
 
 		 804 aa  553  1e-156  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1700  formate dehydrogenase, nitrate inducible, alpha subunit, selenocysteine-containing  39.26 
 
 		 1015 aa  553  1e-156  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.3444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0097  formate dehydrogenase alpha subunit  39.59 
 
 		 794 aa  554  1e-156  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2183  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.26 
 
 		 1015 aa  552  1e-156  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.668487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1557  formate dehydrogenase, nitrate inducible, alpha subunit, selenocysteine-containing  39.26 
 
 		 1015 aa  553  1e-156  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.468579  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2591  Formate dehydrogenase  38.9 
 
 		 780 aa  552  1e-156  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0101  selenium-containing formate dehydrogenase, nitrate inducible, alpha subunit  39.69 
 
 		 1004 aa  551  1e-155  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3045  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.9 
 
 		 1015 aa  551  1e-155  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2863  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.52 
 
 		 824 aa  551  1e-155  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.202456  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0104  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.28 
 
 		 1004 aa  550  1e-155  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0099  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  39.4 
 
 		 1004 aa  551  1e-155  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03810  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.43 
 
 		 1018 aa  549  1e-155  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1655  formate dehydrogenase, nitrate inducible, alpha subunit, selenocysteine-containing  39.14 
 
 		 803 aa  550  1e-155  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0872  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.03 
 
 		 1096 aa  550  1e-155  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0021  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.35 
 
 		 1084 aa  551  1e-155  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.12847 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21840  uncharacterized anaerobic dehydrogenase  39.1 
 
 		 835 aa  551  1e-155  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0800968 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0105  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.28 
 
 		 794 aa  549  1e-155  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1217  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.78 
 
 		 1008 aa  551  1e-155  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0663541 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0717  formate dehydrogenase, alpha subunit, anaerobic  39.69 
 
 		 798 aa  548  1e-154  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0876  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.8 
 
 		 1096 aa  548  1e-154  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03779  formate dehydrogenase-O, major subunit  39.16 
 
 		 1016 aa  544  1e-153  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0084  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.21 
 
 		 803 aa  545  1e-153  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4280  formate dehydrogenase-O, major subunit, selenocysteine-containing  39.16 
 
 		 1016 aa  543  1e-153  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3325  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.88 
 
 		 1023 aa  544  1e-153  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.723924 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4123  molybdopterin oxidoreductase alpha subunit  39.16 
 
 		 1016 aa  544  1e-153  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2054  formate dehydrogenase alpha subunit  39.62 
 
 		 803 aa  545  1e-153  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0799  formate dehydrogenase  38.73 
 
 		 851 aa  544  1e-153  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4122  formate dehydrogenase-O, major subunit, selenocysteine-containing  39.16 
 
 		 1016 aa  544  1e-153  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1286  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.55 
 
 		 1015 aa  545  1e-153  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2365  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.5 
 
 		 1005 aa  543  1e-153  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.1698 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4090  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.16 
 
 		 1016 aa  541  9.999999999999999e-153  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19190  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.67 
 
 		 1100 aa  541  9.999999999999999e-153  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.525812  normal  0.681395 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4119  aerobic formate dehydrogenase subunit alpha  39.09 
 
 		 1015 aa  541  9.999999999999999e-153  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2724  formate dehydrogenase  38.32 
 
 		 847 aa  541  9.999999999999999e-153  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.820534  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0038  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.09 
 
 		 803 aa  540  9.999999999999999e-153  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2181  molydopterin dinucleotide-binding region  38.45 
 
 		 862 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3770  formate dehydrogenase, alpha subunit, selenocysteine-containing  39.09 
 
 		 1015 aa  541  9.999999999999999e-153  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2089  formate dehydrogenase alpha subunit  38.89 
 
 		 1005 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000081067 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0813  formate dehydrogenase alpha subunit  39.4 
 
 		 1014 aa  538  1e-151  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0707  formate dehydrogenase, alpha subunit, selenocysteine-containing  39.31 
 
 		 1023 aa  536  1e-151  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0438  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.43 
 
 		 796 aa  537  1e-151  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1334  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.45 
 
 		 840 aa  538  1e-151  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2829  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.58 
 
 		 820 aa  538  1e-151  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.500302  normal  0.743867 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0730  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.19 
 
 		 822 aa  535  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2396  formate dehydrogenase-O, major subunit, selenocysteine-containing  39.19 
 
 		 822 aa  535  1e-150  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2259  formate dehydrogenase-O, major subunit, selenocysteine-containing  39.19 
 
 		 1023 aa  535  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181302  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11280  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.15 
 
 		 1058 aa  535  1e-150  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.786 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1210  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.29 
 
 		 1066 aa  531  1e-149  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09600  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  37.38 
 
 		 889 aa  529  1e-149  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1427  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.74 
 
 		 1016 aa  531  1e-149  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.50627  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0824  formate dehydrogenase  38.29 
 
 		 864 aa  532  1e-149  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.334882  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5531  formate dehydrogenase subunit alpha  39.4 
 
 		 825 aa  526  1e-148  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63605  formate dehydrogenase-O, major subunit  39.4 
 
 		 1026 aa  526  1e-148  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0662  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.42 
 
 		 812 aa  528  1e-148  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.457174  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2662  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.42 
 
 		 1015 aa  527  1e-148  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.613089  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4597  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.86 
 
 		 810 aa  522  1e-147  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.654701  normal  0.94372 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1682  molydopterin dinucleotide-binding region  38.85 
 
 		 829 aa  525  1e-147  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.373792 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2553  formate dehydrogenase alpha subunit  37.71 
 
 		 821 aa  522  1e-147  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1750  formate dehydrogenase alpha subunit  38.35 
 
 		 1016 aa  523  1e-147  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00182445 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6560  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.5 
 
 		 809 aa  524  1e-147  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22445  normal  0.0150185 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5220  formate dehydrogenase  37.81 
 
 		 865 aa  519  1e-146  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0523  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.14 
 
 		 821 aa  520  1e-146  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>