More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3243 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3982  molydopterin dinucleotide-binding region  82.07 
 
 		 1026 aa  1788    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0633  molydopterin dinucleotide-binding region  36.5 
 
 		 1035 aa  635    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0126499 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0245  molydopterin dinucleotide-binding region  38.25 
 
 		 1012 aa  708    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3243  molydopterin dinucleotide-binding region  100 
 
 		 1024 aa  2138    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4208  molydopterin dinucleotide-binding region  38.97 
 
 		 1012 aa  720    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0633  molydopterin dinucleotide-binding region  36.79 
 
 		 1035 aa  633  1e-180  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0100143 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0897  tetrathionate reductase, subunit A  36.06 
 
 		 1029 aa  630  1e-179  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0797102  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3862  molydopterin dinucleotide-binding region  36.91 
 
 		 1035 aa  631  1e-179  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3679  molydopterin dinucleotide-binding region  36.61 
 
 		 1035 aa  627  1e-178  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0662  molybdopterin oxidoreductase  36.66 
 
 		 1035 aa  627  1e-178  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003032  tetrathionate reductase subunit A  35.11 
 
 		 1030 aa  625  1e-177  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3736  molydopterin dinucleotide-binding region  36.41 
 
 		 1035 aa  625  1e-177  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0589  molydopterin dinucleotide-binding region  36.27 
 
 		 1036 aa  616  1e-175  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1741  putative tetrathionate reductase, subunit A  36.19 
 
 		 1038 aa  615  9.999999999999999e-175  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.189937 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1069  molydopterin dinucleotide-binding region  36.14 
 
 		 1027 aa  609  1e-173  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345727 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2424  molydopterin dinucleotide-binding region  36.29 
 
 		 1064 aa  609  1e-173  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.375347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1423  molydopterin dinucleotide-binding region  36.39 
 
 		 1064 aa  611  1e-173  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.658184  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1517  tetrathionate reductase complex subunit A  35.04 
 
 		 1020 aa  600  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000108438 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4246  molydopterin dinucleotide-binding region  35.23 
 
 		 1066 aa  602  1e-170  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146983 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1480  tetrathionate reductase complex subunit A  34.94 
 
 		 1020 aa  599  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.263704 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1788  tetrathionate reductase complex, subunit A  34.94 
 
 		 1020 aa  599  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1496  tetrathionate reductase complex, subunit A  34.85 
 
 		 1020 aa  598  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000946391 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1959  molydopterin dinucleotide domain-containing protein  34.65 
 
 		 1020 aa  594  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000210512 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0917  molybdopterin oxidoreductase  34.9 
 
 		 1022 aa  584  1.0000000000000001e-165  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.2527  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2089  orotate phosphoribosyltransferase (oprt; oprtase)  34.21 
 
 		 996 aa  553  1e-156  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0216873  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4785  molydopterin dinucleotide-binding region  31.77 
 
 		 1031 aa  490  1e-137  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1799  molydopterin dinucleotide-binding region  33.1 
 
 		 1011 aa  483  1e-135  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1197  molybdopterin oxidoreductase  29.55 
 
 		 934 aa  372  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02584  hypothetical protein  28.44 
 
 		 992 aa  369  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3665  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  27.6 
 
 		 1084 aa  292  2e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.120548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0477  molybdopterin oxidoreductase  25.82 
 
 		 1074 aa  273  2e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0267  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  26.94 
 
 		 1070 aa  270  1e-70  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0101  molybdopterin oxidoreductase  26.26 
 
 		 1033 aa  266  2e-69  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_111  molybdopterin oxidoreductase, large chain  25.83 
 
 		 1070 aa  255  3e-66  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0389  molydopterin dinucleotide-binding region  24.69 
 
 		 1173 aa  244  7.999999999999999e-63  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0452  molydopterin dinucleotide-binding region  25.62 
 
 		 1087 aa  240  1e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1500  molybdopterin oxidoreductase  25.63 
 
 		 856 aa  124  9.999999999999999e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000790574 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0938  molybdopterin oxidoreductase  24.1 
 
 		 817 aa  111  8.000000000000001e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0255421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1121  molybdopterin oxidoreductase  24.06 
 
 		 812 aa  102  3e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.721348  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0059  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  21.74 
 
 		 953 aa  99.8  3e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0340  putative molybdopterin oxidoreductase family protein  21.56 
 
 		 969 aa  99  4e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1238  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  21.71 
 
 		 928 aa  94  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.389489  normal  0.0809066 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0570  DMSO reductase chain A  22.35 
 
 		 958 aa  92  5e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.345051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0860  molybdopterin oxidoreductase family protein  22.66 
 
 		 981 aa  89  4e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1936  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  23.26 
 
 		 973 aa  82.8  0.00000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11280  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  23.55 
 
 		 864 aa  82.8  0.00000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3815  molybdopterin oxidoreductase  21.82 
 
 		 981 aa  82  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336583  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0027  molybdenum enzyme related to thiosulfate reductase and polysulfide reductase, large subunit  24.51 
 
 		 955 aa  80.9  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0352248  normal  0.101653 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1964  molybdenum enzyme related to thiosulfate reductase and polysulfide reductase, large subunit  24.42 
 
