More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6046 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6046  aminotransferase class V  100 
 
 		 391 aa  763    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08620  cysteine desulfurase family protein  67.59 
 
 		 398 aa  514  1e-144  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.702147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8110  Cysteine desulfurase  65.36 
 
 		 387 aa  492  9.999999999999999e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3569  aminotransferase class V  64.43 
 
 		 388 aa  480  1e-134  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00955537  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2844  aminotransferase class V  65.89 
 
 		 384 aa  481  1e-134  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1302  aminotransferase class V  66.15 
 
 		 390 aa  476  1e-133  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4255  aminotransferase, class V  63.08 
 
 		 422 aa  463  1e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0688  aminotransferase, class V  62.72 
 
 		 418 aa  458  9.999999999999999e-129  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.446364  normal  0.630962 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4089  Cysteine desulfurase  64.32 
 
 		 401 aa  449  1e-125  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0595  putative pyridoxal-phosphate-dependent aminotransferase  61.97 
 
 		 390 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2360  Cysteine desulfurase  61.5 
 
 		 387 aa  447  1.0000000000000001e-124  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.66071 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3446  aminotransferase, class V  62.27 
 
 		 399 aa  444  1e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.311876  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1443  Cysteine desulfurase  62.02 
 
 		 400 aa  439  9.999999999999999e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.751675  normal  0.957597 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1855  aminotransferase, class V  63.54 
 
 		 397 aa  435  1e-121  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.712438  normal  0.9875 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1875  aminotransferase, class V  63.54 
 
 		 397 aa  435  1e-121  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1921  aminotransferase, class V  63.54 
 
 		 397 aa  435  1e-121  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.173921  normal  0.388642 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2729  aminotransferase, class V  62.02 
 
 		 408 aa  436  1e-121  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.560546  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2105  aminotransferase, class V  60.41 
 
 		 397 aa  431  1e-120  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2457  aminotransferase class V  60.82 
 
 		 407 aa  422  1e-117  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000191049 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3650  aminotransferase, class V  59.41 
 
 		 416 aa  422  1e-117  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3781  aminotransferase class V  60.63 
 
 		 391 aa  422  1e-117  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.559401  normal  0.819909 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13041  cysteine desulfurase iscS  63.22 
 
 		 393 aa  420  1e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315275  hitchhiker  0.00290952 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10430  cysteine desulfurase family protein  59.35 
 
 		 412 aa  421  1e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.182592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1213  aminotransferase, class V  65.45 
 
 		 424 aa  413  1e-114  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.885701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1106  aminotransferase class V  63.33 
 
 		 391 aa  408  1e-113  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00753492 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1079  aminotransferase class V  59.95 
 
 		 419 aa  405  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1722  aminotransferase class V  54.34 
 
 		 412 aa  397  1e-109  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.185065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2409  aminotransferase class V  59.18 
 
 		 400 aa  394  1e-108  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3255  aminotransferase class V  56.56 
 
 		 413 aa  391  1e-107  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2910  Cysteine desulfurase  58.51 
 
 		 401 aa  385  1e-106  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1105  Cysteine desulfurase  61.38 
 
 		 401 aa  387  1e-106  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.224155  hitchhiker  0.00251554 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1307  aminotransferase class V  57.14 
 
 		 408 aa  362  5.0000000000000005e-99  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.455149  normal  0.257454 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  44.18 
 
 		 394 aa  326  5e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14810  cysteine desulfurase family protein  55.76 
 
 		 400 aa  317  3e-85  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.213876  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  42.89 
 
 		 398 aa  315  7e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  42.55 
 
 		 392 aa  312  5.999999999999999e-84  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  46.56 
 
 		 379 aa  310  4e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  41.53 
 
 		 392 aa  308  9e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  44.03 
 
 		 388 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1939  aminotransferase class V  43.27 
 
 		 388 aa  307  2.0000000000000002e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024706 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  44.06 
 
 		 396 aa  306  3e-82  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  42.44 
 
 		 414 aa  306  4.0000000000000004e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  41.8 
 
 		 394 aa  304  2.0000000000000002e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  41.11 
 
 		 384 aa  302  5.000000000000001e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  41.38 
 
