More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4246 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1423  molydopterin dinucleotide-binding region  69.75 
 
 		 1064 aa  1464    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.658184  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1741  putative tetrathionate reductase, subunit A  49.48 
 
 		 1038 aa  998    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.189937 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1496  tetrathionate reductase complex, subunit A  49.86 
 
 		 1020 aa  1001    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000946391 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1788  tetrathionate reductase complex, subunit A  49.86 
 
 		 1020 aa  1001    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1799  molydopterin dinucleotide-binding region  41.25 
 
 		 1011 aa  661    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003032  tetrathionate reductase subunit A  47.8 
 
 		 1030 aa  1019    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0897  tetrathionate reductase, subunit A  44.79 
 
 		 1029 aa  971    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0797102  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0633  molydopterin dinucleotide-binding region  49.48 
 
 		 1035 aa  1004    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0100143 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1069  molydopterin dinucleotide-binding region  51.9 
 
 		 1027 aa  1021    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345727 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1517  tetrathionate reductase complex subunit A  49.95 
 
 		 1020 aa  1003    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000108438 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0633  molydopterin dinucleotide-binding region  49.29 
 
 		 1035 aa  1011    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0126499 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4246  molydopterin dinucleotide-binding region  100 
 
 		 1066 aa  2169    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146983 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2089  orotate phosphoribosyltransferase (oprt; oprtase)  40.82 
 
 		 996 aa  719    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0216873  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1480  tetrathionate reductase complex subunit A  49.95 
 
 		 1020 aa  1002    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.263704 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1959  molydopterin dinucleotide domain-containing protein  49.67 
 
 		 1020 aa  999    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000210512 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2424  molydopterin dinucleotide-binding region  69.84 
 
 		 1064 aa  1470    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.375347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0589  molydopterin dinucleotide-binding region  49.14 
 
 		 1036 aa  1015    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3862  molydopterin dinucleotide-binding region  49.43 
 
 		 1035 aa  1018    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3736  molydopterin dinucleotide-binding region  49.33 
 
 		 1035 aa  1017    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0917  molybdopterin oxidoreductase  37.75 
 
 		 1022 aa  744    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.2527  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0662  molybdopterin oxidoreductase  49.29 
 
 		 1035 aa  1012    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3679  molydopterin dinucleotide-binding region  49.52 
 
 		 1035 aa  1016    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4785  molydopterin dinucleotide-binding region  35.29 
 
 		 1031 aa  633  1e-180  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3982  molydopterin dinucleotide-binding region  34.06 
 
 		 1026 aa  602  1e-170  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3243  molydopterin dinucleotide-binding region  35.26 
 
 		 1024 aa  602  1e-170  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4208  molydopterin dinucleotide-binding region  34.19 
 
 		 1012 aa  568  1e-160  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0245  molydopterin dinucleotide-binding region  34.99 
 
 		 1012 aa  567  1e-160  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02584  hypothetical protein  29.2 
 
 		 992 aa  453  1.0000000000000001e-126  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1197  molybdopterin oxidoreductase  30.54 
 
 		 934 aa  427  1e-118  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3665  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  31.79 
 
 		 1084 aa  414  1e-114  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.120548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0267  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  29.59 
 
 		 1070 aa  373  1e-102  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0101  molybdopterin oxidoreductase  29.21 
 
 		 1033 aa  367  1e-100  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_111  molybdopterin oxidoreductase, large chain  29.46 
 
 		 1070 aa  363  1e-98  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0477  molybdopterin oxidoreductase  29.3 
 
 		 1074 aa  355  2.9999999999999997e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0452  molydopterin dinucleotide-binding region  31.1 
 
 		 1087 aa  353  8e-96  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0389  molydopterin dinucleotide-binding region  26.6 
 
 		 1173 aa  318  4e-85  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2646  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  24.95 
 
 		 935 aa  158  4e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0950035  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0767  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  24.79 
 
 		 923 aa  157  9e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1238  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  23.68 
 
 		 928 aa  156  2e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.389489  normal  0.0809066 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0340  putative molybdopterin oxidoreductase family protein  22.17 
 
 		 969 aa  141  6e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0059  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  22.38 
 
 		 953 aa  140  8.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1443  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 protein  22.89 
 
 		 932 aa  136  1.9999999999999998e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1675  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  22.04 
 
 		 974 aa  135  3.9999999999999996e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0860  molybdopterin oxidoreductase family protein  22.5 
 
 		 981 aa  134  7.999999999999999e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3996  molybdopterin oxidoreductase  23.07 
 
 		 979 aa  132  4.0000000000000003e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.290267  normal  0.0213209 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4524  molybdopterin oxidoreductase  23.22 
 
 		 978 aa  130  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.556057 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0570  DMSO reductase chain A  23.36 
 
 		 958 aa  129  3e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.345051  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3815  molybdopterin oxidoreductase  22.79 
 
 		 981 aa  129  4.0000000000000003e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336583  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0144  Nitrate reductase  22.21 
 
 		 968 aa  126  2e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.20864 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2001  molybdopterin oxidoreductase  22.91 
 
