More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2719 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2719  aminotransferase class V  100 
 
 
380 aa  783    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0720  Cysteine desulfurase  76.32 
 
 
381 aa  609  1e-173  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4479  aminotransferase class V  61.32 
 
 
380 aa  480  1e-134  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3320  aminotransferase class V  60.53 
 
 
380 aa  480  1e-134  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4766  aminotransferase, class V  61.05 
 
 
380 aa  473  1e-132  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4757  aminotransferase, class V  61.05 
 
 
380 aa  474  1e-132  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4785  aminotransferase, class V  61.05 
 
 
380 aa  473  1e-132  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4546  aminotransferase, class V  61.05 
 
 
380 aa  473  1e-132  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4382  cysteine desulfhydrase, aminotransferase, class V  61.05 
 
 
380 aa  473  1e-132  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4392  cysteine desulfhydrase, aminotransferase, class V  61.05 
 
 
380 aa  473  1e-132  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4900  aminotransferase, class V  61.05 
 
 
380 aa  473  1e-132  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4783  aminotransferase, class V  61.05 
 
 
380 aa  473  1e-132  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0478  aminotransferase, class V  60.26 
 
 
380 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000122406 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1373  cysteine desulphurase  48.81 
 
 
381 aa  379  1e-104  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00618105  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0534  pyridoxal-phosphate dependent aminotransferase  48.95 
 
 
381 aa  367  1e-100  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22050  aminotransferase class V  48.43 
 
 
381 aa  355  7.999999999999999e-97  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.718227  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0450  aminotransferase (class V), putative  46.32 
 
 
381 aa  352  7e-96  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0570589  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0199  aminotransferase, class V  47.21 
 
 
382 aa  350  2e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1224  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  48.29 
 
 
384 aa  350  3e-95  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000183022  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0502  aminotransferase, class V  49.17 
 
 
382 aa  347  2e-94  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000217795  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2025  aminotransferase, class V  45.41 
 
 
383 aa  344  1e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1064  aminotransferase, class V  45.62 
 
 
387 aa  329  4e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1667  aminotransferase, class V  44.09 
 
 
381 aa  326  4.0000000000000003e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  43.92 
 
 
404 aa  325  8.000000000000001e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1403  aminotransferase, class V  43.83 
 
 
381 aa  325  1e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.862736  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1684  aminotransferase class V  44.47 
 
 
387 aa  322  7e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2352  aminotransferase class V  44.68 
 
 
388 aa  322  8e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  41.32 
 
 
394 aa  320  1.9999999999999998e-86  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2302  aminotransferase class V  42.2 
 
 
395 aa  320  1.9999999999999998e-86  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.729781  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  42.49 
 
 
398 aa  320  1.9999999999999998e-86  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2498  aminotransferase class V  45.48 
 
 
381 aa  318  1e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1273  cysteine desulfhydrase  43.95 
 
 
380 aa  318  1e-85  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.000000190468  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1331  aminotransferase, class V  43.95 
 
 
380 aa  318  1e-85  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000957833  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  42.26 
 
 
398 aa  317  2e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  42.82 
 
 
382 aa  317  3e-85  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  41.69 
 
 
382 aa  316  4e-85  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0097  aminotransferase class V  42.82 
 
 
377 aa  314  9.999999999999999e-85  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0953  Cysteine desulfurase  44.53 
 
 
380 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  43.12 
 
 
400 aa  310  2e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  40.94 
 
 
384 aa  309  5.9999999999999995e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1547  aminotransferase class V  41.84 
 
 
382 aa  306  3e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  43.01 
 
 
394 aa  306  3e-82  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  40.68 
 
 
384 aa  305  8.000000000000001e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  39.15 
 
 
392 aa  305  1.0000000000000001e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  41.21 
 
 
398 aa  305  1.0000000000000001e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  41.21 
 
 
398 aa  305  1.0000000000000001e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3031  cysteine desulfurase  43.08 
 
 
404 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.563846  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  41.27 
 
 
396 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  42.93 
 
 
392 aa  303  3.0000000000000004e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3109  aminotransferase class V  43.31 
 
 
381 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00030249  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  41.42 
 
 
398 aa  301  1e-80  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004360  cysteine desulfurase  42.82 
 
