More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2295 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2295  aminotransferase class V  100 
 
 		 394 aa  802    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0121543 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4856  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  73.06 
 
 		 389 aa  573  1.0000000000000001e-162  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000224928 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4080  aminotransferase class V  69.57 
 
 		 393 aa  560  1e-158  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.575303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1872  aminotransferase, class V  70.26 
 
 		 400 aa  558  1e-158  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.175027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4043  aminotransferase class V  69.31 
 
 		 393 aa  558  1e-158  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4811  cysteine desulfurase  70.84 
 
 		 398 aa  537  1e-151  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5030  aminotransferase class V  67.45 
 
 		 388 aa  518  1e-146  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1929  cysteine desulfurase  57.29 
 
 		 386 aa  398  1e-109  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.685974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  46.89 
 
 		 388 aa  347  1e-94  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  45.57 
 
 		 403 aa  340  2e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  44.53 
 
 		 392 aa  340  2.9999999999999998e-92  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  45.85 
 
 		 392 aa  331  1e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  45.48 
 
 		 394 aa  329  6e-89  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  43.49 
 
 		 394 aa  328  9e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  45.57 
 
 		 384 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  45.45 
 
 		 384 aa  327  3e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  43.75 
 
 		 394 aa  323  2e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  44.44 
 
 		 400 aa  324  2e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  42.6 
 
 		 414 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  43.49 
 
 		 382 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  43.34 
 
 		 393 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  42.71 
 
 		 398 aa  312  6.999999999999999e-84  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  41.75 
 
 		 396 aa  310  2e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  42.28 
 
 		 399 aa  309  5.9999999999999995e-83  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  44.73 
 
 		 392 aa  307  2.0000000000000002e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1344  aminotransferase class V  41.97 
 
 		 406 aa  306  3e-82  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  40.97 
 
 		 402 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  43.01 
 
 		 398 aa  304  2.0000000000000002e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  42.19 
 
 		 398 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2025  aminotransferase, class V  41.65 
 
 		 383 aa  302  6.000000000000001e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3063  aminotransferase, class V  43.64 
 
 		 383 aa  298  8e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0588987  unclonable  0.000000817205 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3031  cysteine desulfurase  43.04 
 
 		 404 aa  297  2e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.563846  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  42.04 
 
 		 407 aa  297  2e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  39.34 
 
 		 398 aa  297  2e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  39.34 
 
 		 398 aa  297  2e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004360  cysteine desulfurase  41.49 
 
 		 404 aa  296  4e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.591204  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  41.25 
 
 		 404 aa  296  5e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  41.71 
 
 		 396 aa  296  5e-79  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  40.67 
 
 		 382 aa  295  7e-79  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0885  cysteine desulfurase  41.24 
 
 		 404 aa  295  9e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.306655  hitchhiker  0.00050858 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  42.19 
 
 		 379 aa  295  1e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1551  aminotransferase class V  44.04 
 
 		 383 aa  295  1e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02422  cysteine desulfurase  42.01 
 
 		 404 aa  294  2e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.657115  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1138  cysteine desulfurase IscS  42.01 
 
 		 404 aa  294  2e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1147  cysteine desulfurase  42.01 
 
 		 404 aa  294  2e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0105086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2683  cysteine desulfurase  42.01 
 
 		 404 aa  294  2e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.980146  normal  0.976252 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  41.3 
 
 		 389 aa  294  2e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02386  hypothetical protein  42.01 
 
 		 404 aa  294  2e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.730969  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3762  cysteine desulfurase  42.01 
 
 		 404 aa  294  2e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00149492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2905  cysteine desulfurase  42.01 
 
 		 404 aa  294  2e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0404853  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2681  cysteine desulfurase  42.01 
 
 		 404 aa  294  2e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.174524  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2815  cysteine desulfurase  42.01 
 
 		 404 aa  294  2e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00976282  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0842  cysteine desulfurase  40.98 
 
 		 404 aa  293  3e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0648359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0872  cysteine desulfurase  40.98 
 
 		 404 aa  293  3e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.368262 
 
 
-
 
NC_002936  DET0248  cysteine desulfurase  44.65 
 
 		 383 aa  293  4e-78  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0166722  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_70  aminotransferase, class V  43.93 
 
