More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1215 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1215  aminotransferase class V  100 
 
 		 390 aa  780    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.727858  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  50.91 
 
 		 392 aa  378  1e-104  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  48.69 
 
 		 392 aa  379  1e-104  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  49.87 
 
 		 384 aa  377  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  49.87 
 
 		 384 aa  375  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  48.83 
 
 		 414 aa  372  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  48.96 
 
 		 394 aa  369  1e-101  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  48.45 
 
 		 394 aa  366  1e-100  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  48.04 
 
 		 402 aa  365  1e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  48.43 
 
 		 394 aa  359  4e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  47.68 
 
 		 398 aa  359  4e-98  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  45.71 
 
 		 398 aa  353  4e-96  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  45.71 
 
 		 398 aa  353  4e-96  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  46.07 
 
 		 400 aa  349  6e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  48.72 
 
 		 398 aa  346  3e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2498  aminotransferase class V  47.26 
 
 		 381 aa  343  2e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  50 
 
 		 392 aa  343  4e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  49.87 
 
 		 409 aa  341  1e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  46.86 
 
 		 400 aa  340  2.9999999999999998e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2431  aminotransferase, class V  49.48 
 
 		 390 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  47.81 
 
 		 382 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  47.26 
 
 		 403 aa  339  5e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  46.75 
 
 		 389 aa  339  5.9999999999999996e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  46.91 
 
 		 398 aa  339  5.9999999999999996e-92  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3109  aminotransferase class V  47.66 
 
 		 381 aa  338  8e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00030249  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  45.13 
 
 		 396 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  46.51 
 
 		 399 aa  335  7.999999999999999e-91  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1932  cysteine desulfurase NifS  47.14 
 
 		 393 aa  332  5e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  48.56 
 
 		 404 aa  332  5e-90  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4129  aminotransferase, class V  47.4 
 
 		 381 aa  332  7.000000000000001e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00019108  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0341  cysteine desulfurase  44.53 
 
 		 388 aa  332  8e-90  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  44.79 
 
 		 398 aa  331  1e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  42.49 
 
 		 382 aa  331  2e-89  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4292  aminotransferase, class V  47.14 
 
 		 381 aa  329  6e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000991667  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4477  aminotransferase, class V  47.14 
 
 		 381 aa  329  6e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.508200000000001e-19 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4626  aminotransferase, class V  47.14 
 
 		 381 aa  329  6e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.058165  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4244  aminotransferase class V  46.61 
 
 		 381 aa  328  8e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00204023  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4480  aminotransferase, class V  47.27 
 
 		 381 aa  328  9e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.921351  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  46.63 
 
 		 388 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2362  cysteine desulfurase NifS  45.31 
 
 		 399 aa  327  1.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  45.43 
 
 		 396 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4530  aminotransferase, class V  47.27 
 
 		 381 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000702151  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  45.66 
 
 		 396 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4517  aminotransferase, class V  46.35 
 
 		 381 aa  326  5e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0024603  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4140  aminotransferase, class V  46.88 
 
 		 381 aa  325  6e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000996508  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  47 
 
 		 379 aa  325  8.000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0719  aminotransferase, class V  46.09 
 
 		 381 aa  324  1e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000547846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0953  Cysteine desulfurase  47.26 
 
 		 380 aa  324  2e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  43.19 
 
 		 404 aa  323  3e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1939  aminotransferase class V  46.92 
 
 		 388 aa  323  4e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024706 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4262  aminotransferase class V  48.86 
 
 		 395 aa  323  4e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2647  cysteine desulfurase NifS  46.46 
 
 		 389 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00311085 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1356  cysteine desulfurase NifS  45.14 
 
 		 402 aa  321  1.9999999999999998e-86  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3031  cysteine desulfurase  46.25 
 
 		 404 aa  319  6e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.563846  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1569  cysteine desulfurase NifS  46.19 
 
 		 389 aa  319  6e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00349258  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_70  aminotransferase, class V  45.55 
 
 		 383 aa  319  7e-86  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1811  cysteine desulfurase NifS  46.19 
 
