More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0688 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_0688  aminotransferase, class V  100 
 
 
418 aa  816    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.446364  normal  0.630962 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8110  Cysteine desulfurase  68.73 
 
 
387 aa  524  1e-147  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2844  aminotransferase class V  67.35 
 
 
384 aa  497  1e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08620  cysteine desulfurase family protein  64.78 
 
 
398 aa  493  9.999999999999999e-139  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.702147  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2360  Cysteine desulfurase  64.27 
 
 
387 aa  484  1e-135  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.66071 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3446  aminotransferase, class V  65.81 
 
 
399 aa  484  1e-135  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.311876  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1302  aminotransferase class V  64.95 
 
 
390 aa  474  1e-132  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3569  aminotransferase class V  64.1 
 
 
388 aa  470  1.0000000000000001e-131  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00955537  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4255  aminotransferase, class V  61.76 
 
 
422 aa  468  9.999999999999999e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0595  putative pyridoxal-phosphate-dependent aminotransferase  62.83 
 
 
390 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10430  cysteine desulfurase family protein  64.43 
 
 
412 aa  460  9.999999999999999e-129  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.182592  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2729  aminotransferase, class V  62.63 
 
 
408 aa  460  9.999999999999999e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.560546  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6046  aminotransferase class V  62.98 
 
 
391 aa  457  1e-127  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2105  aminotransferase, class V  61.01 
 
 
397 aa  454  1e-127  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1079  aminotransferase class V  62.22 
 
 
419 aa  452  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1443  Cysteine desulfurase  62.27 
 
 
400 aa  451  1e-125  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.751675  normal  0.957597 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3650  aminotransferase, class V  60.1 
 
 
416 aa  447  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3781  aminotransferase class V  60.78 
 
 
391 aa  444  1e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.559401  normal  0.819909 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1213  aminotransferase, class V  66.08 
 
 
424 aa  441  9.999999999999999e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.885701  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1106  aminotransferase class V  64.56 
 
 
391 aa  437  1e-121  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00753492 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1105  Cysteine desulfurase  62.76 
 
 
401 aa  436  1e-121  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.224155  hitchhiker  0.00251554 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2409  aminotransferase class V  62.37 
 
 
400 aa  436  1e-121  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4089  Cysteine desulfurase  61.7 
 
 
401 aa  434  1e-120  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1875  aminotransferase, class V  62.53 
 
 
397 aa  433  1e-120  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1722  aminotransferase class V  58.17 
 
 
412 aa  434  1e-120  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.185065  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1855  aminotransferase, class V  62.27 
 
 
397 aa  432  1e-120  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.712438  normal  0.9875 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1921  aminotransferase, class V  62.53 
 
 
397 aa  433  1e-120  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.173921  normal  0.388642 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2457  aminotransferase class V  60.47 
 
 
407 aa  429  1e-119  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000191049 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13041  cysteine desulfurase iscS  59.74 
 
 
393 aa  424  1e-117  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315275  hitchhiker  0.00290952 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2910  Cysteine desulfurase  56.63 
 
 
401 aa  389  1e-107  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3255  aminotransferase class V  57.07 
 
 
413 aa  391  1e-107  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1307  aminotransferase class V  58.25 
 
 
408 aa  379  1e-104  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.455149  normal  0.257454 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14810  cysteine desulfurase family protein  54.01 
 
 
400 aa  341  1e-92  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.213876  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  47.93 
 
 
398 aa  339  5.9999999999999996e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  45.18 
 
 
394 aa  337  1.9999999999999998e-91  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  44.72 
 
 
394 aa  338  1.9999999999999998e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  46.37 
 
 
400 aa  334  1e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  46.77 
 
 
388 aa  334  2e-90  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  45.41 
 
 
392 aa  330  3e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  47.29 
 
 
396 aa  328  8e-89  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  47.24 
 
 
399 aa  328  9e-89  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  41.56 
 
 
392 aa  328  1.0000000000000001e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  42.86 
 
 
384 aa  326  4.0000000000000003e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  45.04 
 
