More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2232 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_2002  aminotransferase class V  87.03 
 
 		 401 aa  736    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.557544 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0235  IscS protein  75.31 
 
 		 398 aa  637    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2232  aminotransferase class V  100 
 
 		 401 aa  824    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2363  aminotransferase, class V  74.81 
 
 		 398 aa  638    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.197402  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2175  aminotransferase class V  77.08 
 
 		 398 aa  653    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.670004  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0365  aminotransferase class V  74.56 
 
 		 401 aa  630  1e-179  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0437125  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0206  IscS protein  74.81 
 
 		 397 aa  624  1e-177  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.264012  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0534  aminotransferase class V  65.72 
 
 		 394 aa  515  1.0000000000000001e-145  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  49.87 
 
 		 392 aa  375  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  47.59 
 
 		 396 aa  369  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  45.82 
 
 		 392 aa  365  1e-100  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  48.96 
 
 		 399 aa  365  1e-100  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  49.74 
 
 		 400 aa  363  2e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  48.71 
 
 		 414 aa  361  1e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  48.58 
 
 		 382 aa  361  1e-98  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  48.58 
 
 		 394 aa  360  3e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  47.19 
 
 		 384 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  49.1 
 
 		 394 aa  357  1.9999999999999998e-97  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  47.3 
 
 		 384 aa  356  3.9999999999999996e-97  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  45.74 
 
 		 384 aa  355  6.999999999999999e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  46.72 
 
 		 404 aa  355  1e-96  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0100  cysteine desulfurase NifS  46.94 
 
 		 400 aa  354  2e-96  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  50 
 
 		 394 aa  353  2.9999999999999997e-96  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  46.43 
 
 		 398 aa  352  8e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  45.88 
 
 		 402 aa  348  1e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  48.34 
 
 		 396 aa  347  2e-94  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  46.35 
 
 		 398 aa  346  5e-94  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2431  aminotransferase, class V  48.35 
 
 		 390 aa  345  1e-93  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2647  cysteine desulfurase NifS  47.29 
 
 		 389 aa  342  7e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00311085 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0437  cysteine desulfurase NifS  47.94 
 
 		 386 aa  342  9e-93  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.361233 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2296  aminotransferase, class V  46.51 
 
 		 394 aa  341  2e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0504  cysteine desulfurase NifS  45.75 
 
 		 402 aa  339  4e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2275  aminotransferase, class V  46.06 
 
 		 386 aa  339  5e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  48.49 
 
 		 392 aa  338  7e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1569  cysteine desulfurase NifS  46.77 
 
 		 389 aa  338  8e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00349258  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  46.09 
 
 		 400 aa  338  9.999999999999999e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  43.62 
 
 		 407 aa  336  5e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2011  cysteine desulfurase  45.5 
 
 		 391 aa  334  2e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.079673  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1833  aminotransferase, class V  44.96 
 
 		 389 aa  333  3e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0175075  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01630  Nitrogen fixation cysteine desulfurase, nifS  44.95 
 
 		 402 aa  332  5e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  45.69 
 
 		 398 aa  332  8e-90  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  45.69 
 
 		 398 aa  332  8e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1783  cysteine desulfurase NifS  44.79 
 
 		 401 aa  331  1e-89  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1811  cysteine desulfurase NifS  44.79 
 
 		 401 aa  331  1e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2362  cysteine desulfurase NifS  44.7 
 
 		 399 aa  331  2e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  46.13 
 
 		 388 aa  330  2e-89  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1356  cysteine desulfurase NifS  45.61 
 
 		 402 aa  330  3e-89  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1607  cysteine desulfurase NifS  45.48 
 
 		 388 aa  329  5.0000000000000004e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.76832  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  45.04 
 
 		 393 aa  328  7e-89  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1507  cysteine desulfurase  44.22 
 
 		 402 aa  328  8e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2015  aminotransferase, class V  46.13 
 
 		 391 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0118596  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1558  cysteine desulfurase NifS  45.13 
 
 		 400 aa  327  2.0000000000000001e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0572612  normal  0.890663 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  44.47 
 
