More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2511 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2511  aminotransferase, class V  100 
 
 		 389 aa  803    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08616  iron-sulfur cofactor synthesis protein  56.88 
 
 		 382 aa  459  9.999999999999999e-129  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0172  aminotransferase class V  58.99 
 
 		 384 aa  452  1.0000000000000001e-126  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.921523  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4416  aminotransferase class V  48.26 
 
 		 382 aa  368  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3485  cysteine desulfurase  46.65 
 
 		 375 aa  347  2e-94  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0611643 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1497  Cysteine desulfurase  48.13 
 
 		 389 aa  338  7e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1845  Cysteine desulfurase  43.42 
 
 		 375 aa  332  8e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.993299 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1413  Cysteine desulfurase  44.18 
 
 		 381 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.12128 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0017  aminotransferase class V  43.47 
 
 		 379 aa  315  6e-85  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2049  aminotransferase class V  41.71 
 
 		 402 aa  307  2.0000000000000002e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  40.58 
 
 		 392 aa  286  5.999999999999999e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  39.84 
 
 		 398 aa  283  4.0000000000000003e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  39.84 
 
 		 398 aa  283  4.0000000000000003e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  40.16 
 
 		 398 aa  280  3e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  41.11 
 
 		 394 aa  280  4e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  38.99 
 
 		 392 aa  278  1e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  39.36 
 
 		 396 aa  276  4e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1098  cysteine desulphurase  40.11 
 
 		 371 aa  274  2.0000000000000002e-72  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  41.11 
 
 		 384 aa  273  3e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2647  cysteine desulfurase NifS  39.63 
 
 		 389 aa  273  3e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00311085 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  40.58 
 
 		 384 aa  272  6e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0108  aminotransferase class V  40.32 
 
 		 400 aa  272  7e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.702313 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3109  aminotransferase class V  39.02 
 
 		 381 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00030249  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1833  aminotransferase, class V  39.36 
 
 		 389 aa  270  4e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0175075  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1099  aminotransferase class V  41.71 
 
 		 378 aa  270  4e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.386639  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  39.1 
 
 		 394 aa  269  5.9999999999999995e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1569  cysteine desulfurase NifS  39.1 
 
 		 389 aa  269  8e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00349258  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2683  aminotransferase, class V  38.56 
 
 		 393 aa  266  5.999999999999999e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0397114 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  38.83 
 
 		 384 aa  264  2e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  39.15 
 
 		 394 aa  264  2e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0437  cysteine desulfurase NifS  39.52 
 
 		 386 aa  264  2e-69  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.361233 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  38.26 
 
 		 400 aa  263  3e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  38.36 
 
 		 414 aa  264  3e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2232  aminotransferase class V  39.69 
 
 		 401 aa  263  3e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  38.1 
 
 		 398 aa  263  3e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4244  aminotransferase class V  38.75 
 
 		 381 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00204023  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  37.43 
 
 		 399 aa  261  1e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0953  Cysteine desulfurase  37.37 
 
 		 380 aa  261  1e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0719  aminotransferase, class V  38.21 
 
 		 381 aa  260  2e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000547846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2182  aminotransferase, class V  39.42 
 
 		 388 aa  260  3e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.186921 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  36.73 
 
 		 389 aa  260  4e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  36.97 
 
 		 404 aa  259  5.0000000000000005e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4129  aminotransferase, class V  37.94 
 
 		 381 aa  259  6e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00019108  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0530  cysteine desulfurase  39.52 
 
 		 387 aa  258  9e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.103474  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4477  aminotransferase, class V  37.94 
 
 		 381 aa  258  9e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.508200000000001e-19 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1186  aminotransferase, class V  38.03 
 
 		 380 aa  258  1e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4480  aminotransferase, class V  37.67 
 
 		 381 aa  258  1e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.921351  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2002  aminotransferase class V  38.48 
 
 		 401 aa  258  1e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.557544 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4530  aminotransferase, class V  37.67 
 
 		 381 aa  258  2e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000702151  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4517  aminotransferase, class V  37.94 
 
 		 381 aa  258  2e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0024603  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2025  aminotransferase, class V  38.77 
 
