More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0720 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0720  Cysteine desulfurase  100 
 
 
381 aa  780    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2719  aminotransferase class V  76.32 
 
 
380 aa  609  1e-173  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0478  aminotransferase, class V  57.52 
 
 
380 aa  449  1e-125  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000122406 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3320  aminotransferase class V  57.78 
 
 
380 aa  449  1e-125  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4757  aminotransferase, class V  58.05 
 
 
380 aa  450  1e-125  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4479  aminotransferase class V  58.05 
 
 
380 aa  450  1e-125  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4785  aminotransferase, class V  57.52 
 
 
380 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4546  aminotransferase, class V  57.52 
 
 
380 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4382  cysteine desulfhydrase, aminotransferase, class V  57.52 
 
 
380 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4392  cysteine desulfhydrase, aminotransferase, class V  57.52 
 
 
380 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4900  aminotransferase, class V  57.52 
 
 
380 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4766  aminotransferase, class V  57.26 
 
 
380 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4783  aminotransferase, class V  57.52 
 
 
380 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1373  cysteine desulphurase  47.11 
 
 
381 aa  362  6e-99  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00618105  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0199  aminotransferase, class V  50.26 
 
 
382 aa  358  9.999999999999999e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22050  aminotransferase class V  48.54 
 
 
381 aa  357  1.9999999999999998e-97  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.718227  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2025  aminotransferase, class V  46.68 
 
 
383 aa  356  3.9999999999999996e-97  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0502  aminotransferase, class V  50.69 
 
 
382 aa  353  2e-96  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000217795  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0450  aminotransferase (class V), putative  47.45 
 
 
381 aa  351  1e-95  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0570589  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0534  pyridoxal-phosphate dependent aminotransferase  46.72 
 
 
381 aa  338  9.999999999999999e-92  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1224  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  46.34 
 
 
384 aa  335  1e-90  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000183022  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  46.32 
 
 
382 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2302  aminotransferase class V  42.97 
 
 
395 aa  322  6e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.729781  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1684  aminotransferase class V  43.12 
 
 
387 aa  320  3.9999999999999996e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2352  aminotransferase class V  45 
 
 
388 aa  317  2e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1667  aminotransferase, class V  43.72 
 
 
381 aa  317  3e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  40.63 
 
 
392 aa  316  4e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  43.39 
 
 
396 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  43.68 
 
 
394 aa  314  1.9999999999999998e-84  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1403  aminotransferase, class V  42.93 
 
 
381 aa  313  2.9999999999999996e-84  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.862736  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  45.05 
 
 
400 aa  311  7.999999999999999e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1547  aminotransferase class V  42.22 
 
 
382 aa  311  1e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  40.68 
 
 
382 aa  310  2e-83  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  41.73 
 
 
394 aa  309  5e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0953  Cysteine desulfurase  46.86 
 
 
380 aa  308  6.999999999999999e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1064  aminotransferase, class V  43.58 
 
 
387 aa  308  8e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  42.78 
 
 
398 aa  308  9e-83  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1273  cysteine desulfhydrase  44.33 
 
 
380 aa  308  1.0000000000000001e-82  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.000000190468  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  43.31 
 
 
388 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1331  aminotransferase, class V  44.33 
 
 
380 aa  308  1.0000000000000001e-82  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000957833  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0097  aminotransferase class V  42.06 
 
 
377 aa  307  2.0000000000000002e-82  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  44.13 
 
 
398 aa  307  2.0000000000000002e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  42.58 
 
 
398 aa  307  2.0000000000000002e-82  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  42.58 
 
 
398 aa  307  2.0000000000000002e-82  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3109  aminotransferase class V  43.95 
 
 
381 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00030249  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  41.73 
 
 
394 aa  306  4.0000000000000004e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  41.16 
 
 
404 aa  305  8.000000000000001e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  41.21 
 
 
384 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  42.67 
 
 
392 aa  304  2.0000000000000002e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  42.52 
 
 
403 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2498  aminotransferase class V  43.8 
 
