More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2557 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_2557  aminotransferase, class V  100 
 
 		 381 aa  756    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.102305  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2294  aminotransferase class V  80 
 
 		 385 aa  554  1e-157  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000279611 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2773  aminotransferase class V  59.83 
 
 		 388 aa  384  1e-105  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.120783 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3560  aminotransferase class V  58.67 
 
 		 377 aa  359  5e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0251631  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03780  cysteine desulfurase family protein  57.53 
 
 		 380 aa  353  4e-96  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  50 
 
 		 409 aa  331  1e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  45.77 
 
 		 396 aa  327  3e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  42.74 
 
 		 393 aa  326  5e-88  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4262  aminotransferase class V  50.14 
 
 		 395 aa  324  2e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  47.25 
 
 		 399 aa  324  2e-87  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  47.67 
 
 		 392 aa  321  9.999999999999999e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  44.66 
 
 		 394 aa  320  1.9999999999999998e-86  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  43.01 
 
 		 398 aa  320  3e-86  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  43.4 
 
 		 384 aa  318  9e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  46.35 
 
 		 394 aa  318  1e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  43.96 
 
 		 384 aa  317  2e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  47.04 
 
 		 389 aa  317  2e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  45.48 
 
 		 396 aa  317  2e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  43.66 
 
 		 404 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  43.47 
 
 		 398 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  41.69 
 
 		 382 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  43.04 
 
 		 394 aa  311  1e-83  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  45.94 
 
 		 414 aa  311  1e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15700  cysteine desulfurase family protein  52.37 
 
 		 390 aa  310  2e-83  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  43.26 
 
 		 398 aa  310  2e-83  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  43.82 
 
 		 402 aa  311  2e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0244  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  46.58 
 
 		 415 aa  308  9e-83  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  45.48 
 
 		 388 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  45.21 
 
 		 379 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1939  aminotransferase class V  46.58 
 
 		 388 aa  305  6e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024706 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  41.78 
 
 		 392 aa  305  1.0000000000000001e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  44.41 
 
 		 400 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0347  aminotransferase class V  61.2 
 
 		 454 aa  303  4.0000000000000003e-81  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0248  cysteine desulfurase  41.95 
 
 		 383 aa  301  9e-81  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0166722  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_70  aminotransferase, class V  41.95 
 
 		 383 aa  301  1e-80  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  43.85 
 
 		 396 aa  299  5e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4134  aminotransferase, class V  45.78 
 
 		 400 aa  299  5e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0486971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  43.47 
 
 		 382 aa  299  5e-80  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3569  aminotransferase class V  46.35 
 
 		 388 aa  299  6e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00955537  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2296  aminotransferase, class V  47.32 
 
 		 394 aa  298  1e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0595  putative pyridoxal-phosphate-dependent aminotransferase  46.4 
 
 		 390 aa  297  2e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  45.33 
 
 		 398 aa  297  2e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  45.21 
 
 		 400 aa  296  4e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1507  cysteine desulfurase  45.33 
 
 		 402 aa  295  7e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3446  aminotransferase, class V  47.38 
 
 		 399 aa  295  7e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.311876  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  44.26 
 
 		 392 aa  295  1e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1225  cysteine desulfurase NifS  45.45 
 
 		 397 aa  293  3e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000944956 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  44.38 
 
 		 403 aa  293  4e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2122  cysteine desulfurase NifS  46.28 
 
 		 401 aa  293  4e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31758 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1783  cysteine desulfurase NifS  44.93 
 
 		 401 aa  293  4e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1811  cysteine desulfurase NifS  44.93 
 
 		 401 aa  293  4e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1443  Cysteine desulfurase  47.42 
 
 		 400 aa  292  6e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.751675  normal  0.957597 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3109  aminotransferase class V  44.99 
 
 		 381 aa  291  1e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00030249  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2808  aminotransferase, class V  44.8 
 
 		 379 aa  291  1e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0953  Cysteine desulfurase  45.53 
 
