More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4255 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_4255  aminotransferase, class V  100 
 
 		 422 aa  839    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2105  aminotransferase, class V  83.72 
 
 		 397 aa  635    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1875  aminotransferase, class V  80.66 
 
 		 397 aa  591  1e-168  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1921  aminotransferase, class V  80.66 
 
 		 397 aa  591  1e-168  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.173921  normal  0.388642 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1855  aminotransferase, class V  80.41 
 
 		 397 aa  589  1e-167  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.712438  normal  0.9875 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13041  cysteine desulfurase iscS  78.02 
 
 		 393 aa  563  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315275  hitchhiker  0.00290952 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08620  cysteine desulfurase family protein  65.46 
 
 		 398 aa  478  1e-133  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.702147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3255  aminotransferase class V  65.9 
 
 		 413 aa  474  1e-132  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4089  Cysteine desulfurase  63.29 
 
 		 401 aa  473  1e-132  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1302  aminotransferase class V  64.95 
 
 		 390 aa  464  1e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2360  Cysteine desulfurase  61.14 
 
 		 387 aa  461  9.999999999999999e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.66071 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2729  aminotransferase, class V  62.02 
 
 		 408 aa  461  9.999999999999999e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.560546  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8110  Cysteine desulfurase  61.66 
 
 		 387 aa  456  1e-127  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6046  aminotransferase class V  63.08 
 
 		 391 aa  456  1e-127  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3569  aminotransferase class V  62.02 
 
 		 388 aa  457  1e-127  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00955537  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2844  aminotransferase class V  62.6 
 
 		 384 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0688  aminotransferase, class V  61.76 
 
 		 418 aa  452  1.0000000000000001e-126  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.446364  normal  0.630962 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10430  cysteine desulfurase family protein  59.6 
 
 		 412 aa  450  1e-125  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.182592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3446  aminotransferase, class V  60.61 
 
 		 399 aa  444  1e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.311876  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2910  Cysteine desulfurase  64.21 
 
 		 401 aa  441  9.999999999999999e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2457  aminotransferase class V  60.41 
 
 		 407 aa  439  9.999999999999999e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000191049 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1443  Cysteine desulfurase  60.78 
 
 		 400 aa  440  9.999999999999999e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.751675  normal  0.957597 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1722  aminotransferase class V  58.29 
 
 		 412 aa  435  1e-121  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.185065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0595  putative pyridoxal-phosphate-dependent aminotransferase  60.16 
 
 		 390 aa  427  1e-118  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1106  aminotransferase class V  64.49 
 
 		 391 aa  426  1e-118  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00753492 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1079  aminotransferase class V  58.97 
 
 		 419 aa  422  1e-117  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1213  aminotransferase, class V  64.49 
 
 		 424 aa  414  1e-114  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.885701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3650  aminotransferase, class V  60.1 
 
 		 416 aa  405  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3781  aminotransferase class V  57.22 
 
 		 391 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.559401  normal  0.819909 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1105  Cysteine desulfurase  59.44 
 
 		 401 aa  403  1e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.224155  hitchhiker  0.00251554 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2409  aminotransferase class V  57.72 
 
 		 400 aa  396  1e-109  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1307  aminotransferase class V  59.11 
 
 		 408 aa  391  1e-107  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.455149  normal  0.257454 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  47.8 
 
 		 394 aa  365  1e-100  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  45.52 
 
 		 392 aa  358  9.999999999999999e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  46.25 
 
 		 394 aa  356  3.9999999999999996e-97  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  47.79 
 
 		 392 aa  356  5e-97  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  49.13 
 
 		 409 aa  355  1e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  47.41 
 
 		 396 aa  355  1e-96  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1939  aminotransferase class V  49.09 
 
 		 388 aa  351  1e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024706 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  47.73 
 
 		 398 aa  349  5e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  45.99 
 
 		 398 aa  346  4e-94  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  45.55 
 
 		 384 aa  345  1e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  47.01 
 
 		 392 aa  344  1e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  45.55 
 
 		 384 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  46.39 
 
 		 402 aa  343  2.9999999999999997e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  47.4 
 
 		 382 aa  343  5e-93  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  45.96 
 
 		 400 aa  342  7e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  46.09 
 
 		 394 aa  340  2e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  47.27 
 
 		 388 aa  335  7e-91  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14810  cysteine desulfurase family protein  51.28 
 