 
381 aa  303  4.0000000000000003e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0248  cysteine desulfurase  46.01 
 
 
383 aa  300  2e-80  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0166722  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4480  aminotransferase, class V  42.63 
 
 
381 aa  300  2e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.921351  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  42.89 
 
 
396 aa  300  2e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4477  aminotransferase, class V  42.89 
 
 
381 aa  300  4e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.508200000000001e-19 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  43.27 
 
 
392 aa  300  4e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4244  aminotransferase class V  42.37 
 
 
381 aa  299  7e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00204023  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  40.16 
 
 
398 aa  298  7e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4129  aminotransferase, class V  42.48 
 
 
381 aa  298  8e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00019108  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  42.82 
 
 
398 aa  298  1e-79  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4530  aminotransferase, class V  42.37 
 
 
381 aa  298  1e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000702151  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_70  aminotransferase, class V  45.73 
 
 
383 aa  298  1e-79  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  40.69 
 
 
393 aa  298  1e-79  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4140  aminotransferase, class V  42.63 
 
 
381 aa  297  2e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000996508  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  40.42 
 
 
384 aa  297  2e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4292  aminotransferase, class V  42.63 
 
 
381 aa  296  5e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000991667  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4626  aminotransferase, class V  42.63 
 
 
381 aa  296  5e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.058165  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0719  aminotransferase, class V  41.95 
 
 
381 aa  296  5e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000547846  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1872  aminotransferase, class V  41.75 
 
 
400 aa  294  1e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.175027  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4517  aminotransferase, class V  41.69 
 
 
381 aa  293  3e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0024603  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3031  cysteine desulfurase  43.23 
 
 
404 aa  293  5e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.563846  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  40.68 
 
 
414 aa  292  6e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  42.11 
 
 
399 aa  291  1e-77  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1351  aminotransferase class V  43.34 
 
 
384 aa  291  1e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000000567164 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  43.53 
 
 
396 aa  291  1e-77  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2295  aminotransferase class V  41.67 
 
 
394 aa  291  1e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0121543 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  43.24 
 
 
400 aa  290  2e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1356  cysteine desulfurase NifS  43.62 
 
 
402 aa  290  2e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2783  cysteine desulfurase  42.45 
 
 
404 aa  290  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0158517  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0717  cysteine desulfurase  42.19 
 
 
406 aa  289  5.0000000000000004e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0713  Cysteine desulfurase  40.53 
 
 
380 aa  289  6e-77  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1932  cysteine desulfurase NifS  39.74 
 
 
393 aa  289  7e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2805  cysteine desulfurase  42.19 
 
 
404 aa  288  8e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2698  cysteine desulfurase  42.19 
 
 
404 aa  288  8e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.016381  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2742  cysteine desulfurase  42.19 
 
 
404 aa  288  8e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.46384  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2917  cysteine desulfurase  42.19 
 
 
404 aa  288  8e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1807  aminotransferase class V  41.1 
 
 
388 aa  288  1e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.113842  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  38.95 
 
 
407 aa  288  1e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1772  aminotransferase, class V  41.1 
 
 
388 aa  288  1e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02422  cysteine desulfurase  42.45 
 
 
404 aa  287  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.657115  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1138  cysteine desulfurase IscS  42.45 
 
 
404 aa  287  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1142  cysteine desulfurase  41.76 
 
 
384 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.165458  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2681  cysteine desulfurase  42.45 
 
 
404 aa  287  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.174524  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3762  cysteine desulfurase  42.45 
 
 
404 aa  287  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00149492  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2905  cysteine desulfurase  42.45 
 
 
404 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0404853  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1147  cysteine desulfurase  42.45 
 
 
404 aa  287  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0105086  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2683  cysteine desulfurase  42.45 
 
 
404 aa  287  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.980146  normal  0.976252 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2815  cysteine desulfurase  42.45 
 
 
404 aa  287  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00976282  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02386  hypothetical protein  42.45 
 
 
404 aa  287  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.730969  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  42.15 
 
 
394 aa  286  4e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>