 		 383 aa  293  4e-78  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3511  cysteine desulfurase  39.85 
 
 		 404 aa  293  4e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.309898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  42.08 
 
 		 396 aa  293  4e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0884  cysteine desulfurase IscS  41.19 
 
 		 405 aa  293  5e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.293282  normal  0.187166 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4336  cysteine desulfurase  40.98 
 
 		 404 aa  292  5e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.180367  hitchhiker  0.00000000219205 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0949  cysteine desulfurase IscS  41.19 
 
 		 405 aa  293  5e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0399375 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0624  aminotransferase, class V  44.74 
 
 		 385 aa  292  6e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292698 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01055  cysteine desulfurase  40.98 
 
 		 404 aa  292  7e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0229  Cysteine desulfurase  41.48 
 
 		 405 aa  292  8e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  41.67 
 
 		 394 aa  291  1e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0437  cysteine desulfurase NifS  39.9 
 
 		 386 aa  291  1e-77  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.361233 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  40.36 
 
 		 398 aa  291  1e-77  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0720  Cysteine desulfurase  41.67 
 
 		 381 aa  291  1e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0277  cysteine desulfurase  40.72 
 
 		 404 aa  291  2e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0284858  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2698  cysteine desulfurase  42.27 
 
 		 404 aa  290  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.016381  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  42.3 
 
 		 404 aa  291  2e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2742  cysteine desulfurase  42.27 
 
 		 404 aa  290  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.46384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2805  cysteine desulfurase  42.27 
 
 		 404 aa  290  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1553  cysteine desulfurase  41.19 
 
 		 407 aa  291  2e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0484493  normal  0.0430953 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2290  cysteine desulfurase IscS  41.19 
 
 		 405 aa  291  2e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00326388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2917  cysteine desulfurase  42.27 
 
 		 404 aa  290  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14730  cysteine desulfurase  40.61 
 
 		 404 aa  291  2e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.179473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1058  cysteine desulfurase  40.67 
 
 		 405 aa  290  3e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0834623  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2579  cysteine desulfurase  41.19 
 
 		 407 aa  290  3e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120053  hitchhiker  0.000683499 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3627  cysteine desulfurase  42.01 
 
 		 404 aa  290  3e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0168495  normal  0.888851 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1932  cysteine desulfurase NifS  41.67 
 
 		 393 aa  290  4e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1353  aminotransferase, class V  44.42 
 
 		 389 aa  290  4e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0341  cysteine desulfurase  40.47 
 
 		 388 aa  289  5.0000000000000004e-77  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3027  cysteine desulfurase  41.75 
 
 		 404 aa  289  5.0000000000000004e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0576674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1458  cysteine desulfurase  42.27 
 
 		 404 aa  289  6e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.586038  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2783  cysteine desulfurase  42.01 
 
 		 404 aa  289  7e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0158517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1244  cysteine desulfurase  42.01 
 
 		 404 aa  289  7e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1299  cysteine desulfurase  40.36 
 
 		 404 aa  288  8e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0382772  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0808  cysteine desulfurase IscS  41.6 
 
 		 405 aa  288  1e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000772731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2059  cysteine desulfurase IscS  41.62 
 
 		 407 aa  287  2e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0733618  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  40.99 
 
 		 396 aa  287  2e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0281  cysteine desulfurase  41.75 
 
 		 404 aa  287  2e-76  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.910551  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2431  aminotransferase, class V  41.54 
 
 		 390 aa  287  2e-76  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2205  cysteine desulfurase IscS  41.97 
 
 		 403 aa  288  2e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00230458  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1487  cysteine desulfurase IscS  41.37 
 
 		 406 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.000124631  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1104  cysteine desulfurase  41.75 
 
 		 404 aa  286  2.9999999999999996e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.013649  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1458  cysteine desulfurase  40.16 
 
 		 407 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2264  cysteine desulfurase  42.01 
 
 		 404 aa  286  4e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2498  aminotransferase class V  41.09 
 
 		 381 aa  286  5e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  42.04 
 
 		 400 aa  286  5e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>