More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1741 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011083  SeHA_C1517  tetrathionate reductase complex subunit A  47.21 
 
 		 1020 aa  924    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000108438 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2089  orotate phosphoribosyltransferase (oprt; oprtase)  40.32 
 
 		 996 aa  712    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0216873  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3679  molydopterin dinucleotide-binding region  46.58 
 
 		 1035 aa  939    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1741  putative tetrathionate reductase, subunit A  100 
 
 		 1038 aa  2118    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.189937 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4785  molydopterin dinucleotide-binding region  39.4 
 
 		 1031 aa  726    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1799  molydopterin dinucleotide-binding region  43.2 
 
 		 1011 aa  737    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1959  molydopterin dinucleotide domain-containing protein  47.01 
 
 		 1020 aa  921    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000210512 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1496  tetrathionate reductase complex, subunit A  47.11 
 
 		 1020 aa  924    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000946391 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1480  tetrathionate reductase complex subunit A  47.11 
 
 		 1020 aa  922    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.263704 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0897  tetrathionate reductase, subunit A  45.92 
 
 		 1029 aa  954    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0797102  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0633  molydopterin dinucleotide-binding region  47.56 
 
 		 1035 aa  937    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0100143 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3736  molydopterin dinucleotide-binding region  46.14 
 
 		 1035 aa  939    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4246  molydopterin dinucleotide-binding region  51.1 
 
 		 1066 aa  983    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146983 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3862  molydopterin dinucleotide-binding region  46.29 
 
 		 1035 aa  937    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0633  molydopterin dinucleotide-binding region  47.46 
 
 		 1035 aa  950    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0126499 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1788  tetrathionate reductase complex, subunit A  47.01 
 
 		 1020 aa  922    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1423  molydopterin dinucleotide-binding region  49.75 
 
 		 1064 aa  971    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.658184  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1069  molydopterin dinucleotide-binding region  49.21 
 
 		 1027 aa  951    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345727 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003032  tetrathionate reductase subunit A  46.72 
 
 		 1030 aa  968    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2424  molydopterin dinucleotide-binding region  49.75 
 
 		 1064 aa  971    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.375347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0589  molydopterin dinucleotide-binding region  46.09 
 
 		 1036 aa  933    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0917  molybdopterin oxidoreductase  42.33 
 
 		 1022 aa  815    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.2527  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0662  molybdopterin oxidoreductase  46.04 
 
 		 1035 aa  929    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3982  molydopterin dinucleotide-binding region  35.74 
 
 		 1026 aa  619  1e-176  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3243  molydopterin dinucleotide-binding region  36.09 
 
 		 1024 aa  618  1e-175  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0245  molydopterin dinucleotide-binding region  34.11 
 
 		 1012 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4208  molydopterin dinucleotide-binding region  34.36 
 
 		 1012 aa  552  1e-155  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02584  hypothetical protein  31.11 
 
 		 992 aa  456  1.0000000000000001e-126  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3665  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  32.94 
 
 		 1084 aa  452  1e-125  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.120548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0267  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  30.83 
 
 		 1070 aa  444  1e-123  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_111  molybdopterin oxidoreductase, large chain  31.07 
 
 		 1070 aa  440  9.999999999999999e-123  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0101  molybdopterin oxidoreductase  30.46 
 
 		 1033 aa  437  1e-121  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1197  molybdopterin oxidoreductase  31.98 
 
 		 934 aa  421  1e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0477  molybdopterin oxidoreductase  30.5 
 
 		 1074 aa  419  9.999999999999999e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0452  molydopterin dinucleotide-binding region  32.49 
 
 		 1087 aa  382  1e-104  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0389  molydopterin dinucleotide-binding region  28.68 
 
 		 1173 aa  326  1e-87  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0340  putative molybdopterin oxidoreductase family protein  25.14 
 
 		 969 aa  155  2.9999999999999998e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1936  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  26.32 
 
 		 973 aa  155  2.9999999999999998e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1801  molybdopterin oxidoreductase  27 
 
 		 961 aa  151  6e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.356497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1238  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  25.89 
 
 		 928 aa  149  3e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.389489  normal  0.0809066 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3221  molybdopterin oxidoreductase  26.55 
 
 		 973 aa  148  6e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.461579  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2047  molybdopterin oxidoreductase family protein  26.45 
 
 		 978 aa  147  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1445  molybdopterin oxidoreductase family protein  26.45 
 
 		 978 aa  147  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1071  molybdopterin oxidoreductase family protein  26.45 
 
 		 973 aa  147  1e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3106  molybdopterin oxidoreductase  26.45 
 
 		 973 aa  147  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1356  molybdopterin oxidoreductase family protein  26.45 
 
 		 973 aa  146  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2338  molybdopterin oxidoreductase  26.45 
 
 		 973 aa  146  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.941239  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2001  molybdopterin oxidoreductase  25.21 
 
 		 978 aa  144  8e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.754637  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6214  molybdopterin oxidoreductase  23.72 
 
 		 978 aa  142  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.492261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4524  molybdopterin oxidoreductase  25.31 
 
 		 978 aa  140  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.556057 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0144  Nitrate reductase  25.45 
 