 
392 aa  324  1e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  43.88 
 
 
414 aa  324  2e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  43.11 
 
 
384 aa  323  3e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  45.48 
 
 
409 aa  322  6e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  41.1 
 
 
404 aa  319  7e-86  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1939  aminotransferase class V  45.24 
 
 
388 aa  317  3e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00024706 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  43.37 
 
 
402 aa  315  8e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2431  aminotransferase, class V  48.97 
 
 
390 aa  314  9.999999999999999e-85  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  41.37 
 
 
393 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  44.3 
 
 
398 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  45.34 
 
 
396 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  43.01 
 
 
394 aa  309  6.999999999999999e-83  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  43.15 
 
 
396 aa  309  8e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  40.56 
 
 
398 aa  307  2.0000000000000002e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  41.52 
 
 
398 aa  307  2.0000000000000002e-82  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  42.28 
 
 
398 aa  306  7e-82  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  42.28 
 
 
398 aa  306  7e-82  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  43.3 
 
 
379 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  43.37 
 
 
403 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4262  aminotransferase class V  45.73 
 
 
395 aa  303  3.0000000000000004e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  44.04 
 
 
382 aa  300  3e-80  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  43.58 
 
 
404 aa  297  2e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3560  aminotransferase class V  48.84 
 
 
377 aa  295  1e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0251631  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  38.01 
 
 
382 aa  294  2e-78  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1068  aminotransferase, class V  46.41 
 
 
393 aa  294  2e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0344653  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1932  cysteine desulfurase NifS  41.21 
 
 
393 aa  291  2e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0953  Cysteine desulfurase  45.04 
 
 
380 aa  290  2e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  43.15 
 
 
396 aa  290  3e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1361  aminotransferase class V  51.71 
 
 
407 aa  290  4e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.247137 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2294  aminotransferase class V  46.38 
 
 
385 aa  288  8e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000279611 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0303  cysteine desulfurase  40.86 
 
 
402 aa  287  2e-76  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2232  aminotransferase class V  40.98 
 
 
401 aa  286  4e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2363  aminotransferase, class V  41.58 
 
 
398 aa  286  4e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.197402  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  43.33 
 
 
394 aa  286  5e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0248  cysteine desulfurase  42.56 
 
 
383 aa  285  9e-76  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0166722  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1048  aminotransferase, class V  47.42 
 
 
381 aa  285  9e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3109  aminotransferase class V  43.32 
 
 
381 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00030249  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1104  aminotransferase class V  47.16 
 
 
381 aa  284  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.141104  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  41.37 
 
 
389 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2025  aminotransferase, class V  38.82 
 
 
383 aa  282  6.000000000000001e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2498  aminotransferase class V  41.82 
 
 
381 aa  282  8.000000000000001e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  40.31 
 
 
407 aa  282  8.000000000000001e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_70  aminotransferase, class V  41.79 
 
 
383 aa  281  1e-74  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2002  aminotransferase class V  39.95 
 
 
401 aa  281  2e-74  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.557544 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1356  cysteine desulfurase NifS  40.67 
 
 
402 aa  280  3e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0437  cysteine desulfurase NifS  40.62 
 
 
386 aa  280  4e-74  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.361233 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2296  aminotransferase, class V  43.93 
 
 
394 aa  280  4e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4480  aminotransferase, class V  41.82 
 
 
381 aa  279  8e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.921351  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2175  aminotransferase class V  41.24 
 
 
398 aa  278  1e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.670004  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2773  aminotransferase class V  47.75 
 
 
388 aa  278  2e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.120783 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4244  aminotransferase class V  41.55 
 
 
381 aa  278  2e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00204023  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0341  cysteine desulfurase  37.21 
 
 
388 aa  277  2e-73  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0719  aminotransferase, class V  41.29 
 
 
381 aa  277  2e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000547846  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2557  aminotransferase, class V  46.24 
 
 
381 aa  277  2e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.102305  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4477  aminotransferase, class V  41.55 
 
 
381 aa  276  5e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.508200000000001e-19 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4129  aminotransferase, class V  41.55 
 
 
381 aa  276  6e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00019108  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0235  IscS protein  41.22 
 
 
398 aa  276  7e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>