More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4416 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4416  aminotransferase class V  100 
 
 		 382 aa  779    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1497  Cysteine desulfurase  72.7 
 
 		 389 aa  545  1e-154  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3485  cysteine desulfurase  61.29 
 
 		 375 aa  464  1e-129  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0611643 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1413  Cysteine desulfurase  63.07 
 
 		 381 aa  456  1e-127  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.12128 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1845  Cysteine desulfurase  59.73 
 
 		 375 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.993299 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0017  aminotransferase class V  52.8 
 
 		 379 aa  399  9.999999999999999e-111  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2049  aminotransferase class V  51.17 
 
 		 402 aa  392  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2511  aminotransferase, class V  48.26 
 
 		 389 aa  368  1e-101  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08616  iron-sulfur cofactor synthesis protein  47.49 
 
 		 382 aa  364  1e-99  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0172  aminotransferase class V  47.61 
 
 		 384 aa  352  5.9999999999999994e-96  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.921523  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3109  aminotransferase class V  42.82 
 
 		 381 aa  295  7e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00030249  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  41.98 
 
 		 392 aa  293  5e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  42.15 
 
 		 384 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2498  aminotransferase class V  41.73 
 
 		 381 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  41.99 
 
 		 384 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  41.98 
 
 		 398 aa  284  2.0000000000000002e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  41.22 
 
 		 392 aa  282  7.000000000000001e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4480  aminotransferase, class V  41.47 
 
 		 381 aa  281  9e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.921351  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  43.22 
 
 		 409 aa  281  1e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4244  aminotransferase class V  41.47 
 
 		 381 aa  280  4e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00204023  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  41.58 
 
 		 379 aa  279  4e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0719  aminotransferase, class V  42.04 
 
 		 381 aa  279  5e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000547846  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4129  aminotransferase, class V  41.51 
 
 		 381 aa  279  6e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00019108  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  42.93 
 
 		 398 aa  279  7e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4530  aminotransferase, class V  41.21 
 
 		 381 aa  279  7e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000702151  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  42.93 
 
 		 398 aa  279  7e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  41.82 
 
 		 394 aa  278  1e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4477  aminotransferase, class V  41.21 
 
 		 381 aa  278  1e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.508200000000001e-19 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  41.87 
 
 		 400 aa  277  2e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4140  aminotransferase, class V  41.21 
 
 		 381 aa  276  3e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000996508  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4517  aminotransferase, class V  41.78 
 
 		 381 aa  276  4e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0024603  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4292  aminotransferase, class V  40.94 
 
 		 381 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000991667  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4626  aminotransferase, class V  40.94 
 
 		 381 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.058165  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  39.47 
 
 		 396 aa  273  3e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  39.25 
 
 		 396 aa  272  5.000000000000001e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0953  Cysteine desulfurase  41.88 
 
 		 380 aa  273  5.000000000000001e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  40.8 
 
 		 398 aa  272  6e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1215  aminotransferase class V  41.19 
 
 		 390 aa  272  7e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.727858  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  41.71 
 
 		 394 aa  270  2e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  41.62 
 
 		 394 aa  270  2e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1186  aminotransferase, class V  40.58 
 
 		 380 aa  268  1e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  40.8 
 
 		 399 aa  268  1e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  40.58 
 
 		 396 aa  267  2e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0437  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  41.84 
 
 		 388 aa  267  2e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00696357  normal  0.223385 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  41.58 
 
 		 396 aa  266  5e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  40.81 
 
 		 398 aa  266  5.999999999999999e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  39.41 
 
 		 398 aa  265  1e-69  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  38.17 
 
 		 382 aa  263  3e-69  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0341  cysteine desulfurase  38.93 
 
 		 388 aa  262  6.999999999999999e-69  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  39.63 
 
 		 402 aa  261  1e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4262  aminotransferase class V  41.98 
 
 		 395 aa  260  2e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2296  aminotransferase, class V  38.62 
 
 		 394 aa  261  2e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3416  aminotransferase class V  41.25 
 
 		 399 aa  260  3e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.425221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0988  cysteine desulfurase  39.58 
 