 
404 aa  300  2e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.591204  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4480  aminotransferase, class V  43.27 
 
 
381 aa  300  3e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.921351  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  41.88 
 
 
399 aa  300  3e-80  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02422  cysteine desulfurase  42.04 
 
 
404 aa  299  5e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.657115  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1138  cysteine desulfurase IscS  42.04 
 
 
404 aa  299  5e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02386  hypothetical protein  42.04 
 
 
404 aa  299  5e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.730969  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2815  cysteine desulfurase  42.04 
 
 
404 aa  299  5e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00976282  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3762  cysteine desulfurase  42.04 
 
 
404 aa  299  5e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00149492  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2681  cysteine desulfurase  42.04 
 
 
404 aa  299  5e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.174524  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1261  Cysteine desulfurase  42.47 
 
 
383 aa  299  5e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0457777  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2783  cysteine desulfurase  42.56 
 
 
404 aa  299  5e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0158517  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2683  cysteine desulfurase  42.04 
 
 
404 aa  299  5e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.980146  normal  0.976252 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1147  cysteine desulfurase  42.04 
 
 
404 aa  299  5e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0105086  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2905  cysteine desulfurase  42.04 
 
 
404 aa  299  5e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0404853  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4244  aminotransferase class V  43.27 
 
 
381 aa  298  1e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00204023  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4140  aminotransferase, class V  43.26 
 
 
381 aa  298  1e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000996508  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0277  cysteine desulfurase  43.6 
 
 
404 aa  297  2e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0284858  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0719  aminotransferase, class V  43.01 
 
 
381 aa  297  2e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000547846  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0717  cysteine desulfurase  42.56 
 
 
406 aa  297  2e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2805  cysteine desulfurase  42.3 
 
 
404 aa  297  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4530  aminotransferase, class V  43.01 
 
 
381 aa  298  2e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000702151  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2698  cysteine desulfurase  42.3 
 
 
404 aa  297  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.016381  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2742  cysteine desulfurase  42.3 
 
 
404 aa  297  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.46384  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2917  cysteine desulfurase  42.3 
 
 
404 aa  297  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4129  aminotransferase, class V  43.01 
 
 
381 aa  296  3e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00019108  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  40 
 
 
394 aa  297  3e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4477  aminotransferase, class V  43.01 
 
 
381 aa  296  4e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.508200000000001e-19 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  40.26 
 
 
403 aa  295  9e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1932  cysteine desulfurase NifS  39.58 
 
 
393 aa  295  9e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1244  cysteine desulfurase  42.04 
 
 
404 aa  295  1e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  39.05 
 
 
393 aa  294  1e-78  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1144  cysteine desulfurase  42.26 
 
 
407 aa  295  1e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282524  normal  0.237339 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4517  aminotransferase, class V  42.74 
 
 
381 aa  295  1e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0024603  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2751  cysteine desulfurase  42.56 
 
 
404 aa  294  2e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.173578  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1708  cysteine desulfurase  42.26 
 
 
407 aa  294  2e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1489  cysteine desulfurase  42.26 
 
 
407 aa  294  2e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.71249  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3103  cysteine desulfurase  42.26 
 
 
407 aa  294  2e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.412431  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2217  cysteine desulfurase  42.26 
 
 
407 aa  294  2e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2036  cysteine desulfurase  41.73 
 
 
407 aa  293  3e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.639443  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1104  cysteine desulfurase  41.78 
 
 
404 aa  293  3e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.013649  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2655  cysteine desulfurase  42.26 
 
 
407 aa  293  3e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1875  cysteine desulfurase  42.26 
 
 
407 aa  293  3e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.795233  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3627  cysteine desulfurase  41.78 
 
 
404 aa  293  3e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0168495  normal  0.888851 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2163  cysteine desulfurase  41.73 
 
 
407 aa  293  3e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.675105  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2733  cysteine desulfurase  41.99 
 
 
407 aa  293  4e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  39.9 
 
 
396 aa  293  4e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  40.58 
 
 
398 aa  293  4e-78  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1168  cysteine desulfurase  43.08 
 
 
409 aa  293  4e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00941489  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0435  cysteine desulfurase  43.08 
 
 
409 aa  293  4e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000194235 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>