More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1068 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1068  aminotransferase, class V  100 
 
 		 393 aa  773    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0344653  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  49.61 
 
 		 382 aa  363  2e-99  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  46.63 
 
 		 384 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  48.58 
 
 		 414 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  49.36 
 
 		 388 aa  357  2.9999999999999997e-97  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  46.63 
 
 		 384 aa  356  3.9999999999999996e-97  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  47.92 
 
 		 398 aa  355  1e-96  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  44.53 
 
 		 382 aa  350  2e-95  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  46.25 
 
 		 392 aa  348  1e-94  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  50.13 
 
 		 398 aa  347  2e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  47.26 
 
 		 394 aa  340  2e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  46.74 
 
 		 394 aa  341  2e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  46.77 
 
 		 392 aa  340  2.9999999999999998e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  48.07 
 
 		 404 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  46.61 
 
 		 403 aa  336  3.9999999999999995e-91  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  46.91 
 
 		 400 aa  335  9e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  48.44 
 
 		 399 aa  333  2e-90  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  45.6 
 
 		 400 aa  333  4e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  44.68 
 
 		 394 aa  331  1e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0248  cysteine desulfurase  48.03 
 
 		 383 aa  330  3e-89  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0166722  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  45.99 
 
 		 402 aa  329  5.0000000000000004e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2175  aminotransferase class V  45.78 
 
 		 398 aa  328  7e-89  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.670004  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  46.23 
 
 		 396 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_70  aminotransferase, class V  48.03 
 
 		 383 aa  327  3e-88  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1939  aminotransferase class V  48.96 
 
 		 388 aa  326  5e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024706 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2122  cysteine desulfurase NifS  46.75 
 
 		 401 aa  325  7e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31758 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  44.73 
 
 		 396 aa  325  8.000000000000001e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  47.4 
 
 		 396 aa  325  8.000000000000001e-88  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2296  aminotransferase, class V  47.04 
 
 		 394 aa  323  3e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1783  cysteine desulfurase NifS  45.74 
 
 		 401 aa  322  6e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1811  cysteine desulfurase NifS  45.74 
 
 		 401 aa  322  6e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  46.46 
 
 		 379 aa  322  9.000000000000001e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0341  cysteine desulfurase  43.75 
 
 		 388 aa  322  9.000000000000001e-87  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1558  cysteine desulfurase NifS  47.42 
 
 		 400 aa  321  1.9999999999999998e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0572612  normal  0.890663 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  45.69 
 
 		 398 aa  320  3e-86  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2002  aminotransferase class V  45.06 
 
 		 401 aa  320  3e-86  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.557544 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  45.22 
 
 		 407 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0108  aminotransferase class V  46.65 
 
 		 400 aa  319  5e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.702313 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  46.08 
 
 		 409 aa  319  7e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1833  aminotransferase, class V  45.34 
 
 		 389 aa  318  7e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0175075  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  42.86 
 
 		 404 aa  318  9e-86  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1257  aminotransferase, class V  48.45 
 
 		 387 aa  318  9e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2232  aminotransferase class V  43.4 
 
 		 401 aa  318  1e-85  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0907  aminotransferase, class V  48.81 
 
 		 383 aa  318  1e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000245321  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  44.3 
 
 		 396 aa  317  2e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  44.04 
 
 		 384 aa  317  2e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0949  cysteine desulfurase IscS  45.34 
 
 		 405 aa  316  4e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0399375 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0884  cysteine desulfurase IscS  45.34 
 
 		 405 aa  316  4e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.293282  normal  0.187166 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2362  cysteine desulfurase NifS  45.19 
 
 		 399 aa  316  5e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1058  cysteine desulfurase  45.6 
 
 		 405 aa  315  6e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0834623  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4134  aminotransferase, class V  44.79 
 
 		 400 aa  316  6e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0486971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2182  aminotransferase, class V  48.97 
 
 		 388 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.186921 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0530  cysteine desulfurase  48.97 
 
 		 387 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.103474  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0188  aminotransferase class V  49.73 
 
 		 382 aa  314  1.9999999999999998e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.431625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0365  aminotransferase class V  44.25 
 
