More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1011 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_2922  molybdopterin oxidoreductase  46.14 
 
 
777 aa  690    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.811962  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1011  molybdopterin oxidoreductase  100 
 
 
787 aa  1626    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0550449 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3471  molybdopterin oxidoreductase  49.61 
 
 
778 aa  782    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1597  molybdopterin oxidoreductase  30.21 
 
 
800 aa  290  8e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02420  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  29.81 
 
 
824 aa  269  1e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11280  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  30.3 
 
 
864 aa  270  1e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0163  molybdopterin oxidoreductase  29.89 
 
 
851 aa  267  5e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1629  molybdopterin oxidoreductase  28.92 
 
 
789 aa  266  8.999999999999999e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22240  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  28.82 
 
 
836 aa  266  1e-69  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.17201 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05080  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  26.18 
 
 
857 aa  246  9.999999999999999e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1869  molybdopterin oxidoreductase  29.6 
 
 
800 aa  246  9.999999999999999e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0325829 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0479  molybdopterin oxidoreductase  28.59 
 
 
784 aa  245  1.9999999999999999e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4227  molybdopterin oxidoreductase  26.66 
 
 
817 aa  244  3.9999999999999997e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1908  molybdopterin oxidoreductase  26.37 
 
 
876 aa  244  7e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2385  molybdopterin oxidoreductase  28.68 
 
 
839 aa  244  7e-63  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0793925 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4231  molybdopterin oxidoreductase  27.36 
 
 
818 aa  241  4e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17920  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  28.45 
 
 
826 aa  239  2e-61  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.194946  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3051  molybdopterin oxidoreductase  28.41 
 
 
822 aa  234  3e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.333722  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0931  molybdopterin oxidoreductase  27.93 
 
 
743 aa  232  2e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.837438 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27670  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  29.17 
 
 
813 aa  231  3e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2563  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  27.9 
 
 
794 aa  230  9e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000909986  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2405  molybdopterin oxidoreductase  27.11 
 
 
804 aa  225  2e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0154144  normal  0.420011 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2849  molybdopterin oxidoreductase  26.96 
 
 
691 aa  226  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0473  putative molybdopterin oxidoreductase  26.52 
 
 
692 aa  221  3e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3106  molybdopterin oxidoreductase  26.98 
 
 
698 aa  221  3e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3416  molybdopterin oxidoreductase  26.75 
 
 
708 aa  221  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.928899  normal  0.530079 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1932  molybdopterin oxidoreductase  26.19 
 
 
726 aa  221  6e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.496239  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2208  molybdopterin oxidoreductase  26.19 
 
 
726 aa  219  1e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881316  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2374  Nitrate reductase  28.18 
 
 
821 aa  218  2.9999999999999998e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.037868  normal  0.51028 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3632  molybdopterin oxidoreductase  26.2 
 
 
691 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2741  molybdopterin oxidoreductase  26.72 
 
 
698 aa  217  7e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0180049  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2597  molybdopterin oxidoreductase  28.39 
 
 
688 aa  216  9.999999999999999e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00221589 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4673  molybdopterin oxidoreductase  27.06 
 
 
690 aa  216  9.999999999999999e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.120803  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0517  molybdopterin oxidoreductase  25.62 
 
 
691 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.180368  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0547  molybdopterin oxidoreductase  27.15 
 
 
732 aa  213  7.999999999999999e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0063  molybdopterin oxidoreductase  25.36 
 
 
691 aa  213  9e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0545  molybdopterin oxidoreductase  25.36 
 
 
691 aa  213  9e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2859  oxidoreductase protein  26.89 
 
 
698 aa  213  1e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0127  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  26.62 
 
 
799 aa  211  4e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5161  molybdopterin oxidoreductase  27.9 
 
 
728 aa  211  4e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.054105 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1612  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  27.09 
 
 
820 aa  211  5e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6804  molybdopterin oxidoreductase  26.7 
 
 
720 aa  208  4e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.981132 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2256  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  26.6 
 
 
816 aa  208  4e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7633  reductase  26.41 
 
 
708 aa  207  5e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0090  molybdopterin oxidoreductase  28.27 
 
 
697 aa  207  9e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0958221 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2056  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  26.8 
 
 
808 aa  205  3e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1613  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit YnfE  26.85 
 