 		 384 aa  300  2e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  42.18 
 
 		 398 aa  298  1e-79  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  42.48 
 
 		 400 aa  298  2e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  42.44 
 
 		 402 aa  297  2e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  44.68 
 
 		 399 aa  298  2e-79  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1361  aminotransferase class V  54.81 
 
 		 407 aa  297  3e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.247137 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4262  aminotransferase class V  44.13 
 
 		 395 aa  295  8e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  42.97 
 
 		 382 aa  295  1e-78  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  43.3 
 
 		 409 aa  295  1e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  40.48 
 
 		 398 aa  294  2e-78  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  40.79 
 
 		 396 aa  293  3e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  41.64 
 
 		 394 aa  293  5e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  38.79 
 
 		 393 aa  289  5.0000000000000004e-77  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  41.49 
 
 		 396 aa  288  1e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  40.37 
 
 		 398 aa  286  5.999999999999999e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  44.83 
 
 		 404 aa  286  5.999999999999999e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  38.46 
 
 		 404 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  38.48 
 
 		 382 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1356  cysteine desulfurase NifS  42.71 
 
 		 402 aa  284  2.0000000000000002e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2431  aminotransferase, class V  44.03 
 
 		 390 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0953  Cysteine desulfurase  42.93 
 
 		 380 aa  280  2e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  42.78 
 
 		 394 aa  280  3e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  40.11 
 
 		 389 aa  279  6e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  41.16 
 
 		 392 aa  279  7e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1932  cysteine desulfurase NifS  40.16 
 
 		 393 aa  278  1e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2498  aminotransferase class V  40.53 
 
 		 381 aa  277  2e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2296  aminotransferase, class V  43.62 
 
 		 394 aa  276  4e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  39.53 
 
 		 398 aa  276  6e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  39.53 
 
 		 398 aa  276  6e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2363  aminotransferase, class V  39.43 
 
 		 398 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.197402  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1507  cysteine desulfurase  41.8 
 
 		 402 aa  273  3e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  39.63 
 
 		 407 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0437  cysteine desulfurase NifS  39.74 
 
 		 386 aa  273  4.0000000000000004e-72  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.361233 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3109  aminotransferase class V  40.53 
 
 		 381 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00030249  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  41.22 
 
 		 396 aa  272  7e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  38.89 
 
 		 403 aa  271  1e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0244  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  43.48 
 
 		 415 aa  271  1e-71  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4477  aminotransferase, class V  40 
 
 		 381 aa  271  2e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.508200000000001e-19 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4244  aminotransferase class V  39.73 
 
 		 381 aa  271  2e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00204023  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4129  aminotransferase, class V  40 
 
 		 381 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00019108  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4530  aminotransferase, class V  40.27 
 
 		 381 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000702151  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2025  aminotransferase, class V  35.71 
 
 		 383 aa  270  5e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0341  cysteine desulfurase  37.99 
 
 		 388 aa  269  5.9999999999999995e-71  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2294  aminotransferase class V  45.22 
 
 		 385 aa  269  7e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000279611 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4517  aminotransferase, class V  40 
 
 		 381 aa  268  8.999999999999999e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0024603  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1225  cysteine desulfurase NifS  41.49 
 
 		 397 aa  268  8.999999999999999e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000944956 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0365  aminotransferase class V  38.66 
 
 		 401 aa  268  1e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0437125  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0719  aminotransferase, class V  40 
 
 		 381 aa  268  1e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000547846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2175  aminotransferase class V  38.66 
 
 		 398 aa  268  1e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.670004  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4480  aminotransferase, class V  40 
 
 		 381 aa  268  2e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.921351  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2232  aminotransferase class V  37.89 
 
 		 401 aa  267  2e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4292  aminotransferase, class V  39.73 
 
 		 381 aa  266  4e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000991667  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4626  aminotransferase, class V  39.73 
 
 		 381 aa  266  4e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.058165  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01630  Nitrogen fixation cysteine desulfurase, nifS  40.21 
 
 		 402 aa  266  5e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  41.64 
 
 		 400 aa  266  7e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4140  aminotransferase, class V  39.47 
 
 		 381 aa  265  8e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000996508  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>