More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_22740 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_22740  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  100 
 
 
1053 aa  2199    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.945653 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16890  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  40.6 
 
 
1018 aa  690    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3031  molydopterin dinucleotide-binding region  38.77 
 
 
1193 aa  700    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0511  molydopterin dinucleotide-binding region  41.96 
 
 
1002 aa  720    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.3924 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27350  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  41 
 
 
1023 aa  725    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0515  molydopterin dinucleotide-binding region  43.57 
 
 
964 aa  774    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.470196 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0507  molydopterin dinucleotide-binding region  41.6 
 
 
952 aa  738    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.485596  normal  0.607063 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0501  molydopterin dinucleotide-binding region  71.67 
 
 
1032 aa  1555    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.638156 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0497  molydopterin dinucleotide-binding region  40.87 
 
 
1102 aa  739    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.455569 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0471  molydopterin dinucleotide-binding region  41.48 
 
 
1017 aa  739    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06120  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  36.93 
 
 
1003 aa  600  1e-170  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2768  molydopterin dinucleotide-binding region  26.2 
 
 
898 aa  209  2e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.81742  normal  0.229258 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0112  molybdopterin oxidoreductase  24.33 
 
 
971 aa  194  6e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.101891  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1646  molybdopterin oxidoreductase  26.02 
 
 
807 aa  177  7e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.165657  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2304  molybdopterin oxidoreductase  26.55 
 
 
803 aa  172  3e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1567  molybdopterin oxidoreductase  25.6 
 
 
803 aa  172  3e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6878  molybdopterin oxidoreductase  26.71 
 
 
1148 aa  170  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0354139  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3287  molybdopterin oxidoreductase  26.81 
 
 
781 aa  168  5.9999999999999996e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.239512  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20860  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  25.61 
 
 
942 aa  164  7e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0607  molydopterin dinucleotide-binding region  25.26 
 
 
910 aa  155  2.9999999999999998e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.408169 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1588  molydopterin dinucleotide-binding region  32.27 
 
 
945 aa  153  2e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0385421 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3636  molybdopterin oxidoreductase  24.74 
 
 
765 aa  146  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000159575 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4198  molybdopterin oxidoreductase  23.7 
 
 
1155 aa  144  7e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.320615  normal  0.676689 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2375  molybdopterin oxidoreductase  37.16 
 
 
747 aa  142  3e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1443  molybdopterin oxidoreductase  26.45 
 
 
729 aa  136  3e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05600  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  29.64 
 
 
979 aa  132  3e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.533202  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2365  molybdopterin oxidoreductase  26.73 
 
 
777 aa  131  9.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2584  molybdopterin oxidoreductase:molydopterin dinucleotide-binding region  23.71 
 
 
927 aa  129  3e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.822778  normal  0.769168 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2377  Formate dehydrogenase  26.09 
 
 
791 aa  126  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0935  molybdopterin oxidoreductase  33.73 
 
 
745 aa  127  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2511  molybdopterin oxidoreductase  25.25 
 
 
776 aa  125  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1003  molybdopterin oxidoreductase  31.2 
 
 
700 aa  125  4e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1228  molybdopterin oxidoreductase  32.76 
 
 
843 aa  124  7e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0541  molybdopterin oxidoreductase  23.56 
 
 
755 aa  124  8e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1904  molydopterin dinucleotide-binding region  27.01 
 
 
753 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0313  molybdopterin oxidoreductase  31.75 
 
 
698 aa  122  3e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.16634  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1880  Formate dehydrogenase  33.59 
 
 
744 aa  122  3.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1907  molybdopterin oxidoreductase  33.73 
 
 
794 aa  121  6e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1164  Formate dehydrogenase  29.79 
 
 
730 aa  121  7e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.589725  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2013  molybdopterin oxidoreductase  33.07 
 
 
1055 aa  119  3e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1886  molybdopterin oxidoreductase  32.64 
 
 
747 aa  119  3.9999999999999997e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1149  molybdopterin oxidoreductase  33.67 
 
 
856 aa  118  5e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000213682  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0899  Formate dehydrogenase  31.85 
 
 
756 aa  118  6e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2478  molybdopterin oxidoreductase  31.16 
 
 
820 aa  118  6e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.495104  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1633  molybdopterin oxidoreductase  29.22 
 
 
734 aa  117  7.999999999999999e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1890  molybdopterin oxidoreductase  29.57 
 
 
726 aa  117  8.999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0470  molybdopterin oxidoreductase  32.67 
 
 
855 aa  115  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2374  Nitrate reductase  29.48 
 
 
821 aa  115  4.0000000000000004e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.037868  normal  0.51028 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0450  formate dehydrogenase  29.25 
 
 
722 aa  115  6e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0619  molybdopterin oxidoreductase  31.6 
 