 		 400 aa  334  2e-90  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.213876  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  46.09 
 
 		 396 aa  334  2e-90  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  45.97 
 
 		 399 aa  333  3e-90  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4262  aminotransferase class V  50.25 
 
 		 395 aa  332  6e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  44.44 
 
 		 398 aa  330  4e-89  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  42.89 
 
 		 404 aa  329  5.0000000000000004e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  43.77 
 
 		 414 aa  323  4e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  44.92 
 
 		 394 aa  319  5e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2431  aminotransferase, class V  46.61 
 
 		 390 aa  317  2e-85  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  42.45 
 
 		 393 aa  316  4e-85  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  45.03 
 
 		 389 aa  316  5e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  42.71 
 
 		 396 aa  315  8e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  44.13 
 
 		 379 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0341  cysteine desulfurase  41.82 
 
 		 388 aa  313  4.999999999999999e-84  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  38.7 
 
 		 382 aa  312  5.999999999999999e-84  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  41.49 
 
 		 398 aa  309  5e-83  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  41.49 
 
 		 398 aa  309  5e-83  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  40.83 
 
 		 398 aa  306  4.0000000000000004e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  43.62 
 
 		 396 aa  305  8.000000000000001e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1361  aminotransferase class V  52.23 
 
 		 407 aa  305  1.0000000000000001e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.247137 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2232  aminotransferase class V  41.9 
 
 		 401 aa  301  2e-80  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  43 
 
 		 403 aa  300  5e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  43.75 
 
 		 384 aa  299  6e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  44.39 
 
 		 404 aa  298  1e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2362  cysteine desulfurase NifS  43.46 
 
 		 399 aa  298  2e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2275  aminotransferase, class V  43.52 
 
 		 386 aa  297  3e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  43.75 
 
 		 407 aa  296  4e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1932  cysteine desulfurase NifS  40.62 
 
 		 393 aa  296  4e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2363  aminotransferase, class V  41.13 
 
 		 398 aa  296  4e-79  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.197402  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3560  aminotransferase class V  47.35 
 
 		 377 aa  295  1e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0251631  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2683  aminotransferase, class V  43.75 
 
 		 393 aa  295  1e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0397114 
 
 
-
 
NC_002936  DET0248  cysteine desulfurase  43.86 
 
 		 383 aa  293  4e-78  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0166722  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2002  aminotransferase class V  40.92 
 
 		 401 aa  293  5e-78  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.557544 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0235  IscS protein  40.87 
 
 		 398 aa  292  6e-78  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0206  IscS protein  40.72 
 
 		 397 aa  291  2e-77  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.264012  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_70  aminotransferase, class V  42.82 
 
 		 383 aa  290  2e-77  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2175  aminotransferase class V  40.36 
 
 		 398 aa  290  3e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.670004  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2296  aminotransferase, class V  43.9 
 
 		 394 aa  290  3e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2498  aminotransferase class V  43.09 
 
 		 381 aa  289  7e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1068  aminotransferase, class V  45.97 
 
 		 393 aa  288  2e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0344653  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0365  aminotransferase class V  40.46 
 
 		 401 aa  288  2e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0437125  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1356  cysteine desulfurase NifS  40.58 
 
 		 402 aa  286  7e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0992  cysteine desulfurase  41.39 
 
 		 391 aa  286  7e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00026474  normal  0.256714 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01630  Nitrogen fixation cysteine desulfurase, nifS  42.09 
 
 		 402 aa  284  2.0000000000000002e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0437  cysteine desulfurase NifS  40.41 
 
 		 386 aa  284  2.0000000000000002e-75  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.361233 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1833  aminotransferase, class V  40.78 
 
 		 389 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0175075  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2011  cysteine desulfurase  41.65 
 
 		 391 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.079673  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1507  cysteine desulfurase  42.04 
 
 		 402 aa  283  4.0000000000000003e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3063  aminotransferase, class V  43.41 
 
 		 383 aa  283  4.0000000000000003e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0588987  unclonable  0.000000817205 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2025  aminotransferase, class V  37.82 
 
 		 383 aa  283  5.000000000000001e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4451  aminotransferase, class V  43.08 
 
 		 397 aa  283  6.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>