More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3650 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3650  aminotransferase, class V  100 
 
 		 416 aa  813    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1079  aminotransferase class V  74.15 
 
 		 419 aa  549  1e-155  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8110  Cysteine desulfurase  64.93 
 
 		 387 aa  504  9.999999999999999e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2844  aminotransferase class V  62.87 
 
 		 384 aa  479  1e-134  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3446  aminotransferase, class V  63.66 
 
 		 399 aa  465  9.999999999999999e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.311876  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1302  aminotransferase class V  62.78 
 
 		 390 aa  463  1e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0688  aminotransferase, class V  60.44 
 
 		 418 aa  462  1e-129  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.446364  normal  0.630962 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2729  aminotransferase, class V  60.45 
 
 		 408 aa  455  1e-127  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.560546  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1443  Cysteine desulfurase  60.05 
 
 		 400 aa  451  1e-125  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.751675  normal  0.957597 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3569  aminotransferase class V  59.46 
 
 		 388 aa  448  1e-125  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00955537  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2457  aminotransferase class V  59.47 
 
 		 407 aa  446  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000191049 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4255  aminotransferase, class V  59.95 
 
 		 422 aa  442  1e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08620  cysteine desulfurase family protein  58.91 
 
 		 398 aa  436  1e-121  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.702147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6046  aminotransferase class V  60.15 
 
 		 391 aa  436  1e-121  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4089  Cysteine desulfurase  60.96 
 
 		 401 aa  434  1e-120  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2360  Cysteine desulfurase  56.68 
 
 		 387 aa  432  1e-120  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.66071 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10430  cysteine desulfurase family protein  57.96 
 
 		 412 aa  425  1e-118  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.182592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0595  putative pyridoxal-phosphate-dependent aminotransferase  58.73 
 
 		 390 aa  427  1e-118  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2105  aminotransferase, class V  57.74 
 
 		 397 aa  421  1e-117  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1105  Cysteine desulfurase  60.2 
 
 		 401 aa  419  1e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.224155  hitchhiker  0.00251554 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3781  aminotransferase class V  57.25 
 
 		 391 aa  414  1e-114  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.559401  normal  0.819909 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1722  aminotransferase class V  54.21 
 
 		 412 aa  414  1e-114  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.185065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1106  aminotransferase class V  60.59 
 
 		 391 aa  408  1e-113  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00753492 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1213  aminotransferase, class V  61.33 
 
 		 424 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.885701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2409  aminotransferase class V  57.39 
 
 		 400 aa  402  1e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13041  cysteine desulfurase iscS  57.73 
 
 		 393 aa  404  1e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315275  hitchhiker  0.00290952 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1855  aminotransferase, class V  57 
 
 		 397 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.712438  normal  0.9875 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1875  aminotransferase, class V  57 
 
 		 397 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1921  aminotransferase, class V  57 
 
 		 397 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.173921  normal  0.388642 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1307  aminotransferase class V  60.2 
 
 		 408 aa  394  1e-108  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.455149  normal  0.257454 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2910  Cysteine desulfurase  58.48 
 
 		 401 aa  382  1e-105  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3255  aminotransferase class V  53.04 
 
 		 413 aa  372  1e-102  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14810  cysteine desulfurase family protein  50 
 
 		 400 aa  322  9.999999999999999e-87  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.213876  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  41.71 
 
 		 392 aa  308  1.0000000000000001e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  41.5 
 
 		 394 aa  306  5.0000000000000004e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  42.61 
 
 		 400 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  40 
 
 		 398 aa  300  2e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  43.22 
 
 		 398 aa  300  3e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  41.35 
 
 		 392 aa  299  6e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  43.46 
 
 		 399 aa  297  2e-79  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1939  aminotransferase class V  44.47 
 
 		 388 aa  295  9e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024706 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  40.2 
 
 		 384 aa  294  2e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  41.18 
 
 		 402 aa  293  3e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  39.33 
 
 		 398 aa  293  4e-78  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  38.5 
 
 		 393 aa  293  4e-78  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  39.75 
 
 		 394 aa  293  5e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  41.35 
 
 		 388 aa  291  2e-77  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  43 
 
 		 409 aa  290  3e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  40.2 
 
 		 384 aa  290  4e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4262  aminotransferase class V  47.93 
 
