More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_21090 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_21090  cysteine desulfurase family protein  100 
 
 		 392 aa  785    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.822345  normal  0.14044 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0546  aminotransferase class V  61.56 
 
 		 400 aa  422  1e-117  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0396718  hitchhiker  0.00519262 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2179  cysteine desulfurase  52.99 
 
 		 373 aa  381  1e-104  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1568  cysteine desulfurase  55.8 
 
 		 373 aa  371  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2865  cysteine desulfurase  55.8 
 
 		 373 aa  371  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0379  cysteine desulfurase  55.8 
 
 		 373 aa  371  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1225  cysteine desulfurase  55.8 
 
 		 414 aa  371  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.738138  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1755  cysteine desulfurase  55.8 
 
 		 373 aa  371  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.983783  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0422  cysteine desulfurase  55.8 
 
 		 373 aa  371  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0624  aminotransferase, class V  49.48 
 
 		 385 aa  342  5.999999999999999e-93  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292698 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  47 
 
 		 384 aa  338  9.999999999999999e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  45.95 
 
 		 392 aa  336  3.9999999999999995e-91  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0188  aminotransferase class V  51.49 
 
 		 382 aa  336  5e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.431625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  49.73 
 
 		 388 aa  335  7e-91  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  47 
 
 		 384 aa  335  9e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2243  aminotransferase class V  47.62 
 
 		 380 aa  334  2e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2630  aminotransferase class V  50.27 
 
 		 1143 aa  333  4e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  46.3 
 
 		 400 aa  332  1e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  47.78 
 
 		 382 aa  331  1e-89  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2808  aminotransferase, class V  47.99 
 
 		 379 aa  330  2e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  47.51 
 
 		 398 aa  330  3e-89  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  46.34 
 
 		 394 aa  327  2.0000000000000001e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1581  aminotransferase, class V  51.78 
 
 		 1135 aa  327  2.0000000000000001e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.863454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  46.34 
 
 		 392 aa  325  1e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  47 
 
 		 399 aa  324  2e-87  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  47.76 
 
 		 396 aa  324  2e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1583  aminotransferase class V  50.13 
 
 		 1139 aa  323  4e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  44.88 
 
 		 394 aa  323  4e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0281  cysteine desulfurase  46.03 
 
 		 404 aa  319  5e-86  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.910551  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3031  cysteine desulfurase  44.94 
 
 		 404 aa  317  3e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.563846  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  44.62 
 
 		 394 aa  316  5e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  44.39 
 
 		 398 aa  315  9.999999999999999e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  44.39 
 
 		 398 aa  315  9.999999999999999e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1551  aminotransferase class V  45.05 
 
 		 383 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1244  cysteine desulfurase  45 
 
 		 404 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2751  cysteine desulfurase  44.68 
 
 		 404 aa  313  1.9999999999999998e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.173578  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02422  cysteine desulfurase  45 
 
 		 404 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.657115  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1138  cysteine desulfurase IscS  45 
 
 		 404 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2683  cysteine desulfurase  45 
 
 		 404 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.980146  normal  0.976252 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2905  cysteine desulfurase  45 
 
 		 404 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0404853  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2681  cysteine desulfurase  45 
 
 		 404 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.174524  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1563  cysteine desulfurase IscS  44.83 
 
 		 403 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1147  cysteine desulfurase  45 
 
 		 404 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0105086  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02386  hypothetical protein  45 
 
 		 404 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.730969  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2815  cysteine desulfurase  45 
 
 		 404 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00976282  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3762  cysteine desulfurase  45 
 
 		 404 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00149492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  48.56 
 
 		 398 aa  313  3.9999999999999997e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  43.44 
 
 		 382 aa  312  4.999999999999999e-84  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0484  aminotransferase, class V  43.49 
 
 		 417 aa  312  4.999999999999999e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0750137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3027  cysteine desulfurase  44.16 
 
 		 404 aa  311  9e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0576674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0410  cysteine desulfurase  42.45 
 
 		 422 aa  311  9e-84  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0716  aminotransferase class V  51.06 
 
 		 387 aa  311  9e-84  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  47.37 
 
 		 394 aa  311  1e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0629  cysteine desulfurase  42.71 
 
