More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4856 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_4856  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  100 
 
 		 389 aa  785    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000224928 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4811  cysteine desulfurase  80 
 
 		 398 aa  597  1e-169  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2295  aminotransferase class V  73.06 
 
 		 394 aa  573  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0121543 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1872  aminotransferase, class V  70.88 
 
 		 400 aa  555  1e-157  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.175027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4080  aminotransferase class V  69.95 
 
 		 393 aa  538  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.575303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4043  aminotransferase class V  69.69 
 
 		 393 aa  537  1e-151  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5030  aminotransferase class V  70.26 
 
 		 388 aa  523  1e-147  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1929  cysteine desulfurase  57.77 
 
 		 386 aa  404  1e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.685974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  49.74 
 
 		 388 aa  367  1e-100  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  50.26 
 
 		 403 aa  360  2e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  46.05 
 
 		 392 aa  351  2e-95  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  46.19 
 
 		 394 aa  338  9.999999999999999e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  45.05 
 
 		 400 aa  333  4e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  45.26 
 
 		 382 aa  332  6e-90  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  46.46 
 
 		 384 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  47.12 
 
 		 398 aa  327  2.0000000000000001e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  45.03 
 
 		 392 aa  326  5e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  46.32 
 
 		 384 aa  326  6e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  44.47 
 
 		 394 aa  325  1e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  44.21 
 
 		 394 aa  323  4e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  44.33 
 
 		 393 aa  322  8e-87  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  47.78 
 
 		 392 aa  320  1.9999999999999998e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  44.09 
 
 		 414 aa  318  9e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  44.47 
 
 		 398 aa  317  2e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  42.89 
 
 		 382 aa  316  5e-85  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  45 
 
 		 398 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  44.24 
 
 		 402 aa  313  3.9999999999999997e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  44.06 
 
 		 404 aa  310  2e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0437  cysteine desulfurase NifS  42.93 
 
 		 386 aa  310  2e-83  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.361233 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1649  aminotransferase, class V  45.41 
 
 		 385 aa  310  4e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.251188  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0281  cysteine desulfurase  43.75 
 
 		 404 aa  309  5.9999999999999995e-83  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.910551  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  45 
 
 		 399 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  44.09 
 
 		 398 aa  308  1.0000000000000001e-82  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  44.09 
 
 		 398 aa  308  1.0000000000000001e-82  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2205  cysteine desulfurase IscS  44.24 
 
 		 403 aa  305  9.000000000000001e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00230458  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1344  aminotransferase class V  41.36 
 
 		 406 aa  304  1.0000000000000001e-81  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2579  cysteine desulfurase  42.93 
 
 		 407 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120053  hitchhiker  0.000683499 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  43.8 
 
 		 404 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4262  aminotransferase class V  46.04 
 
 		 395 aa  303  3.0000000000000004e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  45.01 
 
 		 409 aa  303  3.0000000000000004e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1932  cysteine desulfurase NifS  44.21 
 
 		 393 aa  303  3.0000000000000004e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0341  cysteine desulfurase  42.48 
 
 		 388 aa  303  4.0000000000000003e-81  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_70  aminotransferase, class V  45.65 
 
 		 383 aa  303  4.0000000000000003e-81  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2025  aminotransferase, class V  42.12 
 
 		 383 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3109  aminotransferase class V  43.9 
 
 		 381 aa  302  7.000000000000001e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00030249  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0248  cysteine desulfurase  45.65 
 
 		 383 aa  301  1e-80  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0166722  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0437  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  44.53 
 
 		 388 aa  301  1e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00696357  normal  0.223385 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  44.33 
 
 		 396 aa  301  1e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1553  cysteine desulfurase  42.41 
 
 		 407 aa  301  1e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0484493  normal  0.0430953 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1458  cysteine desulfurase  42.67 
 
 		 407 aa  300  2e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  42.74 
 
 		 407 aa  300  3e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1489  cysteine desulfurase  42.67 
 
 		 407 aa  299  5e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.71249  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1708  cysteine desulfurase  42.67 
 
 		 407 aa  299  5e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2217  cysteine desulfurase  42.67 
 
 		 407 aa  299  5e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1487  cysteine desulfurase IscS  44.01 
 