 		 398 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  46.56 
 
 		 409 aa  327  3e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2683  aminotransferase, class V  43.91 
 
 		 393 aa  326  4.0000000000000003e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0397114 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  43.78 
 
 		 404 aa  326  5e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1225  cysteine desulfurase NifS  44.07 
 
 		 397 aa  326  6e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000944956 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0992  cysteine desulfurase  44.22 
 
 		 391 aa  325  6e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00026474  normal  0.256714 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1515  aminotransferase, class V:aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  43.18 
 
 		 404 aa  325  1e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.894831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0953  Cysteine desulfurase  46.49 
 
 		 380 aa  325  1e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1257  aminotransferase, class V  46.53 
 
 		 387 aa  323  3e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  44.76 
 
 		 379 aa  323  4e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5907  cysteine desulfurase  45.94 
 
 		 404 aa  322  7e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.469117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  43.15 
 
 		 382 aa  322  7e-87  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  43.48 
 
 		 396 aa  321  9.999999999999999e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0108  aminotransferase class V  43.07 
 
 		 400 aa  321  9.999999999999999e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.702313 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2498  aminotransferase class V  46.22 
 
 		 381 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  43.88 
 
 		 398 aa  320  1.9999999999999998e-86  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2122  cysteine desulfurase NifS  45.83 
 
 		 401 aa  321  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31758 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4262  aminotransferase class V  46.56 
 
 		 395 aa  319  3.9999999999999996e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4245  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  42.29 
 
 		 398 aa  318  9e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1068  aminotransferase, class V  43.4 
 
 		 393 aa  318  1e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0344653  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4134  aminotransferase, class V  44.56 
 
 		 400 aa  318  1e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0486971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3620  cysteine desulfurase NifS  43.18 
 
 		 400 aa  317  3e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.190149 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1932  cysteine desulfurase NifS  44.92 
 
 		 393 aa  316  4e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2630  aminotransferase class V  45.16 
 
 		 1143 aa  315  8e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1939  aminotransferase class V  43.9 
 
 		 388 aa  313  3.9999999999999997e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024706 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  44.05 
 
 		 396 aa  310  2e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2182  aminotransferase, class V  45.5 
 
 		 388 aa  309  5e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.186921 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  42.34 
 
 		 389 aa  309  5.9999999999999995e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3581  cysteine desulfurase NifS  44.78 
 
 		 404 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.157563  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  42.82 
 
 		 403 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1583  aminotransferase class V  44.06 
 
 		 1139 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0530  cysteine desulfurase  44.99 
 
 		 387 aa  305  7e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.103474  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0341  cysteine desulfurase  40.89 
 
 		 388 aa  305  7e-82  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1581  aminotransferase, class V  44.36 
 
 		 1135 aa  305  8.000000000000001e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.863454  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  43.04 
 
 		 394 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3109  aminotransferase class V  44.09 
 
 		 381 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00030249  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3063  aminotransferase, class V  40.1 
 
 		 383 aa  302  9e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0588987  unclonable  0.000000817205 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1551  aminotransferase class V  42.97 
 
 		 383 aa  301  2e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4255  aminotransferase, class V  41.9 
 
 		 422 aa  301  2e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0595  putative pyridoxal-phosphate-dependent aminotransferase  43.88 
 
 		 390 aa  299  7e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1344  aminotransferase class V  40.51 
 
 		 406 aa  298  8e-80  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3569  aminotransferase class V  41.41 
 
 		 388 aa  298  1e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00955537  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0484  aminotransferase, class V  42.46 
 
 		 417 aa  297  2e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0750137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1058  cysteine desulfurase  42.89 
 
 		 405 aa  296  3e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0834623  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6331  cysteine desulfurase IscS  42.96 
 
 		 405 aa  296  6e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.134755  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0248  cysteine desulfurase  41.34 
 
 		 383 aa  295  1e-78  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0166722  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1563  cysteine desulfurase IscS  41.52 
 
 		 403 aa  295  1e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0688  cysteine desulfurase NifS  41.3 
 
 		 388 aa  295  1e-78  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0297222  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>