 		 384 aa  260  3e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00170746  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  39.25 
 
 		 404 aa  260  3e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  39.63 
 
 		 388 aa  259  4e-68  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1142  cysteine desulfurase  40.37 
 
 		 384 aa  259  4e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.165458  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2175  aminotransferase class V  39.49 
 
 		 398 aa  259  6e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.670004  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1713  aminotransferase class V  38.74 
 
 		 380 aa  259  7e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.229931  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1680  aminotransferase, class V  38.74 
 
 		 380 aa  259  7e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.399532  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  37.6 
 
 		 384 aa  258  8e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0248  cysteine desulfurase  39.35 
 
 		 383 aa  258  9e-68  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0166722  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2431  aminotransferase, class V  39.43 
 
 		 390 aa  256  6e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  39.33 
 
 		 392 aa  254  1.0000000000000001e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0235  IscS protein  39.53 
 
 		 398 aa  255  1.0000000000000001e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_70  aminotransferase, class V  38.54 
 
 		 383 aa  255  1.0000000000000001e-66  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0100  cysteine desulfurase NifS  40.16 
 
 		 400 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0504  cysteine desulfurase NifS  39.84 
 
 		 402 aa  253  3e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  39.73 
 
 		 393 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  38.58 
 
 		 403 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2363  aminotransferase, class V  39.37 
 
 		 398 aa  253  4.0000000000000004e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.197402  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2579  cysteine desulfurase  39.31 
 
 		 407 aa  252  7e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120053  hitchhiker  0.000683499 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0108  aminotransferase class V  38.34 
 
 		 400 aa  252  7e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.702313 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1344  aminotransferase class V  40.62 
 
 		 406 aa  252  8.000000000000001e-66  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2002  aminotransferase class V  40.41 
 
 		 401 aa  251  1e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.557544 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2683  aminotransferase, class V  39.52 
 
 		 393 aa  251  1e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0397114 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  38.56 
 
 		 414 aa  251  1e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1458  cysteine desulfurase  38.26 
 
 		 407 aa  250  3e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1558  cysteine desulfurase NifS  37.89 
 
 		 400 aa  249  5e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0572612  normal  0.890663 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2275  aminotransferase, class V  40.37 
 
 		 386 aa  249  5e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  36.94 
 
 		 389 aa  249  5e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2362  cysteine desulfurase NifS  37.04 
 
 		 399 aa  249  7e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1092  Cysteine desulfurase  39.43 
 
 		 388 aa  249  8e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.793736 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  39.2 
 
 		 394 aa  248  1e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  36.81 
 
 		 382 aa  248  1e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2025  aminotransferase, class V  37.33 
 
 		 383 aa  248  1e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1939  aminotransferase class V  37.63 
 
 		 388 aa  247  2e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024706 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1360  cysteine desulfurase IscS  40.48 
 
 		 408 aa  248  2e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1833  aminotransferase, class V  38.42 
 
 		 389 aa  247  3e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0175075  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1875  cysteine desulfurase  38.79 
 
 		 407 aa  247  3e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.795233  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01055  cysteine desulfurase  38.95 
 
 		 404 aa  247  3e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2232  aminotransferase class V  39.69 
 
 		 401 aa  247  3e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0872  cysteine desulfurase  39.63 
 
 		 380 aa  246  4e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0149083 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1553  cysteine desulfurase  38.26 
 
 		 407 aa  246  4e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0484493  normal  0.0430953 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2655  cysteine desulfurase  38.52 
 
 		 407 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0277  cysteine desulfurase  40.16 
 
 		 404 aa  246  6e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0284858  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1019  pyridoxal-phosphate-dependent aminotransferase (NIFS protein)  37.73 
 
 		 405 aa  246  6.999999999999999e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.103423  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3063  aminotransferase, class V  37.89 
 
 		 383 aa  246  6.999999999999999e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0588987  unclonable  0.000000817205 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2733  cysteine desulfurase  38.26 
 
 		 407 aa  245  8e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  38.52 
 
 		 404 aa  245  9e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0940549 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>