More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1403 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1667  aminotransferase, class V  96.33 
 
 		 381 aa  754    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1403  aminotransferase, class V  100 
 
 		 381 aa  777    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.862736  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2025  aminotransferase, class V  46.37 
 
 		 383 aa  336  5e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1547  aminotransferase class V  44.01 
 
 		 382 aa  333  4e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1684  aminotransferase class V  44.74 
 
 		 387 aa  331  1e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22050  aminotransferase class V  44.5 
 
 		 381 aa  327  2.0000000000000001e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.718227  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2352  aminotransferase class V  45.68 
 
 		 388 aa  325  6e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2719  aminotransferase class V  43.83 
 
 		 380 aa  325  1e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2302  aminotransferase class V  44.53 
 
 		 395 aa  324  2e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.729781  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0199  aminotransferase, class V  44.85 
 
 		 382 aa  321  9.999999999999999e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1064  aminotransferase, class V  44.09 
 
 		 387 aa  320  3e-86  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1273  cysteine desulfhydrase  43.72 
 
 		 380 aa  319  5e-86  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.000000190468  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1331  aminotransferase, class V  43.72 
 
 		 380 aa  319  5e-86  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000957833  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0720  Cysteine desulfurase  42.93 
 
 		 381 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3320  aminotransferase class V  43.96 
 
 		 380 aa  313  4.999999999999999e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4479  aminotransferase class V  43.96 
 
 		 380 aa  312  7.999999999999999e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0478  aminotransferase, class V  43.41 
 
 		 380 aa  306  3e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000122406 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4757  aminotransferase, class V  43.13 
 
 		 380 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  41.42 
 
 		 392 aa  305  9.000000000000001e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0988  cysteine desulfurase  42.11 
 
 		 384 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00170746  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4785  aminotransferase, class V  42.86 
 
 		 380 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4546  aminotransferase, class V  42.86 
 
 		 380 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4382  cysteine desulfhydrase, aminotransferase, class V  42.86 
 
 		 380 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4783  aminotransferase, class V  42.86 
 
 		 380 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4900  aminotransferase, class V  42.86 
 
 		 380 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4392  cysteine desulfhydrase, aminotransferase, class V  42.86 
 
 		 380 aa  302  6.000000000000001e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4766  aminotransferase, class V  42.86 
 
 		 380 aa  302  8.000000000000001e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1142  cysteine desulfurase  41.32 
 
 		 384 aa  300  2e-80  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.165458  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0097  aminotransferase class V  41.01 
 
 		 377 aa  296  3e-79  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  42.26 
 
 		 404 aa  295  7e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2011  cysteine desulfurase  41.36 
 
 		 391 aa  295  1e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.079673  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0992  cysteine desulfurase  40.05 
 
 		 391 aa  293  4e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00026474  normal  0.256714 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  41.36 
 
 		 382 aa  290  3e-77  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1224  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  43.19 
 
 		 384 aa  289  5.0000000000000004e-77  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000183022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1833  aminotransferase, class V  40.58 
 
 		 389 aa  289  6e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0175075  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  40.68 
 
 		 396 aa  289  6e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  39.06 
 
 		 398 aa  285  5.999999999999999e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  41.78 
 
 		 398 aa  285  8e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  41.78 
 
 		 398 aa  285  8e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1132  cysteine desulfurase  41.97 
 
 		 404 aa  285  1.0000000000000001e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  39.63 
 
 		 404 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  39.11 
 
 		 400 aa  282  7.000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2647  cysteine desulfurase NifS  39.53 
 
 		 389 aa  281  1e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00311085 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  41.1 
 
 		 394 aa  281  1e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0277  cysteine desulfurase  40.67 
 
 		 404 aa  281  1e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0284858  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3109  aminotransferase class V  42.51 
 
 		 381 aa  281  2e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00030249  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  40.58 
 
 		 398 aa  280  4e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1569  cysteine desulfurase NifS  39.27 
 
 		 389 aa  280  4e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00349258  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  41.75 
 
 		 394 aa  279  7e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2296  aminotransferase, class V  39.63 
 
 		 394 aa  278  8e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4134  aminotransferase, class V  41.1 
 