 		 968 aa  140  2e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.20864 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0059  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  24.69 
 
 		 953 aa  139  3.0000000000000003e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1675  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  24.97 
 
 		 974 aa  137  9.999999999999999e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1121  molybdopterin oxidoreductase  25.95 
 
 		 812 aa  137  9.999999999999999e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.721348  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0767  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  25 
 
 		 923 aa  135  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3815  molybdopterin oxidoreductase  23.88 
 
 		 981 aa  135  3.9999999999999996e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336583  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0570  DMSO reductase chain A  26.2 
 
 		 958 aa  135  6e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.345051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0938  molybdopterin oxidoreductase  25.59 
 
 		 817 aa  134  6.999999999999999e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0255421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1560  molybdopterin oxidoreductase  22.77 
 
 		 917 aa  134  1.0000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.444202 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1443  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 protein  25.41 
 
 		 932 aa  133  2.0000000000000002e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1743  molybdopterin oxidoreductase  25.52 
 
 		 974 aa  133  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.216268  normal  0.286341 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1500  molybdopterin oxidoreductase  27.4 
 
 		 856 aa  132  3e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000790574 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4940  molybdopterin oxidoreductase  24.97 
 
 		 974 aa  131  6e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.335021 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2646  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  23.79 
 
 		 935 aa  129  2.0000000000000002e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0950035  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0860  molybdopterin oxidoreductase family protein  24.14 
 
 		 981 aa  129  4.0000000000000003e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3996  molybdopterin oxidoreductase  23.91 
 
 		 979 aa  126  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.290267  normal  0.0213209 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22240  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  24.91 
 
 		 836 aa  105  4e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.17201 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0027  molybdenum enzyme related to thiosulfate reductase and polysulfide reductase, large subunit  26.49 
 
 		 955 aa  102  5e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0352248  normal  0.101653 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17920  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  23.02 
 
 		 826 aa  99.8  3e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.194946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0056  molydopterin dinucleotide-binding region  26 
 
 		 951 aa  98.2  8e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0035  molydopterin dinucleotide-binding region  25.83 
 
 		 953 aa  95.5  4e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.813982  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0353  molybdopterin oxidoreductase  25.14 
 
 		 805 aa  95.5  5e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.127927 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1964  molybdenum enzyme related to thiosulfate reductase and polysulfide reductase, large subunit  25.17 
 
 		 952 aa  95.1  6e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.664709  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2227  molybdopterin oxidoreductase  26.76 
 
 		 891 aa  94.7  8e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.178988  hitchhiker  0.00000402166 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2768  molydopterin dinucleotide-binding region  23.68 
 
 		 898 aa  92.4  3e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.81742  normal  0.229258 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3094  molybdopterin oxidoreductase  21.44 
 
 		 858 aa  92.4  4e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.799457  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4227  molybdopterin oxidoreductase  23.51 
 
 		 817 aa  92  5e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0120  formate dehydrogenase  24.83 
 
 		 953 aa  91.7  7e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0162  molybdopterin oxidoreductase  25.09 
 
 		 805 aa  91.7  7e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0607  molydopterin dinucleotide-binding region  24.32 
 
 		 910 aa  91.7  7e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.408169 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0643  molybdopterin oxidoreductase  20.25 
 
 		 866 aa  90.5  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3188  molybdopterin oxidoreductase  25.88 
 
 		 756 aa  90.1  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4231  molybdopterin oxidoreductase  23.63 
 
 		 818 aa  88.6  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1612  molydopterin dinucleotide-binding region  23.86 
 
 		 967 aa  87.8  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2385  molybdopterin oxidoreductase  23.69 
 
 		 839 aa  87  0.000000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0793925 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1810  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  27.08 
 
 		 730 aa  86.7  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1020  molydopterin dinucleotide-binding region  21.75 
 
 		 977 aa  86.3  0.000000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.961186  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0450  formate dehydrogenase  26.43 
 
 		 722 aa  85.5  0.000000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1890  molybdopterin oxidoreductase  28.3 
 
 		 726 aa  85.1  0.000000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2605  twin-arginine translocation pathway signal  26.83 
 
 		 879 aa  83.2  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.746738 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3287  molybdopterin oxidoreductase  22.3 
 
 		 781 aa  83.2  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.239512  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1484  Nitrate reductase  26.55 
 
 		 739 aa  82.8  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1181  molybdopterin oxidoreductase  21.04 
 
 		 1073 aa  82  0.00000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2934  formate dehydrogenase  23.15 
 
 		 953 aa  81.6  0.00000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0511  molydopterin dinucleotide-binding region  23.27 
 
 		 994 aa  80.9  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0709241  normal  0.262694 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0935  molybdopterin oxidoreductase  22.16 
 
 		 745 aa  80.5  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2922  molybdopterin oxidoreductase  22.49 
 
 		 777 aa  79.3  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.811962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2453  molybdopterin oxidoreductase  23.17 
 
 		 909 aa  79.7  0.0000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.154365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0447  molybdopterin oxidoreductase  25.33 
 
 		 731 aa  79.3  0.0000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4110  molybdopterin oxidoreductase  28.9 
 
 		 744 aa  79.3  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.220187  normal  0.43512 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>