 		 978 aa  126  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.754637  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6214  molybdopterin oxidoreductase  22.11 
 
 		 978 aa  125  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.492261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4940  molybdopterin oxidoreductase  22.86 
 
 		 974 aa  122  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.335021 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1071  molybdopterin oxidoreductase family protein  23.08 
 
 		 973 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1936  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  22.37 
 
 		 973 aa  120  1.9999999999999998e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3221  molybdopterin oxidoreductase  23.08 
 
 		 973 aa  120  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.461579  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1445  molybdopterin oxidoreductase family protein  23.08 
 
 		 978 aa  119  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1356  molybdopterin oxidoreductase family protein  23.08 
 
 		 973 aa  119  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3106  molybdopterin oxidoreductase  23.08 
 
 		 973 aa  119  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2338  molybdopterin oxidoreductase  23.08 
 
 		 973 aa  119  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.941239  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2047  molybdopterin oxidoreductase family protein  23.08 
 
 		 978 aa  119  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1743  molybdopterin oxidoreductase  23.8 
 
 		 974 aa  118  6e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.216268  normal  0.286341 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1801  molybdopterin oxidoreductase  22.76 
 
 		 961 aa  118  7.999999999999999e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.356497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1500  molybdopterin oxidoreductase  26.13 
 
 		 856 aa  108  6e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000790574 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1121  molybdopterin oxidoreductase  25 
 
 		 812 aa  102  5e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.721348  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1560  molybdopterin oxidoreductase  21.74 
 
 		 917 aa  99.4  3e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.444202 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05080  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  22.71 
 
 		 857 aa  95.5  4e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0938  molybdopterin oxidoreductase  24.35 
 
 		 817 aa  95.9  4e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0255421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0056  molydopterin dinucleotide-binding region  24.59 
 
 		 951 aa  92.8  3e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1567  molybdopterin oxidoreductase  24.52 
 
 		 803 aa  92  5e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1964  molybdenum enzyme related to thiosulfate reductase and polysulfide reductase, large subunit  22.58 
 
 		 952 aa  91.7  8e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.664709  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1612  molydopterin dinucleotide-binding region  24.8 
 
 		 967 aa  90.9  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0027  molybdenum enzyme related to thiosulfate reductase and polysulfide reductase, large subunit  23.49 
 
 		 955 aa  90.1  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0352248  normal  0.101653 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0387  molybdopterin oxidoreductase  26.42 
 
 		 879 aa  89.7  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3188  molybdopterin oxidoreductase  27.66 
 
 		 756 aa  89.7  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2338  molybdopterin oxidoreductase  25.25 
 
 		 729 aa  88.2  8e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2605  twin-arginine translocation pathway signal  25.66 
 
 		 879 aa  87.4  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.746738 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1810  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  28.53 
 
 		 730 aa  87.8  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0120  formate dehydrogenase  23.43 
 
 		 953 aa  86.7  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2173  nitrate reductase  24.53 
 
 		 1016 aa  86.7  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000388509 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0035  molydopterin dinucleotide-binding region  23.43 
 
 		 953 aa  86.7  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.813982  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0935  molybdopterin oxidoreductase  26.21 
 
 		 745 aa  85.9  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1597  molybdopterin oxidoreductase  21.1 
 
 		 800 aa  85.5  0.000000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1793  formate dehydrogenase  24.07 
 
 		 1014 aa  84  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.546724  normal  0.0478269 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0450  formate dehydrogenase  25.81 
 
 		 722 aa  83.2  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3444  twin-arginine translocation pathway signal  23.83 
 
 		 764 aa  81.3  0.00000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3619  molybdopterin oxidoreductase  23.83 
 
 		 764 aa  81.3  0.00000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1443  molybdopterin oxidoreductase  26.11 
 
 		 729 aa  80.9  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2777  nitrate reductase  28.29 
 
 		 731 aa  81.3  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0507  twin-arginine translocation pathway signal  23.83 
 
 		 764 aa  81.3  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0559  molybdopterin oxidoreductase  24 
 
 		 760 aa  81.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2242  thiosulfate reductase  24.76 
 
 		 758 aa  79.7  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.1266  normal  0.627013 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0531  molybdopterin oxidoreductase  23.67 
 
 		 764 aa  79.3  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0555  molybdopterin oxidoreductase  23.67 
 
 		 764 aa  79.7  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2288  thiosulfate reductase  24.76 
 
 		 758 aa  79.7  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00880607  normal  0.0980362 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2188  thiosulfate reductase  24.76 
 
 		 758 aa  79.7  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2401  thiosulfate reductase  24.76 
 
 		 758 aa  79.7  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  0.834836 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0607  molydopterin dinucleotide-binding region  23.12 
 
 		 910 aa  79  0.0000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.408169 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4062  polysulfide reductase, subunit A  24.16 
 
 		 760 aa  79  0.0000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2235  thiosulfate reductase  24.45 
 
 		 758 aa  78.6  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.209797  normal  0.286987 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4810  molybdopterin dinucleotide-binding region  26.48 
 
 		 739 aa  78.6  0.0000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>