More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A1225 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006349  BMAA0379  cysteine desulfurase  99.2 
 
 		 373 aa  745    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1225  cysteine desulfurase  100 
 
 		 414 aa  839    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.738138  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1568  cysteine desulfurase  99.2 
 
 		 373 aa  745    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2865  cysteine desulfurase  100 
 
 		 373 aa  748    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1755  cysteine desulfurase  99.2 
 
 		 373 aa  745    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.983783  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0422  cysteine desulfurase  99.2 
 
 		 373 aa  745    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0624  aminotransferase, class V  67.3 
 
 		 385 aa  492  9.999999999999999e-139  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292698 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2179  cysteine desulfurase  53.42 
 
 		 373 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2808  aminotransferase, class V  55.65 
 
 		 379 aa  397  1e-109  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2243  aminotransferase class V  51.74 
 
 		 380 aa  365  1e-100  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  47.72 
 
 		 382 aa  350  2e-95  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21090  cysteine desulfurase family protein  55.52 
 
 		 392 aa  348  7e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.822345  normal  0.14044 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  50.13 
 
 		 392 aa  348  7e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  47.88 
 
 		 400 aa  348  1e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  50.54 
 
 		 379 aa  345  1e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  47.72 
 
 		 394 aa  343  4e-93  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  51.09 
 
 		 382 aa  341  1e-92  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  48.25 
 
 		 394 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  50 
 
 		 396 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  46.01 
 
 		 392 aa  338  9.999999999999999e-92  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1058  cysteine desulfurase  48.65 
 
 		 405 aa  333  3e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0834623  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0546  aminotransferase class V  53.57 
 
 		 400 aa  332  9e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0396718  hitchhiker  0.00519262 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1551  aminotransferase class V  47.97 
 
 		 383 aa  331  1e-89  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0188  aminotransferase class V  49.2 
 
 		 382 aa  330  2e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.431625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  45.48 
 
 		 384 aa  329  5.0000000000000004e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  46.9 
 
 		 394 aa  328  1.0000000000000001e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  44.95 
 
 		 384 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  47.45 
 
 		 398 aa  327  2.0000000000000001e-88  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  46.92 
 
 		 396 aa  323  2e-87  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  45.99 
 
 		 388 aa  323  3e-87  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1025  cysteine desulfurase  47.57 
 
 		 406 aa  322  7e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00998384  normal  0.30784 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  46.07 
 
 		 393 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  46.65 
 
 		 399 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3031  cysteine desulfurase  47.01 
 
 		 404 aa  319  5e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.563846  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  47.49 
 
 		 398 aa  319  7e-86  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4665  cysteine desulfurase IscS  44.93 
 
 		 436 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3698  cysteine desulfurase IscS  44.93 
 
 		 436 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.789582  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1487  cysteine desulfurase IscS  47.58 
 
 		 406 aa  318  1e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.000124631  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0884  cysteine desulfurase IscS  45.82 
 
 		 405 aa  318  1e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.293282  normal  0.187166 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2412  cysteine desulfurase IscS  47.15 
 
 		 403 aa  318  1e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0872  cysteine desulfurase  48.52 
 
 		 380 aa  318  1e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0149083 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  46.11 
 
 		 403 aa  318  1e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1360  cysteine desulfurase IscS  46.79 
 
 		 408 aa  318  1e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0949  cysteine desulfurase IscS  45.82 
 
 		 405 aa  318  1e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0399375 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3627  cysteine desulfurase  46.74 
 
 		 404 aa  317  2e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0168495  normal  0.888851 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3823  cysteine desulfurase IscS  47.43 
 
 		 403 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.474065 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  45.36 
 
 		 394 aa  317  3e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2059  cysteine desulfurase IscS  47.45 
 
 		 407 aa  317  4e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0733618  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0437  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  47.04 
 
 		 388 aa  316  5e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00696357  normal  0.223385 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1144  cysteine desulfurase  45.87 
 
 		 407 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282524  normal  0.237339 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  44.53 
 
 		 414 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1244  cysteine desulfurase  46.74 
 
 		 404 aa  315  9.999999999999999e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1875  cysteine desulfurase  46.4 
 
