More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2360 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2360  Cysteine desulfurase  100 
 
 		 387 aa  766    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.66071 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08620  cysteine desulfurase family protein  63.33 
 
 		 398 aa  476  1e-133  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.702147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0688  aminotransferase, class V  64.27 
 
 		 418 aa  478  1e-133  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.446364  normal  0.630962 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3569  aminotransferase class V  64.95 
 
 		 388 aa  470  1.0000000000000001e-131  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00955537  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8110  Cysteine desulfurase  63.9 
 
 		 387 aa  466  9.999999999999999e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4255  aminotransferase, class V  61.14 
 
 		 422 aa  464  9.999999999999999e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13041  cysteine desulfurase iscS  63.13 
 
 		 393 aa  461  1e-129  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315275  hitchhiker  0.00290952 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2844  aminotransferase class V  62.79 
 
 		 384 aa  460  9.999999999999999e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1302  aminotransferase class V  64.6 
 
 		 390 aa  452  1.0000000000000001e-126  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1213  aminotransferase, class V  66.49 
 
 		 424 aa  445  1.0000000000000001e-124  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.885701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1875  aminotransferase, class V  63.64 
 
 		 397 aa  445  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1855  aminotransferase, class V  63.64 
 
 		 397 aa  445  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.712438  normal  0.9875 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1921  aminotransferase, class V  63.64 
 
 		 397 aa  445  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.173921  normal  0.388642 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1106  aminotransferase class V  65.97 
 
 		 391 aa  443  1e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00753492 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2105  aminotransferase, class V  60.1 
 
 		 397 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6046  aminotransferase class V  61.5 
 
 		 391 aa  436  1e-121  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2729  aminotransferase, class V  60.62 
 
 		 408 aa  437  1e-121  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.560546  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10430  cysteine desulfurase family protein  60.61 
 
 		 412 aa  432  1e-120  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.182592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1443  Cysteine desulfurase  58.4 
 
 		 400 aa  430  1e-119  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.751675  normal  0.957597 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4089  Cysteine desulfurase  60.78 
 
 		 401 aa  429  1e-119  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3446  aminotransferase, class V  59.17 
 
 		 399 aa  429  1e-119  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.311876  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1105  Cysteine desulfurase  59.95 
 
 		 401 aa  418  1e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.224155  hitchhiker  0.00251554 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0595  putative pyridoxal-phosphate-dependent aminotransferase  58.29 
 
 		 390 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3781  aminotransferase class V  58.79 
 
 		 391 aa  416  9.999999999999999e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.559401  normal  0.819909 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2457  aminotransferase class V  58.29 
 
 		 407 aa  414  1e-114  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000191049 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2409  aminotransferase class V  59.64 
 
 		 400 aa  411  1e-114  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3650  aminotransferase, class V  56.68 
 
 		 416 aa  405  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1079  aminotransferase class V  57.62 
 
 		 419 aa  392  1e-108  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3255  aminotransferase class V  55.53 
 
 		 413 aa  389  1e-107  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1722  aminotransferase class V  52.3 
 
 		 412 aa  387  1e-106  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.185065  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2910  Cysteine desulfurase  57.47 
 
 		 401 aa  382  1e-105  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1307  aminotransferase class V  57.66 
 
 		 408 aa  362  8e-99  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.455149  normal  0.257454 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  44.65 
 
 		 394 aa  333  4e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14810  cysteine desulfurase family protein  53.23 
 
 		 400 aa  326  3e-88  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.213876  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  44.65 
 
 		 394 aa  318  1e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  42.41 
 
 		 384 aa  313  3.9999999999999997e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  44.88 
 
 		 398 aa  308  8e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1361  aminotransferase class V  52.38 
 
 		 407 aa  307  2.0000000000000002e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.247137 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  42.15 
 
 		 384 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  41.51 
 
 		 392 aa  305  6e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  43.49 
 
 		 396 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  42.3 
 
 		 392 aa  301  2e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  40.84 
 
 		 414 aa  298  1e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  42.08 
 
 		 396 aa  295  1e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  42.67 
 
 		 402 aa  294  2e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  42.09 
 
 		 409 aa  293  3e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  40.21 
 
 		 398 aa  292  8e-78  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  42.04 
 
 		 400 aa  291  1e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  43.86 
 
 		 399 aa  290  4e-77  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  40.05 
 
 		 404 aa  290  4e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1939  aminotransferase class V  42.3 
 
