More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_2088 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0777  formate dehydrogenase, major subunit, selenocysteine-containing  44.14 
 
 		 1010 aa  663    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4271  formate dehydrogenase, alpha subunit  52.14 
 
 		 1016 aa  852    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.12828  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2267  formate dehydrogenase, alpha subunit  43 
 
 		 802 aa  646    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1059  formate dehydrogenase alpha subunit  43.05 
 
 		 1010 aa  653    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.080154 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1955  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.87 
 
 		 1009 aa  648    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2088  formate dehydrogenase  100 
 
 		 812 aa  1682    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.207847  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3043  formate dehydrogenase  79.19 
 
 		 812 aa  1354    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0454  formate dehydrogenase  65.36 
 
 		 816 aa  1111    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0891729  normal  0.433565 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1825  formate dehydrogenase  50.43 
 
 		 808 aa  837    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1868  formate dehydrogenase, alpha subunit  98.03 
 
 		 1020 aa  1657    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1789  formate dehydrogenase, alpha subunit  98.15 
 
 		 1020 aa  1659    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3388  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.43 
 
 		 1010 aa  647    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0643  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.27 
 
 		 1012 aa  632  1e-179  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0165738 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2638  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.31 
 
 		 1059 aa  627  1e-178  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.409853 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0283  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.68 
 
 		 803 aa  622  1e-176  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.105016  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1575  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.54 
 
 		 842 aa  620  1e-176  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0036  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.01 
 
 		 804 aa  620  1e-176  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0129417  normal  0.222699 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3894  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.55 
 
 		 1028 aa  609  1e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1570  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.49 
 
 		 1014 aa  610  1e-173  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3810  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.43 
 
 		 1028 aa  606  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3510  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.94 
 
 		 1015 aa  608  9.999999999999999e-173  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.722583  normal  0.530799 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3374  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.2 
 
 		 1061 aa  602  1.0000000000000001e-171  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3754  formate dehydrogenase alpha subunit  41.89 
 
 		 828 aa  602  1e-170  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1274  formate dehydrogenase, alpha subunit  41 
 
 		 816 aa  600  1e-170  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0501  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.52 
 
 		 1012 aa  598  1e-169  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.662776 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2008  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.05 
 
 		 824 aa  589  1e-167  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.715291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1580  formate dehydrogenase  40.88 
 
 		 808 aa  583  1.0000000000000001e-165  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0799  formate dehydrogenase  39.63 
 
 		 851 aa  585  1.0000000000000001e-165  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3513  formate dehydrogenase alpha subunit  40 
 
 		 808 aa  580  1e-164  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2863  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.97 
 
 		 824 aa  579  1e-164  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.202456  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0646  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.33 
 
 		 1013 aa  576  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.166325 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01432  formate dehydrogenase-N, alpha subunit, nitrate-inducible  38.87 
 
 		 1015 aa  570  1e-161  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2173  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.99 
 
 		 803 aa  571  1e-161  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.309024  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2183  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.87 
 
 		 1015 aa  569  1e-161  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.668487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1700  formate dehydrogenase, nitrate inducible, alpha subunit, selenocysteine-containing  38.87 
 
 		 1015 aa  569  1e-161  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.3444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2054  formate dehydrogenase alpha subunit  39.47 
 
 		 803 aa  571  1e-161  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0226  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.01 
 
 		 1005 aa  568  1e-160  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.174026  normal  0.0776388 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1557  formate dehydrogenase, nitrate inducible, alpha subunit, selenocysteine-containing  38.87 
 
 		 1015 aa  568  1e-160  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.468579  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03810  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.36 
 
 		 1018 aa  566  1e-160  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1655  formate dehydrogenase, nitrate inducible, alpha subunit, selenocysteine-containing  38.87 
 
 		 803 aa  567  1e-160  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4085  formate dehydrogenase alpha subunit  39.47 
 
 		 804 aa  567  1e-160  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1114  formate dehydrogenase  39.36 
 
 		 811 aa  566  1e-160  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0084  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.33 
 
 		 803 aa  568  1e-160  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03779  formate dehydrogenase-O, major subunit  39.38 
 
 		 1016 aa  564  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4090  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.38 
 
 		 1016 aa  562  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4280  formate dehydrogenase-O, major subunit, selenocysteine-containing  39.26 
 
 		 1016 aa  563  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4119  aerobic formate dehydrogenase subunit alpha  39.33 
 
 		 1015 aa  562  1.0000000000000001e-159  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4123  molybdopterin oxidoreductase alpha subunit  39.38 
 
 		 1016 aa  564  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4122  formate dehydrogenase-O, major subunit, selenocysteine-containing  39.38 
 