 
911 aa  114  8.000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0643  molybdopterin oxidoreductase  35.08 
 
 
866 aa  113  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2227  molybdopterin oxidoreductase  33.06 
 
 
891 aa  112  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.178988  hitchhiker  0.00000402166 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4227  molybdopterin oxidoreductase  26.92 
 
 
817 aa  109  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2001  molybdopterin oxidoreductase  23.28 
 
 
978 aa  108  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.754637  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0620  twin-arginine translocation pathway signal  27.12 
 
 
741 aa  108  6e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.390565  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22240  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  27.89 
 
 
836 aa  107  9e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.17201 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4524  molybdopterin oxidoreductase  22.52 
 
 
978 aa  107  9e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.556057 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17920  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  29.82 
 
 
826 aa  107  1e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.194946  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0633  molybdopterin oxidoreductase  30.25 
 
 
759 aa  107  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0644016 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2386  molybdopterin oxidoreductase  27.55 
 
 
747 aa  107  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1560  molybdopterin oxidoreductase  26.58 
 
 
917 aa  107  1e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.444202 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2605  twin-arginine translocation pathway signal  29.37 
 
 
879 aa  107  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.746738 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5761  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:molybdopterin oxidoreductase:molydopterin dinucleotide-binding region:molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region:oxidoreductase FAD-binding region  31.25 
 
 
1142 aa  106  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0242  molydopterin dinucleotide-binding region  27.87 
 
 
737 aa  106  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1509  Formate dehydrogenase  27.84 
 
 
732 aa  105  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2549  molydopterin dinucleotide-binding region  27 
 
 
737 aa  104  7e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.573816  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2753  molydopterin dinucleotide-binding region  28.57 
 
 
749 aa  104  8e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.28964  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0559  molybdopterin oxidoreductase  26.12 
 
 
760 aa  104  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3094  molybdopterin oxidoreductase  30 
 
 
858 aa  104  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.799457  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2453  molybdopterin oxidoreductase  29.15 
 
 
909 aa  104  1e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.154365  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1629  molybdopterin oxidoreductase  23.33 
 
 
789 aa  103  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0144  Nitrate reductase  23.59 
 
 
968 aa  103  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.20864 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1634  molybdopterin oxidoreductase  26.88 
 
 
1087 aa  103  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3264  Nitrate reductase  24.31 
 
 
836 aa  103  2e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0520925 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1675  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  22.61 
 
 
974 aa  102  3e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3287  molybdopterin oxidoreductase  28.8 
 
 
695 aa  102  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0930  molybdopterin oxidoreductase  29.37 
 
 
731 aa  102  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.99852  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0555  molybdopterin oxidoreductase  26.12 
 
 
764 aa  102  4e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0531  molybdopterin oxidoreductase  26.12 
 
 
764 aa  102  4e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1166  formate dehydrogenase  28.63 
 
 
750 aa  102  5e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0387  molybdopterin oxidoreductase  28.85 
 
 
879 aa  101  6e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4231  molybdopterin oxidoreductase  28.28 
 
 
818 aa  101  6e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0547  molybdopterin oxidoreductase  29.32 
 
 
732 aa  101  6e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3619  molybdopterin oxidoreductase  25.68 
 
 
764 aa  101  6e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3444  twin-arginine translocation pathway signal  25.68 
 
 
764 aa  101  7e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0507  twin-arginine translocation pathway signal  25.68 
 
 
764 aa  101  7e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2139  molybdopterin oxidoreductase  26.01 
 
 
739 aa  101  8e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.113571  normal  0.495973 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4361  molybdopterin dinucleotide-binding region  31.64 
 
 
1138 aa  101  8e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4110  molybdopterin oxidoreductase  27.78 
 
 
744 aa  101  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.220187  normal  0.43512 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1208  molybdopterin oxidoreductase  28.08 
 
 
947 aa  100  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0688  molybdopterin oxidoreductase  30 
 
 
692 aa  100  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2923  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family protein  27.72 
 
 
810 aa  100  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1612  molydopterin dinucleotide-binding region  28.51 
 
 
967 aa  99.8  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0216  molybdopterin oxidoreductase  30.89 
 
 
837 aa  100  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1006  molybdopterin oxidoreductase  28.35 
 
 
761 aa  99.8  3e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.249803 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3471  molybdopterin oxidoreductase  27.74 
 
 
778 aa  99.8  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1932  molybdopterin oxidoreductase  28.14 
 
 
726 aa  99.4  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.496239  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4062  polysulfide reductase, subunit A  25.34 
 
 
760 aa  99  4e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1936  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  23.65 
 
 
973 aa  99  5e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2777  nitrate reductase  27.52 
 
 
731 aa  98.6  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>