More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_08616 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_08616  iron-sulfur cofactor synthesis protein  100 
 
 		 382 aa  788    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2511  aminotransferase, class V  56.88 
 
 		 389 aa  459  9.999999999999999e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0172  aminotransferase class V  59.04 
 
 		 384 aa  456  1e-127  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.921523  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1845  Cysteine desulfurase  49.21 
 
 		 375 aa  376  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.993299 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1497  Cysteine desulfurase  50 
 
 		 389 aa  365  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4416  aminotransferase class V  47.49 
 
 		 382 aa  364  1e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1413  Cysteine desulfurase  51.31 
 
 		 381 aa  362  8e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.12128 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0017  aminotransferase class V  48.38 
 
 		 379 aa  351  2e-95  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3485  cysteine desulfurase  47.86 
 
 		 375 aa  347  2e-94  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0611643 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2049  aminotransferase class V  43.98 
 
 		 402 aa  295  7e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  40.84 
 
 		 396 aa  288  1e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1186  aminotransferase, class V  41.07 
 
 		 380 aa  283  5.000000000000001e-75  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  40.27 
 
 		 392 aa  277  2e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1667  aminotransferase, class V  42.22 
 
 		 381 aa  277  2e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1403  aminotransferase, class V  41.95 
 
 		 381 aa  276  3e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.862736  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1680  aminotransferase, class V  40 
 
 		 380 aa  273  4.0000000000000004e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.399532  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1713  aminotransferase class V  40 
 
 		 380 aa  273  4.0000000000000004e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.229931  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  39.69 
 
 		 392 aa  273  5.000000000000001e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  40.58 
 
 		 394 aa  272  8.000000000000001e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3109  aminotransferase class V  41.32 
 
 		 381 aa  271  1e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00030249  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  39.04 
 
 		 404 aa  271  2e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  40.89 
 
 		 394 aa  271  2e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  40.21 
 
 		 384 aa  269  5.9999999999999995e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  39.3 
 
 		 384 aa  265  8.999999999999999e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2296  aminotransferase, class V  39.3 
 
 		 394 aa  265  8.999999999999999e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2647  cysteine desulfurase NifS  38.58 
 
 		 389 aa  265  8.999999999999999e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00311085 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4129  aminotransferase, class V  40.53 
 
 		 381 aa  265  1e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00019108  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4477  aminotransferase, class V  40.53 
 
 		 381 aa  265  1e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.508200000000001e-19 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4292  aminotransferase, class V  40.53 
 
 		 381 aa  264  2e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000991667  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4140  aminotransferase, class V  40.53 
 
 		 381 aa  264  2e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000996508  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4626  aminotransferase, class V  40.53 
 
 		 381 aa  264  2e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.058165  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4480  aminotransferase, class V  40 
 
 		 381 aa  263  3e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.921351  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1569  cysteine desulfurase NifS  39.04 
 
 		 389 aa  263  3e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00349258  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4244  aminotransferase class V  39.58 
 
 		 381 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00204023  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0341  cysteine desulfurase  38.06 
 
 		 388 aa  263  4.999999999999999e-69  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  41.56 
 
 		 392 aa  262  6e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0719  aminotransferase, class V  40.63 
 
 		 381 aa  262  6.999999999999999e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000547846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4530  aminotransferase, class V  40 
 
 		 381 aa  262  1e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000702151  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  40.96 
 
 		 398 aa  261  1e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  40.96 
 
 		 398 aa  261  1e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4517  aminotransferase, class V  40.37 
 
 		 381 aa  260  3e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0024603  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  39.43 
 
 		 384 aa  260  3e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  37.21 
 
 		 398 aa  260  4e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1215  aminotransferase class V  38.74 
 
 		 390 aa  258  1e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.727858  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1098  cysteine desulphurase  40.38 
 
 		 371 aa  258  2e-67  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1833  aminotransferase, class V  37.7 
 
 		 389 aa  257  2e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0175075  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  38.48 
 
 		 407 aa  257  3e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  37.24 
 
 		 414 aa  256  4e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2025  aminotransferase, class V  38.02 
 