 
808 aa  205  3e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3814  molybdopterin oxidoreductase  26.23 
 
 
712 aa  204  4e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1456  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit A  25.44 
 
 
808 aa  204  5e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1687  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit A  27.4 
 
 
817 aa  204  6e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.914371  normal  0.111557 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2043  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit A  26.68 
 
 
808 aa  204  6e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27730  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  28.16 
 
 
801 aa  204  6e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.953321  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2242  Trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  25.95 
 
 
750 aa  203  8e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.514414  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1633  molybdopterin oxidoreductase  26.38 
 
 
734 aa  203  9.999999999999999e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0286  twin-arginine translocation pathway signal  25.31 
 
 
733 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3264  Nitrate reductase  28.54 
 
 
836 aa  201  3.9999999999999996e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0520925 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0290  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  27.64 
 
 
781 aa  201  3.9999999999999996e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00528785  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1646  molybdopterin oxidoreductase  27.3 
 
 
807 aa  200  7e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.165657  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1229  molybdopterin oxidoreductase  26.65 
 
 
758 aa  200  7.999999999999999e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.634886  normal  0.648552 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1773  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit YnfE  26.45 
 
 
808 aa  200  1.0000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2716  putative anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit A  25.23 
 
 
808 aa  200  1.0000000000000001e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.818341  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1344  putative anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit  25.56 
 
 
808 aa  199  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1660  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit YnfE  26.91 
 
 
808 aa  198  3e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01556  oxidoreductase subunit  26.74 
 
 
808 aa  198  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.56782  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2296  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit YnfE  26.62 
 
 
808 aa  198  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000246763 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1794  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit YnfE  26.83 
 
 
808 aa  198  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2953  Formate dehydrogenase  25.68 
 
 
710 aa  198  4.0000000000000005e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01546  hypothetical protein  26.74 
 
 
808 aa  198  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.838194  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2255  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  26.52 
 
 
814 aa  197  5.000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.848686  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1029  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  27.23 
 
 
814 aa  197  6e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4542  molybdopterin oxidoreductase  27.87 
 
 
703 aa  196  1e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.1046  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1243  molybdopterin oxidoreductase  25.24 
 
 
662 aa  196  2e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02110  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  26.88 
 
 
806 aa  196  2e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.292195  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0998  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  27.3 
 
 
814 aa  195  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.181006  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0969  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  27.23 
 
 
814 aa  195  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1078  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  27.23 
 
 
814 aa  195  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.965114 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1063  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  27.11 
 
 
814 aa  194  7e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0105709  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00898  dimethyl sulfoxide reductase, anaerobic, subunit A  27 
 
 
814 aa  193  9e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0778088  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2749  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  27 
 
 
814 aa  193  9e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0999  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit  27 
 
 
814 aa  193  9e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2702  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit A  27 
 
 
814 aa  193  9e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.98868 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00905  hypothetical protein  27 
 
 
814 aa  193  9e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0839348  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0969  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit  27 
 
 
814 aa  193  9e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2226  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit  27 
 
 
814 aa  193  9e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.982689 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1386  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE  27.69 
 
 
799 aa  193  1e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3659  twin-arginine translocation pathway signal  24.47 
 
 
733 aa  193  1e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2470  molybdopterin oxidoreductase  25.35 
 
 
751 aa  192  2e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07940  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  24.97 
 
 
834 aa  192  2e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000379038 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2725  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  25.39 
 
 
792 aa  192  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2686  molybdopterin oxidoreductase  25.2 
 
 
692 aa  191  4e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.604293  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3747  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  25.68 
 
 
793 aa  191  5e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1056  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit  26.88 
 
 
814 aa  191  5e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1418  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit A  27.46 
 
 
814 aa  191  5e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1601  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  27.26 
 
 
812 aa  191  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2769  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  25.39 
 
 
792 aa  190  9e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1567  molybdopterin oxidoreductase  26.46 
 
 
803 aa  190  9e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0422  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  26.65 
 
 
806 aa  189  1e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0580651  decreased coverage  0.000000000595111 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1215  Nitrate reductase  25.98 
 
 
643 aa  190  1e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0607485  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2682  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  25.39 
 
 
792 aa  189  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2923  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family protein  24.91 
 
 
810 aa  189  2e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>