More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1497 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1497  Cysteine desulfurase  100 
 
 		 389 aa  800    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4416  aminotransferase class V  72.7 
 
 		 382 aa  568  1e-161  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3485  cysteine desulfurase  61.13 
 
 		 375 aa  461  1e-129  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0611643 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1413  Cysteine desulfurase  64.04 
 
 		 381 aa  451  1e-125  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.12128 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1845  Cysteine desulfurase  59.41 
 
 		 375 aa  442  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.993299 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0017  aminotransferase class V  55.44 
 
 		 379 aa  419  1e-116  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08616  iron-sulfur cofactor synthesis protein  50 
 
 		 382 aa  384  1e-105  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2049  aminotransferase class V  49.47 
 
 		 402 aa  365  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2511  aminotransferase, class V  48.13 
 
 		 389 aa  359  4e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0172  aminotransferase class V  45.87 
 
 		 384 aa  345  8e-94  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.921523  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  42.18 
 
 		 392 aa  290  2e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  42.67 
 
 		 392 aa  288  1e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3109  aminotransferase class V  42.41 
 
 		 381 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00030249  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  42.13 
 
 		 396 aa  283  4.0000000000000003e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  43.05 
 
 		 404 aa  283  4.0000000000000003e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2498  aminotransferase class V  42.41 
 
 		 381 aa  282  8.000000000000001e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  42.75 
 
 		 384 aa  281  1e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  43.31 
 
 		 394 aa  279  5e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0953  Cysteine desulfurase  42.15 
 
 		 380 aa  277  3e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  42.04 
 
 		 384 aa  276  7e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  42.71 
 
 		 398 aa  275  8e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  41.41 
 
 		 379 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  42.71 
 
 		 394 aa  274  2.0000000000000002e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  41.21 
 
 		 400 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2296  aminotransferase, class V  41.47 
 
 		 394 aa  273  4.0000000000000004e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  39.79 
 
 		 398 aa  271  1e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  42.67 
 
 		 394 aa  270  2e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  42.18 
 
 		 398 aa  270  2.9999999999999997e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  42.18 
 
 		 398 aa  270  2.9999999999999997e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4244  aminotransferase class V  40.31 
 
 		 381 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00204023  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  41.15 
 
 		 396 aa  270  4e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4480  aminotransferase, class V  40.05 
 
 		 381 aa  269  8e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.921351  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1186  aminotransferase, class V  41.97 
 
 		 380 aa  268  8.999999999999999e-71  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4530  aminotransferase, class V  40.31 
 
 		 381 aa  268  8.999999999999999e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000702151  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4140  aminotransferase, class V  40.31 
 
 		 381 aa  268  2e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000996508  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4477  aminotransferase, class V  40.05 
 
 		 381 aa  267  2e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.508200000000001e-19 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4517  aminotransferase, class V  40.05 
 
 		 381 aa  267  2e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0024603  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0108  aminotransferase class V  42.15 
 
 		 400 aa  266  2.9999999999999995e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.702313 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4129  aminotransferase, class V  39.79 
 
 		 381 aa  266  4e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00019108  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  38.98 
 
 		 384 aa  264  2e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  40.21 
 
 		 399 aa  264  2e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0719  aminotransferase, class V  39.53 
 
 		 381 aa  264  2e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000547846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  40.37 
 
 		 382 aa  263  3e-69  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4292  aminotransferase, class V  39.79 
 
 		 381 aa  263  4e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000991667  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4626  aminotransferase, class V  39.79 
 
 		 381 aa  263  4e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.058165  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1939  aminotransferase class V  40.05 
 
 		 388 aa  262  6e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024706 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0341  cysteine desulfurase  38.83 
 
 		 388 aa  262  6.999999999999999e-69  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0437  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  40.98 
 
 		 388 aa  262  6.999999999999999e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00696357  normal  0.223385 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  41.51 
 
 		 392 aa  260  2e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0100  cysteine desulfurase NifS  40.26 
 