 		 952 aa  80.9  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.664709  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2632  molybdopterin oxidoreductase  25 
 
 		 739 aa  80.9  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.348569  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0056  molydopterin dinucleotide-binding region  19.77 
 
 		 951 aa  79.7  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0269  Nitrate reductase  25.09 
 
 		 754 aa  80.1  0.0000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0120  formate dehydrogenase  22.39 
 
 		 953 aa  79.7  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1071  molybdopterin oxidoreductase family protein  20.76 
 
 		 973 aa  78.2  0.0000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0035  molydopterin dinucleotide-binding region  22.4 
 
 		 953 aa  78.2  0.0000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.813982  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0353  molybdopterin oxidoreductase  25.33 
 
 		 805 aa  77.4  0.000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.127927 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2768  molydopterin dinucleotide-binding region  23.67 
 
 		 898 aa  77.8  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.81742  normal  0.229258 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2718  molybdopterin oxidoreductase  25.32 
 
 		 737 aa  77.4  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4198  molybdopterin oxidoreductase  24.21 
 
 		 1155 aa  77.4  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.320615  normal  0.676689 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1356  molybdopterin oxidoreductase family protein  20.76 
 
 		 973 aa  77.8  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3106  molybdopterin oxidoreductase  20.76 
 
 		 973 aa  77.4  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2338  molybdopterin oxidoreductase  20.76 
 
 		 973 aa  77.8  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.941239  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6214  molybdopterin oxidoreductase  22.05 
 
 		 978 aa  76.6  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.492261  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2047  molybdopterin oxidoreductase family protein  20.76 
 
 		 978 aa  77  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1445  molybdopterin oxidoreductase family protein  20.76 
 
 		 978 aa  77  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3221  molybdopterin oxidoreductase  20.76 
 
 		 973 aa  77  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.461579  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1560  molybdopterin oxidoreductase  21.91 
 
 		 917 aa  76.3  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.444202 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2001  molybdopterin oxidoreductase  20.97 
 
 		 978 aa  75.9  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.754637  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1890  molybdopterin oxidoreductase  28.69 
 
 		 726 aa  76.3  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0162  molybdopterin oxidoreductase  25 
 
 		 805 aa  75.9  0.000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4231  molybdopterin oxidoreductase  24.11 
 
 		 818 aa  74.7  0.000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2646  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  20.4 
 
 		 935 aa  74.7  0.000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0950035  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2813  molybdopterin oxidoreductase  27.31 
 
 		 738 aa  74.3  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4524  molybdopterin oxidoreductase  20.17 
 
 		 978 aa  73.9  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.556057 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0266  molybdopterin oxidoreductase  23.4 
 
 		 1065 aa  73.9  0.00000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3996  molybdopterin oxidoreductase  21.93 
 
 		 979 aa  73.9  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.290267  normal  0.0213209 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0925  molybdopterin oxidoreductase  23.53 
 
 		 1062 aa  73.9  0.00000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0935  molybdopterin oxidoreductase  24.45 
 
 		 745 aa  72.8  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0607  molydopterin dinucleotide-binding region  21.19 
 
 		 910 aa  72.4  0.00000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.408169 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1508  molybdopterin oxidoreductase  24.65 
 
 		 1058 aa  72  0.00000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000115937 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4227  molybdopterin oxidoreductase  22.69 
 
 		 817 aa  70.9  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0619  molybdopterin oxidoreductase  22.88 
 
 		 911 aa  70.9  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1847  molybdopterin oxidoreductase  23.22 
 
 		 1058 aa  70.9  0.0000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.758609 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4940  molybdopterin oxidoreductase  20.77 
 
 		 974 aa  70.1  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.335021 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0450  formate dehydrogenase  28.03 
 
 		 722 aa  70.5  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1743  molybdopterin oxidoreductase  20.33 
 
 		 974 aa  70.1  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.216268  normal  0.286341 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0144  Nitrate reductase  21.94 
 
 		 968 aa  70.1  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.20864 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1675  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  22.36 
 
 		 974 aa  70.5  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0511  molydopterin dinucleotide-binding region  21.55 
 
 		 994 aa  69.7  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0709241  normal  0.262694 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0362  molybdopterin oxidoreductase  25.81 
 
 		 857 aa  69.3  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.196674  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2173  nitrate reductase  21.43 
 
 		 1016 aa  69.3  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000388509 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2227  molybdopterin oxidoreductase  26.32 
 
 		 891 aa  68.9  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.178988  hitchhiker  0.00000402166 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1443  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 protein  21.76 
 
 		 932 aa  68.6  0.0000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0767  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  20.34 
 
 		 923 aa  68.2  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0199  molybdopterin oxidoreductase  20.84 
 
 		 917 aa  67.8  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.273799  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4110  molybdopterin oxidoreductase  25.85 
 
 		 744 aa  67.4  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.220187  normal  0.43512 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1181  molybdopterin oxidoreductase  19.5 
 
 		 1073 aa  67.8  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3188  molybdopterin oxidoreductase  24.79 
 
 		 756 aa  67  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0930  molybdopterin oxidoreductase  26.56 
 
 		 731 aa  67  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.99852  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2922  molybdopterin oxidoreductase  22.25 
 
 		 777 aa  67  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.811962  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>