 		 383 aa  256  5e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  39.16 
 
 		 396 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  38.82 
 
 		 402 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2232  aminotransferase class V  38.92 
 
 		 401 aa  255  1.0000000000000001e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2498  aminotransferase class V  39.2 
 
 		 381 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2175  aminotransferase class V  39.53 
 
 		 398 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.670004  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  40.36 
 
 		 400 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  39.12 
 
 		 398 aa  253  3e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  37.24 
 
 		 399 aa  253  3e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2363  aminotransferase, class V  39.79 
 
 		 398 aa  254  3e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.197402  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0100  cysteine desulfurase NifS  38.22 
 
 		 400 aa  253  5.000000000000001e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0108  aminotransferase class V  37.17 
 
 		 400 aa  252  7e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.702313 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2002  aminotransferase class V  39.79 
 
 		 401 aa  252  7e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.557544 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0235  IscS protein  38.5 
 
 		 398 aa  251  2e-65  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  37.8 
 
 		 382 aa  251  2e-65  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1607  cysteine desulfurase NifS  38.4 
 
 		 388 aa  250  2e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.76832  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  38.54 
 
 		 394 aa  250  3e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2352  aminotransferase class V  38.4 
 
 		 388 aa  250  4e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  37.66 
 
 		 396 aa  249  4e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0365  aminotransferase class V  39.02 
 
 		 401 aa  249  4e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0437125  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2431  aminotransferase, class V  38.9 
 
 		 390 aa  249  4e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0469  cysteine desulfurase IscS  37.63 
 
 		 419 aa  249  4e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00221025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  39.38 
 
 		 398 aa  249  7e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0504  cysteine desulfurase NifS  38.22 
 
 		 402 aa  249  8e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  37.6 
 
 		 404 aa  248  1e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2015  aminotransferase, class V  37.7 
 
 		 391 aa  248  1e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0118596  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0953  Cysteine desulfurase  38.24 
 
 		 380 aa  247  2e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0830  cysteine desulfurase IscS  37.01 
 
 		 407 aa  247  2e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.184128 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1583  aminotransferase class V  38.8 
 
 		 1139 aa  247  2e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  37.8 
 
 		 389 aa  247  2e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1493  cysteine desulfurase IscS  37.11 
 
 		 419 aa  247  3e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1458  cysteine desulfurase  36.22 
 
 		 407 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1811  cysteine desulfurase NifS  37.73 
 
 		 401 aa  246  6e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1783  cysteine desulfurase NifS  37.73 
 
 		 401 aa  246  6e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3027  cysteine desulfurase  36.39 
 
 		 404 aa  245  8e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0576674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2294  aminotransferase class V  37.9 
 
 		 385 aa  245  8e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000279611 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1244  cysteine desulfurase  37.27 
 
 		 404 aa  245  9.999999999999999e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2317  cysteine desulfurase  37.93 
 
 		 404 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.459864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4134  aminotransferase, class V  37.24 
 
 		 400 aa  244  9.999999999999999e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0486971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2698  cysteine desulfurase  36.22 
 
 		 404 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.016381  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2917  cysteine desulfurase  36.22 
 
 		 404 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2783  cysteine desulfurase  36.22 
 
 		 404 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0158517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  37.08 
 
 		 400 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3031  cysteine desulfurase  36.75 
 
 		 404 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.563846  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2805  cysteine desulfurase  36.22 
 
 		 404 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2742  cysteine desulfurase  36.22 
 
 		 404 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.46384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0277  cysteine desulfurase  37.01 
 
 		 404 aa  244  1.9999999999999999e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0284858  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0437  cysteine desulfurase NifS  38.02 
 
 		 386 aa  243  3e-63  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.361233 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0206  IscS protein  37.56 
 
 		 397 aa  244  3e-63  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.264012  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1138  cysteine desulfurase IscS  36.48 
 
 		 404 aa  243  5e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1147  cysteine desulfurase  36.48 
 
 		 404 aa  243  5e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0105086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2905  cysteine desulfurase  36.48 
 
 		 404 aa  243  5e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0404853  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>