 		 388 aa  288  1e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024706 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  41.45 
 
 		 388 aa  287  2e-76  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  40.73 
 
 		 398 aa  286  2.9999999999999996e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  42.27 
 
 		 396 aa  286  4e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  43.26 
 
 		 394 aa  285  7e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  41.73 
 
 		 398 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  42.82 
 
 		 379 aa  282  8.000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2232  aminotransferase class V  39.06 
 
 		 401 aa  281  1e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  43.04 
 
 		 382 aa  281  2e-74  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  40.89 
 
 		 394 aa  280  4e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0341  cysteine desulfurase  37.6 
 
 		 388 aa  278  8e-74  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4262  aminotransferase class V  43.11 
 
 		 395 aa  277  2e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  41.21 
 
 		 396 aa  277  2e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  41.56 
 
 		 392 aa  276  3e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  37.24 
 
 		 382 aa  276  4e-73  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2431  aminotransferase, class V  44.09 
 
 		 390 aa  276  6e-73  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  39.95 
 
 		 393 aa  275  9e-73  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  41.99 
 
 		 404 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1932  cysteine desulfurase NifS  40.16 
 
 		 393 aa  272  7e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  38.6 
 
 		 398 aa  268  1e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  38.6 
 
 		 398 aa  268  1e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2002  aminotransferase class V  36.98 
 
 		 401 aa  267  2e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.557544 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0953  Cysteine desulfurase  42.12 
 
 		 380 aa  267  2.9999999999999995e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1507  cysteine desulfurase  39.79 
 
 		 402 aa  267  2.9999999999999995e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2294  aminotransferase class V  42.55 
 
 		 385 aa  266  2.9999999999999995e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000279611 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2175  aminotransferase class V  38.9 
 
 		 398 aa  266  2.9999999999999995e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.670004  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1356  cysteine desulfurase NifS  39.9 
 
 		 402 aa  265  8e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2498  aminotransferase class V  39.57 
 
 		 381 aa  265  8e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2296  aminotransferase, class V  41.47 
 
 		 394 aa  265  1e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3560  aminotransferase class V  43.68 
 
 		 377 aa  264  2e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0251631  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  39.27 
 
 		 384 aa  264  2e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1225  cysteine desulfurase NifS  39.63 
 
 		 397 aa  263  4e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000944956 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  39.69 
 
 		 403 aa  263  4.999999999999999e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01630  Nitrogen fixation cysteine desulfurase, nifS  40.31 
 
 		 402 aa  263  4.999999999999999e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  38.8 
 
 		 389 aa  262  6e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1353  aminotransferase, class V  47.38 
 
 		 389 aa  262  6.999999999999999e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2363  aminotransferase, class V  37.76 
 
 		 398 aa  262  8e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.197402  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  39.11 
 
 		 407 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1068  aminotransferase, class V  43.15 
 
 		 393 aa  259  8e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0344653  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0365  aminotransferase class V  37.76 
 
 		 401 aa  258  1e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0437125  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0248  cysteine desulfurase  40.21 
 
 		 383 aa  257  2e-67  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0166722  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  39.43 
 
 		 400 aa  257  2e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0484  aminotransferase, class V  40 
 
 		 417 aa  258  2e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0750137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2557  aminotransferase, class V  41.34 
 
 		 381 aa  258  2e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.102305  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2683  aminotransferase, class V  38.8 
 
 		 393 aa  257  2e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0397114 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3063  aminotransferase, class V  41.71 
 
 		 383 aa  257  2e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0588987  unclonable  0.000000817205 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0907  aminotransferase, class V  45.19 
 
 		 383 aa  256  6e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000245321  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1515  aminotransferase, class V:aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  38.48 
 
 		 404 aa  256  7e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.894831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0235  IscS protein  37.76 
 
 		 398 aa  255  7e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1713  aminotransferase class V  39.1 
 
 		 380 aa  256  7e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.229931  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>