 		 1016 aa  564  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3770  formate dehydrogenase, alpha subunit, selenocysteine-containing  39.33 
 
 		 1015 aa  562  1.0000000000000001e-159  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0038  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.33 
 
 		 803 aa  562  1.0000000000000001e-159  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3325  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.64 
 
 		 1023 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.723924 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0761  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.04 
 
 		 1003 aa  563  1.0000000000000001e-159  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.109779  normal  0.059567 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1210  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.78 
 
 		 1066 aa  561  1e-158  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0717  formate dehydrogenase, alpha subunit, anaerobic  39.54 
 
 		 798 aa  556  1e-157  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1427  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.64 
 
 		 1016 aa  556  1e-157  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.50627  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0971  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.57 
 
 		 1011 aa  556  1e-157  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.893461  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2591  Formate dehydrogenase  37.85 
 
 		 780 aa  557  1e-157  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0555  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.12 
 
 		 1012 aa  557  1e-157  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0813  formate dehydrogenase alpha subunit  38.27 
 
 		 1014 aa  554  1e-156  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0707  formate dehydrogenase, alpha subunit, selenocysteine-containing  38.67 
 
 		 1023 aa  552  1e-156  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2519  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.64 
 
 		 1016 aa  553  1e-156  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2396  formate dehydrogenase-O, major subunit, selenocysteine-containing  38.12 
 
 		 822 aa  550  1e-155  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0730  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.12 
 
 		 822 aa  550  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3490  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.11 
 
 		 808 aa  550  1e-155  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.657613  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1286  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.14 
 
 		 1015 aa  549  1e-155  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21840  uncharacterized anaerobic dehydrogenase  37.78 
 
 		 835 aa  550  1e-155  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0800968 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6560  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.26 
 
 		 809 aa  551  1e-155  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22445  normal  0.0150185 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3045  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.03 
 
 		 1015 aa  551  1e-155  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2259  formate dehydrogenase-O, major subunit, selenocysteine-containing  38.12 
 
 		 1023 aa  551  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181302  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2089  formate dehydrogenase alpha subunit  38.27 
 
 		 1005 aa  550  1e-155  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000081067 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0662  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.51 
 
 		 812 aa  550  1e-155  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.457174  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0101  selenium-containing formate dehydrogenase, nitrate inducible, alpha subunit  39.83 
 
 		 1004 aa  546  1e-154  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1334  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.32 
 
 		 840 aa  548  1e-154  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2553  formate dehydrogenase alpha subunit  38.14 
 
 		 821 aa  548  1e-154  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1217  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.04 
 
 		 1008 aa  547  1e-154  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0663541 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0438  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.07 
 
 		 796 aa  548  1e-154  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1750  formate dehydrogenase alpha subunit  39.09 
 
 		 1016 aa  545  1e-153  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00182445 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0102  formate dehydrogenase alpha subunit  39.83 
 
 		 794 aa  543  1e-153  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0097  formate dehydrogenase alpha subunit  39.71 
 
 		 794 aa  543  1e-153  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2829  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.99 
 
 		 820 aa  542  1e-153  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.500302  normal  0.743867 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1818  formate dehydrogenase alpha subunit  38.39 
 
 		 820 aa  540  9.999999999999999e-153  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.266188 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0105  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.83 
 
 		 794 aa  538  1e-151  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2100  formate dehydrogenase alpha subunit  37.25 
 
 		 822 aa  538  1e-151  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2662  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.86 
 
 		 1015 aa  538  1e-151  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.613089  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4597  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.56 
 
 		 810 aa  536  1e-151  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.654701  normal  0.94372 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0099  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  38.71 
 
 		 1004 aa  536  1e-151  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4518  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.65 
 
 		 810 aa  538  1e-151  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.101955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3377  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.44 
 
 		 822 aa  536  1e-151  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.365346  normal  0.791414 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2533  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.5 
 
 		 1010 aa  538  1e-151  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0104  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.71 
 
 		 1004 aa  536  1e-151  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2365  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.16 
 
 		 1005 aa  537  1e-151  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.1698 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0872  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.3 
 
 		 1096 aa  533  1e-150  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3879  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.32 
 
 		 810 aa  535  1e-150  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.319379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4382  formate dehydrogenase, alpha subunit, anaerobic  37.77 
 
 		 822 aa  535  1e-150  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3544  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.65 
 
 		 810 aa  534  1e-150  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3984  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.77 
 
 		 822 aa  535  1e-150  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2724  formate dehydrogenase  38.13 
 
 		 847 aa  531  1e-149  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.820534  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0544  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.96 
 
 		 809 aa  531  1e-149  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0932731 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1335  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.74 
 
 		 1015 aa  527  1e-148  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>