 		 406 aa  299  5e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.000124631  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3103  cysteine desulfurase  42.67 
 
 		 407 aa  299  5e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.412431  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2655  cysteine desulfurase  42.67 
 
 		 407 aa  298  7e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2290  cysteine desulfurase IscS  42.41 
 
 		 405 aa  298  8e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00326388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  42.11 
 
 		 379 aa  298  1e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2733  cysteine desulfurase  42.41 
 
 		 407 aa  298  1e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2558  cysteine desulfurase NifS  44.97 
 
 		 388 aa  298  1e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.947611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1068  aminotransferase, class V  44.65 
 
 		 393 aa  298  1e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0344653  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3449  cysteine desulfurase  41.84 
 
 		 389 aa  297  2e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1353  aminotransferase, class V  46.72 
 
 		 389 aa  297  2e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2059  cysteine desulfurase IscS  43.49 
 
 		 407 aa  297  2e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0733618  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2599  cysteine desulfurase  42.41 
 
 		 407 aa  298  2e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129174  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  42.22 
 
 		 384 aa  296  3e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  43.68 
 
 		 398 aa  297  3e-79  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1939  aminotransferase class V  45.29 
 
 		 388 aa  295  7e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024706 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85588  predicted protein  43.23 
 
 		 493 aa  295  8e-79  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.464986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1875  cysteine desulfurase  42.15 
 
 		 407 aa  295  1e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.795233  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2036  cysteine desulfurase  42.15 
 
 		 407 aa  294  1e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.639443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2163  cysteine desulfurase  42.15 
 
 		 407 aa  294  1e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.675105  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0949  cysteine desulfurase IscS  41.62 
 
 		 405 aa  294  2e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0399375 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1058  cysteine desulfurase  42.15 
 
 		 405 aa  294  2e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0834623  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  40.94 
 
 		 396 aa  294  2e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0830  cysteine desulfurase IscS  41.93 
 
 		 407 aa  294  2e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.184128 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0884  cysteine desulfurase IscS  41.62 
 
 		 405 aa  294  2e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.293282  normal  0.187166 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3031  cysteine desulfurase  42.71 
 
 		 404 aa  294  2e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.563846  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  43.16 
 
 		 396 aa  293  2e-78  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14730  cysteine desulfurase  42.71 
 
 		 404 aa  293  3e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.179473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0188  aminotransferase class V  42.89 
 
 		 382 aa  293  4e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.431625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1063  aminotransferase class V  42.51 
 
 		 388 aa  293  4e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  41.21 
 
 		 389 aa  293  5e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2177  cysteine desulfurase IscS  41.1 
 
 		 430 aa  293  5e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00159504  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4336  cysteine desulfurase  41.93 
 
 		 404 aa  292  6e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.180367  hitchhiker  0.00000000219205 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1244  cysteine desulfurase  42.19 
 
 		 404 aa  292  8e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2865  cysteine desulfurase  42.48 
 
 		 373 aa  292  9e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1144  cysteine desulfurase  41.88 
 
 		 407 aa  291  9e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282524  normal  0.237339 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02508  cysteine desulfurase, alanine biosynthesis, putative (Eurofung)  43.23 
 
 		 507 aa  291  1e-77  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2243  aminotransferase class V  41.05 
 
 		 380 aa  291  1e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1019  pyridoxal-phosphate-dependent aminotransferase (NIFS protein)  41.62 
 
 		 405 aa  291  1e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.103423  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0379  cysteine desulfurase  42.48 
 
 		 373 aa  291  1e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0422  cysteine desulfurase  42.48 
 
 		 373 aa  291  1e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1225  cysteine desulfurase  42.48 
 
 		 414 aa  291  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.738138  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1568  cysteine desulfurase  42.48 
 
 		 373 aa  291  1e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1755  cysteine desulfurase  42.48 
 
 		 373 aa  291  1e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.983783  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02422  cysteine desulfurase  41.67 
 
 		 404 aa  291  2e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.657115  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0717  cysteine desulfurase  39.84 
 
 		 406 aa  291  2e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2683  cysteine desulfurase  41.67 
 
 		 404 aa  291  2e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.980146  normal  0.976252 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>