 		 395 aa  290  4e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  42.72 
 
 		 382 aa  289  5.0000000000000004e-77  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  40.45 
 
 		 394 aa  288  1e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1068  aminotransferase, class V  45.64 
 
 		 393 aa  286  5e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0344653  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  36.61 
 
 		 382 aa  285  9e-76  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  40 
 
 		 396 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  41.9 
 
 		 379 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  39.3 
 
 		 396 aa  281  2e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1361  aminotransferase class V  47.73 
 
 		 407 aa  278  1e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.247137 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  37.44 
 
 		 404 aa  278  2e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2294  aminotransferase class V  43.81 
 
 		 385 aa  276  7e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000279611 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  39.5 
 
 		 398 aa  275  8e-73  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2002  aminotransferase class V  39.25 
 
 		 401 aa  275  9e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.557544 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2557  aminotransferase, class V  45.24 
 
 		 381 aa  274  2.0000000000000002e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.102305  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2363  aminotransferase, class V  39.25 
 
 		 398 aa  273  5.000000000000001e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.197402  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  37.1 
 
 		 414 aa  272  7e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2232  aminotransferase class V  38.5 
 
 		 401 aa  271  2e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  39.6 
 
 		 392 aa  270  4e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  40.49 
 
 		 394 aa  270  5e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  38.4 
 
 		 396 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0341  cysteine desulfurase  36.75 
 
 		 388 aa  268  8.999999999999999e-71  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  37.5 
 
 		 398 aa  268  1e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  37.5 
 
 		 398 aa  268  1e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2431  aminotransferase, class V  41.35 
 
 		 390 aa  268  2e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2175  aminotransferase class V  39 
 
 		 398 aa  266  5e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.670004  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2296  aminotransferase, class V  40.7 
 
 		 394 aa  266  5e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1507  cysteine desulfurase  38.44 
 
 		 402 aa  266  5.999999999999999e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  40.2 
 
 		 396 aa  266  5.999999999999999e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  39.2 
 
 		 407 aa  265  1e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  38.25 
 
 		 403 aa  265  2e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  39.7 
 
 		 404 aa  263  3e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2773  aminotransferase class V  46.8 
 
 		 388 aa  263  4e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.120783 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1225  cysteine desulfurase NifS  38.29 
 
 		 397 aa  262  6.999999999999999e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000944956 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2275  aminotransferase, class V  40.35 
 
 		 386 aa  262  6.999999999999999e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1551  aminotransferase class V  39.33 
 
 		 383 aa  262  8.999999999999999e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  38.5 
 
 		 389 aa  261  1e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0235  IscS protein  39 
 
 		 398 aa  261  2e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1932  cysteine desulfurase NifS  37.59 
 
 		 393 aa  260  3e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0365  aminotransferase class V  38.15 
 
 		 401 aa  260  3e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0437125  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1104  aminotransferase class V  44.61 
 
 		 381 aa  258  1e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.141104  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0206  IscS protein  37.84 
 
 		 397 aa  258  1e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.264012  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0437  cysteine desulfurase NifS  37 
 
 		 386 aa  257  2e-67  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.361233 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2498  aminotransferase class V  40.74 
 
 		 381 aa  257  3e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0953  Cysteine desulfurase  41.95 
 
 		 380 aa  256  4e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1048  aminotransferase, class V  45.1 
 
 		 381 aa  256  4e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1833  aminotransferase, class V  38.52 
 
 		 389 aa  256  5e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0175075  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2015  aminotransferase, class V  39.26 
 
 		 391 aa  256  5e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0118596  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3560  aminotransferase class V  44.39 
 
 		 377 aa  255  1.0000000000000001e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0251631  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1583  aminotransferase class V  41.94 
 
 		 1139 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1581  aminotransferase, class V  43.15 
 
 		 1135 aa  252  7e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.863454  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1356  cysteine desulfurase NifS  36.93 
 
 		 402 aa  252  8.000000000000001e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>