 		 383 aa  257  3e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0100  cysteine desulfurase NifS  38.03 
 
 		 400 aa  257  3e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1680  aminotransferase, class V  38.56 
 
 		 380 aa  256  4e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.399532  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1713  aminotransferase class V  38.56 
 
 		 380 aa  256  4e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.229931  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4140  aminotransferase, class V  37.67 
 
 		 381 aa  256  5e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000996508  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2498  aminotransferase class V  37.67 
 
 		 381 aa  256  5e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  36.94 
 
 		 382 aa  256  5e-67  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  37.83 
 
 		 398 aa  256  6e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1215  aminotransferase class V  38.42 
 
 		 390 aa  255  8e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.727858  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  37.23 
 
 		 404 aa  255  8e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  36.51 
 
 		 396 aa  255  8e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0603  aminotransferase, class V  40.05 
 
 		 384 aa  254  1.0000000000000001e-66  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4292  aminotransferase, class V  37.67 
 
 		 381 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000991667  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  37.63 
 
 		 396 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0206  IscS protein  36.6 
 
 		 397 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.264012  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0992  cysteine desulfurase  39.05 
 
 		 391 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00026474  normal  0.256714 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4626  aminotransferase, class V  37.67 
 
 		 381 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.058165  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1403  aminotransferase, class V  39.57 
 
 		 381 aa  254  2.0000000000000002e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.862736  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  38.24 
 
 		 409 aa  254  2.0000000000000002e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1607  cysteine desulfurase NifS  39.1 
 
 		 388 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.76832  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2015  aminotransferase, class V  38.2 
 
 		 391 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0118596  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1257  aminotransferase, class V  38.2 
 
 		 387 aa  253  3e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1667  aminotransferase, class V  39.84 
 
 		 381 aa  253  3e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2154  cysteine desulfurase, NifS family  38.61 
 
 		 396 aa  253  4.0000000000000004e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  37.4 
 
 		 392 aa  253  4.0000000000000004e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2296  aminotransferase, class V  35.64 
 
 		 394 aa  253  6e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  38.1 
 
 		 402 aa  252  7e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2363  aminotransferase, class V  38.1 
 
 		 398 aa  251  1e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.197402  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  36.17 
 
 		 407 aa  251  2e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0341  cysteine desulfurase  38.01 
 
 		 388 aa  250  2e-65  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0365  aminotransferase class V  37.8 
 
 		 401 aa  251  2e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0437125  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1558  cysteine desulfurase NifS  37.14 
 
 		 400 aa  250  2e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0572612  normal  0.890663 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4134  aminotransferase, class V  37.37 
 
 		 400 aa  250  3e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0486971  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2011  cysteine desulfurase  38.62 
 
 		 391 aa  250  4e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.079673  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2431  aminotransferase, class V  36.17 
 
 		 390 aa  249  4e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1583  aminotransferase class V  38.89 
 
 		 1139 aa  249  6e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0504  cysteine desulfurase NifS  37.4 
 
 		 402 aa  249  6e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2175  aminotransferase class V  36.77 
 
 		 398 aa  249  7e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.670004  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1932  cysteine desulfurase NifS  39.08 
 
 		 393 aa  249  8e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  36.97 
 
 		 400 aa  248  1e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22050  aminotransferase class V  38.1 
 
 		 381 aa  248  1e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.718227  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0235  IscS protein  37.01 
 
 		 398 aa  248  1e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  37 
 
 		 393 aa  247  2e-64  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_002936  DET0248  cysteine desulfurase  35.85 
 
 		 383 aa  246  3e-64  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0166722  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1331  aminotransferase, class V  38.36 
 
 		 380 aa  247  3e-64  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000957833  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1273  cysteine desulfhydrase  38.36 
 
 		 380 aa  247  3e-64  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.000000190468  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2630  aminotransferase class V  38.34 
 
 		 1143 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0988  cysteine desulfurase  38.83 
 
 		 384 aa  246  6e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00170746  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1811  cysteine desulfurase NifS  38.07 
 
 		 401 aa  244  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1783  cysteine desulfurase NifS  38.07 
 
 		 401 aa  244  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>