 		 407 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.795233  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  44.3 
 
 		 402 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1708  cysteine desulfurase  45.55 
 
 		 407 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2217  cysteine desulfurase  45.55 
 
 		 407 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3103  cysteine desulfurase  45.55 
 
 		 407 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.412431  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1489  cysteine desulfurase  45.55 
 
 		 407 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.71249  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  46.6 
 
 		 409 aa  313  3.9999999999999997e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  46.92 
 
 		 398 aa  313  3.9999999999999997e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2655  cysteine desulfurase  45.55 
 
 		 407 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2275  aminotransferase, class V  46.89 
 
 		 386 aa  313  3.9999999999999997e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  44.95 
 
 		 384 aa  313  3.9999999999999997e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0822  cysteine desulfurase IscS  44.97 
 
 		 421 aa  312  5.999999999999999e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.02372  normal  0.880264 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0673  cysteine desulfurase IscS  44.97 
 
 		 407 aa  312  5.999999999999999e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.752721  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4134  aminotransferase, class V  45.7 
 
 		 400 aa  312  5.999999999999999e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0486971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2036  cysteine desulfurase  45.33 
 
 		 407 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.639443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2733  cysteine desulfurase  45.29 
 
 		 407 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2163  cysteine desulfurase  45.33 
 
 		 407 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.675105  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05560  cysteine desulfhydrase, putative  45.55 
 
 		 502 aa  312  7.999999999999999e-84  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2143  cysteine desulfurase  45.6 
 
 		 407 aa  311  9e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.950908 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5951  cysteine desulfurase  45.6 
 
 		 407 aa  311  9e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.350283  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2126  cysteine desulfurase  45.6 
 
 		 407 aa  311  9e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1833  aminotransferase, class V  44.44 
 
 		 389 aa  311  1e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0175075  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2599  cysteine desulfurase  45.29 
 
 		 407 aa  311  1e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129174  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1458  cysteine desulfurase  44.5 
 
 		 407 aa  311  2e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02422  cysteine desulfurase  45.65 
 
 		 404 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.657115  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1138  cysteine desulfurase IscS  45.65 
 
 		 404 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  44.33 
 
 		 404 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1164  cysteine desulfurase IscS  46.92 
 
 		 402 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000196201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2815  cysteine desulfurase  45.65 
 
 		 404 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00976282  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2683  cysteine desulfurase  45.65 
 
 		 404 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.980146  normal  0.976252 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5432  cysteine desulfurase  45.33 
 
 		 407 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.116144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2905  cysteine desulfurase  45.65 
 
 		 404 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0404853  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2681  cysteine desulfurase  45.65 
 
 		 404 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.174524  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02386  hypothetical protein  45.65 
 
 		 404 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.730969  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4044  aminotransferase, class V  45.78 
 
 		 389 aa  310  2.9999999999999997e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.159236 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1147  cysteine desulfurase  45.65 
 
 		 404 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0105086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3762  cysteine desulfurase  45.65 
 
 		 404 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00149492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1553  cysteine desulfurase  45.41 
 
 		 407 aa  310  4e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0484493  normal  0.0430953 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1019  pyridoxal-phosphate-dependent aminotransferase (NIFS protein)  45.55 
 
 		 405 aa  309  5e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.103423  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0808  cysteine desulfurase IscS  45.74 
 
 		 405 aa  309  5e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000772731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  47.44 
 
 		 404 aa  309  5e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3062  cysteine desulfurase IscS  44.54 
 
 		 403 aa  309  5.9999999999999995e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.635367  unclonable  0.000000859331 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  43.97 
 
 		 398 aa  308  8e-83  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  43.97 
 
 		 398 aa  308  8e-83  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1104  cysteine desulfurase  45.65 
 
 		 404 aa  308  9e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.013649  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2751  cysteine desulfurase  45.65 
 
 		 404 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.173578  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2579  cysteine desulfurase  44.86 
 
 		 407 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120053  hitchhiker  0.000683499 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0484  aminotransferase, class V  44.8 
 
 		 417 aa  308  1.0000000000000001e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0750137  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>