 		 400 aa  278  1e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0486971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1099  aminotransferase class V  42.52 
 
 		 378 aa  278  1e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.386639  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  41.36 
 
 		 384 aa  278  1e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0717  cysteine desulfurase  39.12 
 
 		 406 aa  278  2e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0502  aminotransferase, class V  41.26 
 
 		 382 aa  277  2e-73  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000217795  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08616  iron-sulfur cofactor synthesis protein  41.95 
 
 		 382 aa  276  3e-73  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  41.36 
 
 		 384 aa  276  5e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  40.68 
 
 		 396 aa  276  5e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004360  cysteine desulfurase  38.6 
 
 		 404 aa  276  5e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.591204  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1356  cysteine desulfurase NifS  39.63 
 
 		 402 aa  275  7e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01055  cysteine desulfurase  38.86 
 
 		 404 aa  275  7e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85588  predicted protein  39.48 
 
 		 493 aa  275  8e-73  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.464986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  41.62 
 
 		 382 aa  275  8e-73  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  41.21 
 
 		 400 aa  275  9e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  40.05 
 
 		 399 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2362  cysteine desulfurase NifS  39.74 
 
 		 399 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1186  aminotransferase, class V  40 
 
 		 380 aa  273  3e-72  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4480  aminotransferase, class V  41.96 
 
 		 381 aa  273  3e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.921351  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  38.85 
 
 		 384 aa  273  3e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0713  Cysteine desulfurase  39.32 
 
 		 380 aa  272  6e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  38.7 
 
 		 392 aa  272  8.000000000000001e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4244  aminotransferase class V  41.96 
 
 		 381 aa  272  9e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00204023  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2122  cysteine desulfurase NifS  39.63 
 
 		 401 aa  271  2e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31758 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  40.26 
 
 		 398 aa  270  2e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4530  aminotransferase, class V  41.69 
 
 		 381 aa  270  2e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000702151  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1713  aminotransferase class V  40.53 
 
 		 380 aa  270  2.9999999999999997e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.229931  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0719  aminotransferase, class V  41.96 
 
 		 381 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000547846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1680  aminotransferase, class V  40.53 
 
 		 380 aa  270  2.9999999999999997e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.399532  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0953  Cysteine desulfurase  39.84 
 
 		 380 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4140  aminotransferase, class V  40.87 
 
 		 381 aa  270  4e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000996508  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3485  cysteine desulfurase  40.94 
 
 		 375 aa  270  4e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0611643 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0450  aminotransferase (class V), putative  38.8 
 
 		 381 aa  270  4e-71  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0570589  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  37.8 
 
 		 407 aa  269  5e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3416  aminotransferase class V  39.16 
 
 		 399 aa  269  5e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.425221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4477  aminotransferase, class V  40.87 
 
 		 381 aa  269  5.9999999999999995e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.508200000000001e-19 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  37.34 
 
 		 403 aa  269  7e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4245  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  39.9 
 
 		 398 aa  268  8.999999999999999e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4292  aminotransferase, class V  40.87 
 
 		 381 aa  268  1e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000991667  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4129  aminotransferase, class V  40.87 
 
 		 381 aa  268  1e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00019108  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4626  aminotransferase, class V  40.87 
 
 		 381 aa  268  1e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.058165  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0172  aminotransferase class V  41.1 
 
 		 384 aa  267  2e-70  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.921523  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2154  cysteine desulfurase, NifS family  40.57 
 
 		 396 aa  268  2e-70  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2317  cysteine desulfurase  38.14 
 
 		 404 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.459864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4517  aminotransferase, class V  41.42 
 
 		 381 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0024603  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1373  cysteine desulphurase  40.44 
 
 		 381 aa  266  5.999999999999999e-70  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00618105  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2579  cysteine desulfurase  39.32 
 
 		 407 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120053  hitchhiker  0.000683499 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2431  aminotransferase, class V  39.38 
 
 		 390 aa  266  5.999999999999999e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02508  cysteine desulfurase, alanine biosynthesis, putative (Eurofung)  39.12 
 
 		 507 aa  265  7e-70  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  41.36 
 
 		 392 aa  265  7e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3031  cysteine desulfurase  38.08 
 
 		 404 aa  265  1e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.563846  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>