More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0172 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0172  aminotransferase class V  100 
 
 		 384 aa  791    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.921523  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08616  iron-sulfur cofactor synthesis protein  59.04 
 
 		 382 aa  456  1e-127  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2511  aminotransferase, class V  58.99 
 
 		 389 aa  452  1.0000000000000001e-126  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4416  aminotransferase class V  47.61 
 
 		 382 aa  352  5.9999999999999994e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3485  cysteine desulfurase  46.28 
 
 		 375 aa  340  4e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0611643 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0017  aminotransferase class V  45.65 
 
 		 379 aa  337  2.9999999999999997e-91  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1845  Cysteine desulfurase  45.24 
 
 		 375 aa  337  2.9999999999999997e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.993299 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1497  Cysteine desulfurase  45.87 
 
 		 389 aa  324  2e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1413  Cysteine desulfurase  44.06 
 
 		 381 aa  311  1e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.12128 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  40.53 
 
 		 392 aa  293  5e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  41.58 
 
 		 384 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2049  aminotransferase class V  42.37 
 
 		 402 aa  283  4.0000000000000003e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  40.99 
 
 		 394 aa  283  5.000000000000001e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  39.01 
 
 		 392 aa  281  1e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  41.69 
 
 		 384 aa  281  2e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  40.94 
 
 		 398 aa  279  5e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  41.84 
 
 		 394 aa  279  6e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  39.63 
 
 		 394 aa  273  3e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  38.2 
 
 		 382 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1713  aminotransferase class V  39.53 
 
 		 380 aa  271  2e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.229931  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1680  aminotransferase, class V  39.53 
 
 		 380 aa  271  2e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.399532  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  41.25 
 
 		 392 aa  268  1e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1186  aminotransferase, class V  39.06 
 
 		 380 aa  267  2e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1403  aminotransferase, class V  41.1 
 
 		 381 aa  267  2e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.862736  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0341  cysteine desulfurase  38.99 
 
 		 388 aa  268  2e-70  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1667  aminotransferase, class V  40.84 
 
 		 381 aa  266  5.999999999999999e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  38.36 
 
 		 396 aa  263  3e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2025  aminotransferase, class V  40 
 
 		 383 aa  262  6e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4244  aminotransferase class V  39.3 
 
 		 381 aa  262  6e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00204023  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4480  aminotransferase, class V  39.04 
 
 		 381 aa  261  1e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.921351  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  39.21 
 
 		 398 aa  261  2e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  39.21 
 
 		 398 aa  261  2e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1215  aminotransferase class V  40.58 
 
 		 390 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.727858  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3109  aminotransferase class V  38.68 
 
 		 381 aa  258  1e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00030249  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  37.34 
 
 		 402 aa  258  1e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4530  aminotransferase, class V  38.77 
 
 		 381 aa  258  1e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000702151  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2232  aminotransferase class V  38.5 
 
 		 401 aa  258  2e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4129  aminotransferase, class V  38.24 
 
 		 381 aa  258  2e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00019108  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  37.66 
 
 		 388 aa  258  2e-67  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1098  cysteine desulphurase  39.21 
 
 		 371 aa  257  3e-67  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4477  aminotransferase, class V  38.24 
 
 		 381 aa  257  3e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.508200000000001e-19 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  38.26 
 
 		 398 aa  256  6e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  37.73 
 
 		 414 aa  256  6e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  38.16 
 
 		 403 aa  255  9e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  38.06 
 
 		 389 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0719  aminotransferase, class V  37.43 
 
 		 381 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000547846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2363  aminotransferase, class V  37.4 
 
 		 398 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.197402  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4140  aminotransferase, class V  37.97 
 
 		 381 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000996508  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  38.06 
 
 		 398 aa  254  2.0000000000000002e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  39.01 
 
 		 400 aa  253  3e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  37.43 
 
 		 404 aa  253  5.000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4292  aminotransferase, class V  37.97 
 
 		 381 aa  252  6e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000991667  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2498  aminotransferase class V  37.37 
 