 		 400 aa  261  2e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  38.64 
 
 		 389 aa  260  2e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  41.33 
 
 		 409 aa  260  4e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  40.21 
 
 		 398 aa  259  8e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  39.79 
 
 		 402 aa  259  8e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2683  aminotransferase, class V  40.63 
 
 		 393 aa  258  9e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0397114 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  39.58 
 
 		 400 aa  258  1e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  39.69 
 
 		 396 aa  256  4e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2431  aminotransferase, class V  40.31 
 
 		 390 aa  256  5e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  40.84 
 
 		 396 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  39.01 
 
 		 403 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  38.74 
 
 		 414 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  39.1 
 
 		 398 aa  252  7e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  39.47 
 
 		 407 aa  252  9.000000000000001e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0356  aminotransferase, class V  40 
 
 		 390 aa  252  9.000000000000001e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.230832 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1215  aminotransferase class V  41.18 
 
 		 390 aa  251  1e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.727858  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2362  cysteine desulfurase NifS  39.22 
 
 		 399 aa  251  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1356  cysteine desulfurase NifS  38.48 
 
 		 402 aa  251  2e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4262  aminotransferase class V  41.87 
 
 		 395 aa  250  3e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  38.56 
 
 		 393 aa  249  5e-65  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1019  pyridoxal-phosphate-dependent aminotransferase (NIFS protein)  38.54 
 
 		 405 aa  249  6e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.103423  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3416  aminotransferase class V  39.53 
 
 		 399 aa  249  6e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.425221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1680  aminotransferase, class V  38.9 
 
 		 380 aa  248  2e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.399532  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1713  aminotransferase class V  38.9 
 
 		 380 aa  248  2e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.229931  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2363  aminotransferase, class V  40.31 
 
 		 398 aa  247  2e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.197402  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2175  aminotransferase class V  39.74 
 
 		 398 aa  246  3e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.670004  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2025  aminotransferase, class V  37.5 
 
 		 383 aa  247  3e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3620  cysteine desulfurase NifS  39.28 
 
 		 400 aa  247  3e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.190149 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1833  aminotransferase, class V  36.84 
 
 		 389 aa  247  3e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0175075  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1058  cysteine desulfurase  38.54 
 
 		 405 aa  246  4.9999999999999997e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0834623  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1558  cysteine desulfurase NifS  38.48 
 
 		 400 aa  246  4.9999999999999997e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0572612  normal  0.890663 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2232  aminotransferase class V  40.26 
 
 		 401 aa  246  6.999999999999999e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1569  cysteine desulfurase NifS  38.24 
 
 		 389 aa  245  8e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00349258  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  36.72 
 
 		 382 aa  245  8e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2179  cysteine desulfurase  38.64 
 
 		 373 aa  245  8e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0437  cysteine desulfurase NifS  39.36 
 
 		 386 aa  245  9.999999999999999e-64  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.361233 
 
 
-
 
NC_002936  DET0248  cysteine desulfurase  38.87 
 
 		 383 aa  244  9.999999999999999e-64  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0166722  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2243  aminotransferase class V  38.26 
 
 		 380 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  38.16 
 
 		 388 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  39.27 
 
 		 404 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1403  aminotransferase, class V  38.74 
 
 		 381 aa  243  3e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.862736  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  38.22 
 
 		 394 aa  243  5e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1667  aminotransferase, class V  38.36 
 
 		 381 aa  243  6e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2647  cysteine desulfurase NifS  38.24 
 
 		 389 aa  242  7e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00311085 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0949  cysteine desulfurase IscS  38.02 
 
 		 405 aa  242  7e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0399375 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0884  cysteine desulfurase IscS  38.02 
 
 		 405 aa  242  7e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.293282  normal  0.187166 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2002  aminotransferase class V  38.87 
 
 		 401 aa  242  9e-63  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.557544 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_70  aminotransferase, class V  38.61 
 
 		 383 aa  241  1e-62  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2630  aminotransferase class V  39.84 
 
 		 1143 aa  242  1e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2004  aminotransferase, class V  37.76 
 
 		 399 aa  241  2e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0411095  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2368  aminotransferase, class V  37.76 
 
 		 399 aa  241  2e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0313381  normal  0.503368 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>