 		 401 aa  317  2e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1783  cysteine desulfurase NifS  46.19 
 
 		 401 aa  317  2e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0504  cysteine desulfurase NifS  46.09 
 
 		 402 aa  317  2e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0248  cysteine desulfurase  45.55 
 
 		 383 aa  317  3e-85  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0166722  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  42.3 
 
 		 407 aa  315  9.999999999999999e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2122  cysteine desulfurase NifS  44.62 
 
 		 401 aa  314  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31758 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  46.48 
 
 		 394 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1592  Cysteine desulfurase  52.86 
 
 		 378 aa  313  2.9999999999999996e-84  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0178166 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  42.16 
 
 		 393 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  44.5 
 
 		 396 aa  312  5.999999999999999e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1833  aminotransferase, class V  43.31 
 
 		 389 aa  312  5.999999999999999e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0175075  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2683  aminotransferase, class V  44.91 
 
 		 393 aa  312  7.999999999999999e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0397114 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1515  aminotransferase, class V:aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  44.24 
 
 		 404 aa  311  9e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.894831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  44.3 
 
 		 384 aa  311  1e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1244  cysteine desulfurase  45.74 
 
 		 404 aa  310  2e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2275  aminotransferase, class V  45.64 
 
 		 386 aa  311  2e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4134  aminotransferase, class V  42.93 
 
 		 400 aa  310  2e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0486971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0437  cysteine desulfurase NifS  44.01 
 
 		 386 aa  310  2.9999999999999997e-83  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.361233 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2025  aminotransferase, class V  43.47 
 
 		 383 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2655  cysteine desulfurase  44.42 
 
 		 407 aa  310  4e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2733  cysteine desulfurase  44.16 
 
 		 407 aa  309  5e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0277  cysteine desulfurase  45.22 
 
 		 404 aa  309  5.9999999999999995e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0284858  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01055  cysteine desulfurase  45.48 
 
 		 404 aa  309  6.999999999999999e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1458  cysteine desulfurase  43.9 
 
 		 407 aa  308  8e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2783  cysteine desulfurase  44.96 
 
 		 404 aa  308  9e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0158517  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1019  pyridoxal-phosphate-dependent aminotransferase (NIFS protein)  44.9 
 
 		 405 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.103423  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1680  aminotransferase, class V  45.16 
 
 		 380 aa  308  1.0000000000000001e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.399532  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4245  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  43.81 
 
 		 398 aa  308  1.0000000000000001e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0100  cysteine desulfurase NifS  45.93 
 
 		 400 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1713  aminotransferase class V  45.16 
 
 		 380 aa  308  1.0000000000000001e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.229931  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2599  cysteine desulfurase  44.16 
 
 		 407 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129174  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004360  cysteine desulfurase  44.7 
 
 		 404 aa  307  2.0000000000000002e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.591204  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0484  aminotransferase, class V  44.3 
 
 		 417 aa  307  2.0000000000000002e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0750137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1581  aminotransferase, class V  47.69 
 
 		 1135 aa  307  2.0000000000000002e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.863454  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02422  cysteine desulfurase  44.7 
 
 		 404 aa  306  3e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.657115  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1138  cysteine desulfurase IscS  44.7 
 
 		 404 aa  306  3e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2681  cysteine desulfurase  44.7 
 
 		 404 aa  306  3e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.174524  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2805  cysteine desulfurase  44.7 
 
 		 404 aa  306  3e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02386  hypothetical protein  44.7 
 
 		 404 aa  306  3e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.730969  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1147  cysteine desulfurase  44.7 
 
 		 404 aa  306  3e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0105086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2917  cysteine desulfurase  44.7 
 
 		 404 aa  306  3e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2742  cysteine desulfurase  44.7 
 
 		 404 aa  306  3e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.46384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2683  cysteine desulfurase  44.7 
 
 		 404 aa  306  3e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.980146  normal  0.976252 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2905  cysteine desulfurase  44.7 
 
 		 404 aa  306  3e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0404853  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>