 		 381 aa  252  6e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4626  aminotransferase, class V  37.97 
 
 		 381 aa  252  6e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.058165  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  37.7 
 
 		 398 aa  251  1e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4517  aminotransferase, class V  37.17 
 
 		 381 aa  251  1e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0024603  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2431  aminotransferase, class V  38.48 
 
 		 390 aa  250  3e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  36.77 
 
 		 384 aa  249  4e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  37.88 
 
 		 409 aa  249  5e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  38.74 
 
 		 396 aa  249  5e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0206  IscS protein  36.81 
 
 		 397 aa  249  5e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.264012  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3063  aminotransferase, class V  35.71 
 
 		 383 aa  249  5e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0588987  unclonable  0.000000817205 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0953  Cysteine desulfurase  35.7 
 
 		 380 aa  248  1e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  37.27 
 
 		 399 aa  248  1e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  37.63 
 
 		 404 aa  248  1e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1099  aminotransferase class V  39.9 
 
 		 378 aa  248  1e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.386639  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2002  aminotransferase class V  37.14 
 
 		 401 aa  248  1e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.557544 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2175  aminotransferase class V  36.62 
 
 		 398 aa  248  1e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.670004  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1939  aminotransferase class V  36.72 
 
 		 388 aa  247  3e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024706 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0235  IscS protein  36.69 
 
 		 398 aa  247  3e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0688  aminotransferase, class V  34.74 
 
 		 418 aa  245  9e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.446364  normal  0.630962 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0365  aminotransferase class V  36.6 
 
 		 401 aa  245  9.999999999999999e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0437125  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  36.15 
 
 		 379 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3031  cysteine desulfurase  35.06 
 
 		 404 aa  245  9.999999999999999e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.563846  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22050  aminotransferase class V  38.7 
 
 		 381 aa  245  9.999999999999999e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.718227  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0988  cysteine desulfurase  37.6 
 
 		 384 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00170746  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1356  cysteine desulfurase NifS  38.16 
 
 		 402 aa  244  1.9999999999999999e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  37.57 
 
 		 393 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1191  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  38.58 
 
 		 384 aa  243  3e-63  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  36.41 
 
 		 382 aa  243  3e-63  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  39.47 
 
 		 396 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0277  cysteine desulfurase  36.88 
 
 		 404 aa  243  3.9999999999999997e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0284858  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1244  cysteine desulfurase  35.06 
 
 		 404 aa  242  7.999999999999999e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0469  cysteine desulfurase IscS  36.65 
 
 		 419 aa  242  1e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00221025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2917  cysteine desulfurase  34.55 
 
 		 404 aa  240  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2698  cysteine desulfurase  34.55 
 
 		 404 aa  240  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.016381  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  34.46 
 
 		 396 aa  240  2e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2742  cysteine desulfurase  34.55 
 
 		 404 aa  240  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.46384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2805  cysteine desulfurase  34.55 
 
 		 404 aa  240  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2783  cysteine desulfurase  34.55 
 
 		 404 aa  240  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0158517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1426  aminotransferase (class V), putative  35.79 
 
 		 370 aa  241  2e-62  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1493  cysteine desulfurase IscS  36.39 
 
 		 419 aa  241  2e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1142  cysteine desulfurase  36.55 
 
 		 384 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.165458  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0108  aminotransferase class V  37.63 
 
 		 400 aa  240  2.9999999999999997e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.702313 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1872  aminotransferase, class V  36.15 
 
 		 400 aa  240  2.9999999999999997e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.175027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2317  cysteine desulfurase  35.32 
 
 		 404 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.459864  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1138  cysteine desulfurase IscS  34.55 
 
 		 404 aa  240  4e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2815  cysteine desulfurase  34.55 
 
 		 404 aa  240  4e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00976282  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2681  cysteine desulfurase  34.55 
 
 		 404 aa  240  4e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.174524  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3762  cysteine desulfurase  34.55 
 
 		 404 aa  240  4e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00149492  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>