 		 401 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0437125  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3416  aminotransferase class V  48.09 
 
 		 399 aa  313  2.9999999999999996e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.425221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  43.64 
 
 		 398 aa  313  3.9999999999999997e-84  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  43.12 
 
 		 393 aa  313  4.999999999999999e-84  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2275  aminotransferase, class V  45.99 
 
 		 386 aa  313  4.999999999999999e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1019  pyridoxal-phosphate-dependent aminotransferase (NIFS protein)  44.56 
 
 		 405 aa  312  6.999999999999999e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.103423  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2647  cysteine desulfurase NifS  44.82 
 
 		 389 aa  311  9e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00311085 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4044  aminotransferase, class V  45.36 
 
 		 389 aa  311  9e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.159236 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8110  Cysteine desulfurase  47.93 
 
 		 387 aa  311  2e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0235  IscS protein  44.5 
 
 		 398 aa  311  2e-83  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0206  IscS protein  44.1 
 
 		 397 aa  310  2e-83  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.264012  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1932  cysteine desulfurase NifS  44.42 
 
 		 393 aa  311  2e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  44.53 
 
 		 389 aa  311  2e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1569  cysteine desulfurase NifS  44.82 
 
 		 389 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00349258  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1025  cysteine desulfurase  45.08 
 
 		 406 aa  310  2.9999999999999997e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00998384  normal  0.30784 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2579  cysteine desulfurase  43.52 
 
 		 407 aa  310  4e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120053  hitchhiker  0.000683499 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1356  cysteine desulfurase NifS  43.23 
 
 		 402 aa  310  4e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1553  cysteine desulfurase  43.52 
 
 		 407 aa  309  5e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0484493  normal  0.0430953 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1551  aminotransferase class V  46.35 
 
 		 383 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3581  cysteine desulfurase NifS  48.06 
 
 		 404 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.157563  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2844  aminotransferase class V  48.83 
 
 		 384 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1144  cysteine desulfurase  44.3 
 
 		 407 aa  307  3e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282524  normal  0.237339 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5089  cysteine desulfurase NifS  48.32 
 
 		 410 aa  306  3e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0100  cysteine desulfurase NifS  43.96 
 
 		 400 aa  306  3e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4245  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  44.3 
 
 		 398 aa  306  3e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0992  cysteine desulfurase  44.33 
 
 		 391 aa  307  3e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00026474  normal  0.256714 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1581  aminotransferase, class V  47.72 
 
 		 1135 aa  306  3e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.863454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1649  aminotransferase, class V  46.07 
 
 		 385 aa  306  4.0000000000000004e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.251188  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2143  cysteine desulfurase  44.04 
 
 		 407 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.950908 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2431  aminotransferase, class V  46.37 
 
 		 390 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5951  cysteine desulfurase  44.04 
 
 		 407 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.350283  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2126  cysteine desulfurase  44.04 
 
 		 407 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3449  cysteine desulfurase  45.48 
 
 		 389 aa  306  5.0000000000000004e-82  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1458  cysteine desulfurase  43.78 
 
 		 407 aa  306  6e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1063  aminotransferase class V  44.94 
 
 		 388 aa  305  7e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01630  Nitrogen fixation cysteine desulfurase, nifS  43.93 
 
 		 402 aa  305  1.0000000000000001e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0595  putative pyridoxal-phosphate-dependent aminotransferase  49.47 
 
 		 390 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2733  cysteine desulfurase  43.78 
 
 		 407 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2015  aminotransferase, class V  43.52 
 
 		 391 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0118596  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2655  cysteine desulfurase  44.04 
 
 		 407 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  43.52 
 
 		 398 aa  305  1.0000000000000001e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  43.52 
 
 		 398 aa  305  1.0000000000000001e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2011  cysteine desulfurase  44.07 
 
 		 391 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.079673  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2290  cysteine desulfurase IscS  45.6 
 
 		 405 aa  304  2.0000000000000002e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00326388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1875  cysteine desulfurase  44.04 
 
 		 407 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.795233  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2599  cysteine desulfurase  43.78 
 
 		 407 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129174  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>