More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3569 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_3569  aminotransferase class V  100 
 
 		 388 aa  763    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00955537  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8110  Cysteine desulfurase  72.28 
 
 		 387 aa  544  1e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2844  aminotransferase class V  70.1 
 
 		 384 aa  526  1e-148  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3781  aminotransferase class V  67.72 
 
 		 391 aa  501  1e-141  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.559401  normal  0.819909 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0595  putative pyridoxal-phosphate-dependent aminotransferase  67.37 
 
 		 390 aa  497  1e-139  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1302  aminotransferase class V  68.04 
 
 		 390 aa  486  1e-136  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08620  cysteine desulfurase family protein  66.75 
 
 		 398 aa  487  1e-136  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.702147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3446  aminotransferase, class V  65.46 
 
 		 399 aa  480  1e-134  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.311876  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6046  aminotransferase class V  64.43 
 
 		 391 aa  478  1e-134  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2360  Cysteine desulfurase  64.95 
 
 		 387 aa  475  1e-133  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.66071 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4089  Cysteine desulfurase  63.73 
 
 		 401 aa  467  9.999999999999999e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4255  aminotransferase, class V  62.02 
 
 		 422 aa  467  9.999999999999999e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0688  aminotransferase, class V  64.1 
 
 		 418 aa  465  9.999999999999999e-131  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.446364  normal  0.630962 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1079  aminotransferase class V  64.69 
 
 		 419 aa  444  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1443  Cysteine desulfurase  60.82 
 
 		 400 aa  441  1e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.751675  normal  0.957597 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10430  cysteine desulfurase family protein  61.38 
 
 		 412 aa  443  1e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.182592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2105  aminotransferase, class V  60.98 
 
 		 397 aa  438  9.999999999999999e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1855  aminotransferase, class V  60.36 
 
 		 397 aa  436  1e-121  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.712438  normal  0.9875 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1921  aminotransferase, class V  60.36 
 
 		 397 aa  436  1e-121  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.173921  normal  0.388642 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1875  aminotransferase, class V  60.36 
 
 		 397 aa  436  1e-121  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2729  aminotransferase, class V  60.47 
 
 		 408 aa  436  1e-121  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.560546  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3650  aminotransferase, class V  59.51 
 
 		 416 aa  432  1e-120  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2457  aminotransferase class V  59.69 
 
 		 407 aa  428  1e-119  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000191049 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1106  aminotransferase class V  65.37 
 
 		 391 aa  426  1e-118  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00753492 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13041  cysteine desulfurase iscS  58.89 
 
 		 393 aa  419  1e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315275  hitchhiker  0.00290952 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1213  aminotransferase, class V  65.89 
 
 		 424 aa  420  1e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.885701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2409  aminotransferase class V  60.51 
 
 		 400 aa  415  9.999999999999999e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1722  aminotransferase class V  55.73 
 
 		 412 aa  411  1e-113  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.185065  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1105  Cysteine desulfurase  60.82 
 
 		 401 aa  411  1e-113  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.224155  hitchhiker  0.00251554 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2910  Cysteine desulfurase  59.38 
 
 		 401 aa  406  1.0000000000000001e-112  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3255  aminotransferase class V  57.95 
 
 		 413 aa  398  9.999999999999999e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1307  aminotransferase class V  60.72 
 
 		 408 aa  384  1e-105  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.455149  normal  0.257454 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  46.61 
 
 		 394 aa  352  8.999999999999999e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  45.03 
 
 		 392 aa  344  1e-93  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  48.04 
 
 		 399 aa  340  2e-92  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1939  aminotransferase class V  46.88 
 
 		 388 aa  331  2e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024706 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  46.35 
 
 		 392 aa  330  3e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  45.29 
 
 		 398 aa  330  3e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  45.57 
 
 		 396 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  45.34 
 
 		 396 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  42.41 
 
 		 384 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  46.35 
 
 		 400 aa  325  9e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  42.97 
 
 		 393 aa  322  5e-87  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  44.68 
 
 		 394 aa  322  7e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  42.71 
 
 		 398 aa  322  8e-87  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  43.64 
 
 		 398 aa  322  8e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2294  aminotransferase class V  49.05 
 
