More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2105 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_4255  aminotransferase, class V  83.72 
 
 
422 aa  665    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2105  aminotransferase, class V  100 
 
 
397 aa  786    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1875  aminotransferase, class V  79.24 
 
 
397 aa  589  1e-167  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1921  aminotransferase, class V  79.24 
 
 
397 aa  589  1e-167  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.173921  normal  0.388642 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1855  aminotransferase, class V  78.99 
 
 
397 aa  587  1e-167  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.712438  normal  0.9875 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13041  cysteine desulfurase iscS  73.99 
 
 
393 aa  538  9.999999999999999e-153  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315275  hitchhiker  0.00290952 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1302  aminotransferase class V  64.95 
 
 
390 aa  466  9.999999999999999e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4089  Cysteine desulfurase  62.86 
 
 
401 aa  466  9.999999999999999e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08620  cysteine desulfurase family protein  64.18 
 
 
398 aa  463  1e-129  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.702147  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3255  aminotransferase class V  64.32 
 
 
413 aa  462  1e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8110  Cysteine desulfurase  61.92 
 
 
387 aa  458  9.999999999999999e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2729  aminotransferase, class V  60.47 
 
 
408 aa  459  9.999999999999999e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.560546  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2844  aminotransferase class V  63.38 
 
 
384 aa  455  1e-127  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0688  aminotransferase, class V  61.01 
 
 
418 aa  451  1.0000000000000001e-126  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.446364  normal  0.630962 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2360  Cysteine desulfurase  60.1 
 
 
387 aa  447  1.0000000000000001e-124  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.66071 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3569  aminotransferase class V  60.98 
 
 
388 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00955537  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3446  aminotransferase, class V  61.08 
 
 
399 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.311876  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10430  cysteine desulfurase family protein  58.48 
 
 
412 aa  440  9.999999999999999e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.182592  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2457  aminotransferase class V  60.1 
 
 
407 aa  439  9.999999999999999e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000191049 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6046  aminotransferase class V  60.41 
 
 
391 aa  436  1e-121  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1443  Cysteine desulfurase  60.52 
 
 
400 aa  433  1e-120  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.751675  normal  0.957597 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2910  Cysteine desulfurase  63.54 
 
 
401 aa  427  1e-118  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1079  aminotransferase class V  59.34 
 
 
419 aa  416  9.999999999999999e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0595  putative pyridoxal-phosphate-dependent aminotransferase  58.29 
 
 
390 aa  414  1e-114  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1722  aminotransferase class V  55.19 
 
 
412 aa  408  1e-113  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.185065  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1106  aminotransferase class V  63.19 
 
 
391 aa  410  1e-113  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00753492 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3781  aminotransferase class V  57.22 
 
 
391 aa  409  1e-113  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.559401  normal  0.819909 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3650  aminotransferase, class V  57.86 
 
 
416 aa  403  1e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1213  aminotransferase, class V  61.88 
 
 
424 aa  392  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.885701  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1105  Cysteine desulfurase  57.61 
 
 
401 aa  389  1e-107  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.224155  hitchhiker  0.00251554 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2409  aminotransferase class V  55.08 
 
 
400 aa  384  1e-105  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1307  aminotransferase class V  58.33 
 
 
408 aa  380  1e-104  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.455149  normal  0.257454 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  45.15 
 
 
392 aa  355  1e-96  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  48.04 
 
 
392 aa  354  1e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  47.66 
 
 
396 aa  352  5e-96  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  49.48 
 
 
382 aa  349  5e-95  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  48.31 
 
 
398 aa  348  1e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  46.23 
 
 
394 aa  343  2.9999999999999997e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  45.57 
 
 
384 aa  343  4e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  45.55 
 
 
384 aa  341  1e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  45.97 
 
 
394 aa  340  2e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  46.48 
 
 
400 aa  335  1e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  42.64 
 
 
398 aa  331  1e-89  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14810  cysteine desulfurase family protein  50.38 
 