 		 410 aa  311  1e-83  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  49.06 
 
 		 379 aa  311  1e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0992  cysteine desulfurase  47.54 
 
 		 391 aa  311  2e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00026474  normal  0.256714 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2783  cysteine desulfurase  43.9 
 
 		 404 aa  310  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0158517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  46.17 
 
 		 400 aa  310  2.9999999999999997e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1104  cysteine desulfurase  44.74 
 
 		 404 aa  310  2.9999999999999997e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.013649  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2742  cysteine desulfurase  43.64 
 
 		 404 aa  309  5e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.46384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0437  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  45.87 
 
 		 388 aa  309  5e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00696357  normal  0.223385 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2698  cysteine desulfurase  43.64 
 
 		 404 aa  309  5e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.016381  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2805  cysteine desulfurase  43.64 
 
 		 404 aa  309  5e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2917  cysteine desulfurase  43.64 
 
 		 404 aa  309  5e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  45.67 
 
 		 398 aa  309  6.999999999999999e-83  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  43.72 
 
 		 414 aa  309  6.999999999999999e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4051  Cysteine desulfurase  45.36 
 
 		 380 aa  308  9e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0863916  normal  0.93961 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3062  cysteine desulfurase IscS  42.04 
 
 		 403 aa  308  1.0000000000000001e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.635367  unclonable  0.000000859331 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2264  cysteine desulfurase  43.64 
 
 		 404 aa  306  3e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2558  cysteine desulfurase NifS  44.71 
 
 		 388 aa  306  3e-82  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.947611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4044  aminotransferase, class V  43.41 
 
 		 389 aa  306  3e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.159236 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2362  cysteine desulfurase NifS  46.11 
 
 		 399 aa  306  4.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  46.49 
 
 		 384 aa  306  4.0000000000000004e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6331  cysteine desulfurase IscS  44.44 
 
 		 405 aa  306  4.0000000000000004e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.134755  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0997  cysteine desulfurase  41.41 
 
 		 415 aa  306  5.0000000000000004e-82  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3627  cysteine desulfurase  43.68 
 
 		 404 aa  306  5.0000000000000004e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0168495  normal  0.888851 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0341  cysteine desulfurase  42.97 
 
 		 388 aa  305  7e-82  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2275  aminotransferase, class V  45.17 
 
 		 386 aa  305  7e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2011  cysteine desulfurase  46.99 
 
 		 391 aa  305  8.000000000000001e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.079673  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  44.88 
 
 		 396 aa  305  8.000000000000001e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  43.77 
 
 		 393 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  44.36 
 
 		 403 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02508  cysteine desulfurase, alanine biosynthesis, putative (Eurofung)  44.47 
 
 		 507 aa  304  2.0000000000000002e-81  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0673  cysteine desulfurase IscS  42.56 
 
 		 407 aa  304  2.0000000000000002e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.752721  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  44.03 
 
 		 402 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0822  cysteine desulfurase IscS  42.56 
 
 		 421 aa  304  2.0000000000000002e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.02372  normal  0.880264 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  42.78 
 
 		 404 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0229  Cysteine desulfurase  44.68 
 
 		 405 aa  303  3.0000000000000004e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  45.97 
 
 		 392 aa  303  4.0000000000000003e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  45.05 
 
 		 396 aa  302  5.000000000000001e-81  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1553  cysteine desulfurase  42.02 
 
 		 407 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0484493  normal  0.0430953 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2579  cysteine desulfurase  41.76 
 
 		 407 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120053  hitchhiker  0.000683499 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  44.68 
 
 		 398 aa  302  8.000000000000001e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1063  aminotransferase class V  44.19 
 
 		 388 aa  301  9e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45194  predicted protein  44.23 
 
 		 395 aa  302  9e-81  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0622302  normal  0.609433 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2122  cysteine desulfurase NifS  46.28 
 
 		 401 aa  301  1e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31758 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4856  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  45.03 
 
 		 389 aa  301  1e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000224928 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1458  cysteine desulfurase  42.34 
 
 		 404 aa  301  1e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.586038  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2290  cysteine desulfurase IscS  43.39 
 
 		 405 aa  301  1e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00326388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1058  cysteine desulfurase  42.55 
 
 		 405 aa  301  2e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0834623  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>