 		 385 aa  320  1.9999999999999998e-86  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000279611 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  41.62 
 
 		 384 aa  320  3e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14810  cysteine desulfurase family protein  50.9 
 
 		 400 aa  316  5e-85  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.213876  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  45.03 
 
 		 382 aa  316  5e-85  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  44.53 
 
 		 388 aa  315  6e-85  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2431  aminotransferase, class V  47.38 
 
 		 390 aa  315  9.999999999999999e-85  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  44.24 
 
 		 398 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  43.77 
 
 		 409 aa  312  5.999999999999999e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  44.39 
 
 		 402 aa  311  1e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  42.04 
 
 		 404 aa  311  1e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2232  aminotransferase class V  41.41 
 
 		 401 aa  310  2e-83  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  42.67 
 
 		 389 aa  309  5e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  42.23 
 
 		 398 aa  309  5e-83  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  42.23 
 
 		 398 aa  309  5e-83  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  46.35 
 
 		 392 aa  308  9e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  42.56 
 
 		 414 aa  306  6e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  43.64 
 
 		 396 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  42.41 
 
 		 394 aa  303  3.0000000000000004e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1361  aminotransferase class V  53.6 
 
 		 407 aa  301  1e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.247137 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2275  aminotransferase, class V  44.13 
 
 		 386 aa  300  3e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  44.76 
 
 		 404 aa  300  3e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4262  aminotransferase class V  44.92 
 
 		 395 aa  300  3e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2557  aminotransferase, class V  46.35 
 
 		 381 aa  298  1e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.102305  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  43.93 
 
 		 394 aa  297  2e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  38.96 
 
 		 382 aa  297  3e-79  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  42.75 
 
 		 403 aa  296  5e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1932  cysteine desulfurase NifS  42.93 
 
 		 393 aa  296  5e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2002  aminotransferase class V  40.62 
 
 		 401 aa  295  8e-79  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.557544 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_70  aminotransferase, class V  43.78 
 
 		 383 aa  295  8e-79  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0248  cysteine desulfurase  43.78 
 
 		 383 aa  295  1e-78  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0166722  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  43.23 
 
 		 379 aa  294  2e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2175  aminotransferase class V  41.15 
 
 		 398 aa  293  3e-78  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.670004  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  42.67 
 
 		 407 aa  292  5e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2296  aminotransferase, class V  43.72 
 
 		 394 aa  289  5.0000000000000004e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0953  Cysteine desulfurase  42.78 
 
 		 380 aa  288  9e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1068  aminotransferase, class V  47.29 
 
 		 393 aa  288  9e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0344653  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0235  IscS protein  41.04 
 
 		 398 aa  288  1e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2363  aminotransferase, class V  40 
 
 		 398 aa  288  1e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.197402  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3560  aminotransferase class V  48.83 
 
 		 377 aa  286  2.9999999999999996e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0251631  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2683  aminotransferase, class V  41.88 
 
 		 393 aa  286  5e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0397114 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  40.84 
 
 		 384 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0365  aminotransferase class V  40.1 
 
 		 401 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0437125  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1104  aminotransferase class V  48.04 
 
 		 381 aa  283  3.0000000000000004e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.141104  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0341  cysteine desulfurase  38.02 
 
 		 388 aa  280  2e-74  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01630  Nitrogen fixation cysteine desulfurase, nifS  41.41 
 
 		 402 aa  279  5e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3109  aminotransferase class V  41.21 
 
 		 381 aa  279  5e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00030249  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0206  IscS protein  39.69 
 
 		 397 aa  279  7e-74  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.264012  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  41.1 
 
 		 396 aa  278  9e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1257  aminotransferase, class V  44.13 
 
 		 387 aa  277  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4244  aminotransferase class V  39.63 
 
 		 381 aa  277  2e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00204023  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1048  aminotransferase, class V  48.04 
 
 		 381 aa  277  2e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0100  cysteine desulfurase NifS  40.84 
 
 		 400 aa  276  5e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0719  aminotransferase, class V  39.37 
 
 		 381 aa  276  6e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000547846  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4129  aminotransferase, class V  39.63 
 
 		 381 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00019108  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>