 
400 aa  331  1e-89  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.213876  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  46.6 
 
 
394 aa  332  1e-89  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  45.95 
 
 
392 aa  330  2e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  46.62 
 
 
409 aa  329  7e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  42.6 
 
 
404 aa  325  9e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  44.91 
 
 
402 aa  324  1e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  44.85 
 
 
398 aa  325  1e-87  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1939  aminotransferase class V  46.49 
 
 
388 aa  325  1e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00024706 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  44.25 
 
 
414 aa  322  6e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2431  aminotransferase, class V  47.64 
 
 
390 aa  321  9.999999999999999e-87  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  43.86 
 
 
399 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  45.69 
 
 
388 aa  318  1e-85  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  42.67 
 
 
396 aa  315  9.999999999999999e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  43.81 
 
 
396 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4262  aminotransferase class V  47.72 
 
 
395 aa  309  5e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  44.16 
 
 
394 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  43.08 
 
 
379 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  42.6 
 
 
398 aa  305  6e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  39.48 
 
 
382 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  41.71 
 
 
398 aa  305  1.0000000000000001e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  41.71 
 
 
398 aa  305  1.0000000000000001e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  44.74 
 
 
389 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0341  cysteine desulfurase  39.74 
 
 
388 aa  303  5.000000000000001e-81  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  42.05 
 
 
396 aa  298  1e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  41.19 
 
 
393 aa  296  3e-79  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1361  aminotransferase class V  49.87 
 
 
407 aa  293  3e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.247137 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  42.56 
 
 
404 aa  291  1e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1932  cysteine desulfurase NifS  41.1 
 
 
393 aa  290  3e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2362  cysteine desulfurase NifS  41.62 
 
 
399 aa  288  8e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  41.88 
 
 
407 aa  288  1e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2498  aminotransferase class V  42.55 
 
 
381 aa  288  1e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  41.78 
 
 
403 aa  286  5.999999999999999e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3560  aminotransferase class V  45.43 
 
 
377 aa  285  8e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0251631  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2363  aminotransferase, class V  39.59 
 
 
398 aa  285  8e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.197402  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2232  aminotransferase class V  39.44 
 
 
401 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0235  IscS protein  40.1 
 
 
398 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0953  Cysteine desulfurase  44.09 
 
 
380 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2683  aminotransferase, class V  41.36 
 
 
393 aa  284  2.0000000000000002e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0397114 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  41.51 
 
 
384 aa  282  8.000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0248  cysteine desulfurase  42.3 
 
 
383 aa  280  3e-74  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0166722  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_70  aminotransferase, class V  42.04 
 
 
383 aa  280  4e-74  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1833  aminotransferase, class V  39.95 
 
 
389 aa  279  6e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0175075  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2175  aminotransferase class V  38.82 
 
 
398 aa  278  1e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.670004  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2275  aminotransferase, class V  41.41 
 
 
386 aa  278  1e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0437  cysteine desulfurase NifS  39.19 
 
 
386 aa  278  2e-73  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.361233 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2025  aminotransferase, class V  38.18 
 
 
383 aa  278  2e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2002  aminotransferase class V  38.3 
 
 
401 aa  277  3e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.557544 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0484  aminotransferase, class V  40.72 
 
 
417 aa  276  5e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0750137  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1356  cysteine desulfurase NifS  39.01 
 
 
402 aa  275  7e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2015  aminotransferase, class V  40.73 
 
 
391 aa  276  7e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0118596  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2296  aminotransferase, class V  42.3 
 
 
394 aa  276  7e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  40.31 
 
 
400 aa  275  8e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0365  aminotransferase class V  39.07 
 
 
401 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0437125  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3109  aminotransferase class V  41.3 
 
 
381 aa  273  3e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00030249  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0206  IscS protein  37.79 
 
 
397 aa  273  3e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.264012  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0100  cysteine desulfurase NifS  43.12 
 
 
400 aa  273  3e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4451  aminotransferase, class V  42.82 
 
 
397 aa  274  3e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>