 		 380 aa  291  2e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  44.78 
 
 		 396 aa  290  3e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2431  aminotransferase, class V  45.21 
 
 		 390 aa  290  3e-77  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  40.6 
 
 		 398 aa  289  6e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  40.6 
 
 		 398 aa  289  6e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1068  aminotransferase, class V  45.38 
 
 		 393 aa  289  7e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0344653  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2498  aminotransferase class V  42.16 
 
 		 381 aa  289  7e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8110  Cysteine desulfurase  48.09 
 
 		 387 aa  288  1e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  43.96 
 
 		 404 aa  286  2.9999999999999996e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01630  Nitrogen fixation cysteine desulfurase, nifS  44.93 
 
 		 402 aa  287  2.9999999999999996e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1581  aminotransferase, class V  47.14 
 
 		 1135 aa  287  2.9999999999999996e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.863454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0341  cysteine desulfurase  39.36 
 
 		 388 aa  286  4e-76  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4245  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  45.05 
 
 		 398 aa  286  4e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  45.21 
 
 		 384 aa  286  5e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2179  cysteine desulfurase  41.51 
 
 		 373 aa  285  8e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2630  aminotransferase class V  46.63 
 
 		 1143 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1257  aminotransferase, class V  47.15 
 
 		 387 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2844  aminotransferase class V  45.09 
 
 		 384 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0688  cysteine desulfurase NifS  40.85 
 
 		 388 aa  283  2.0000000000000002e-75  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0297222  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0907  aminotransferase, class V  48.9 
 
 		 383 aa  282  5.000000000000001e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000245321  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2362  cysteine desulfurase NifS  43.84 
 
 		 399 aa  282  8.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1932  cysteine desulfurase NifS  42.54 
 
 		 393 aa  280  3e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4480  aminotransferase, class V  43.24 
 
 		 381 aa  279  5e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.921351  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1353  aminotransferase, class V  47.63 
 
 		 389 aa  279  5e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4292  aminotransferase, class V  43.24 
 
 		 381 aa  278  1e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000991667  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4129  aminotransferase, class V  43.24 
 
 		 381 aa  278  1e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00019108  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1356  cysteine desulfurase NifS  42.35 
 
 		 402 aa  278  1e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4626  aminotransferase, class V  43.24 
 
 		 381 aa  278  1e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.058165  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4477  aminotransferase, class V  43.24 
 
 		 381 aa  278  1e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.508200000000001e-19 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4244  aminotransferase class V  42.97 
 
 		 381 aa  278  1e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00204023  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4451  aminotransferase, class V  44.77 
 
 		 397 aa  277  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1583  aminotransferase class V  44.92 
 
 		 1139 aa  278  2e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4089  Cysteine desulfurase  45.5 
 
 		 401 aa  277  3e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4530  aminotransferase, class V  42.97 
 
 		 381 aa  277  3e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000702151  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0688  aminotransferase, class V  46.24 
 
 		 418 aa  276  3e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.446364  normal  0.630962 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4255  aminotransferase, class V  44.96 
 
 		 422 aa  276  4e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5030  aminotransferase class V  43.86 
 
 		 388 aa  276  5e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  41.67 
 
 		 394 aa  276  6e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3581  cysteine desulfurase NifS  45.14 
 
 		 404 aa  275  9e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.157563  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4140  aminotransferase, class V  42.97 
 
 		 381 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000996508  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0624  aminotransferase, class V  43.39 
 
 		 385 aa  274  2.0000000000000002e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292698 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2865  cysteine desulfurase  45.45 
 
 		 373 aa  273  3e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2729  aminotransferase, class V  45.92 
 
 		 408 aa  273  3e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.560546  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1558  cysteine desulfurase NifS  44.66 
 
 		 400 aa  273  5.000000000000001e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0572612  normal  0.890663 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0422  cysteine desulfurase  45.45 
 
 		 373 aa  272  6e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1568  cysteine desulfurase  45.45 
 
 		 373 aa  272  6e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>