More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0206 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_0235  IscS protein  78.39 
 
 		 398 aa  658    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0206  IscS protein  100 
 
 		 397 aa  816    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.264012  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2175  aminotransferase class V  79.4 
 
 		 398 aa  670    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.670004  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2363  aminotransferase, class V  80.65 
 
 		 398 aa  674    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.197402  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0365  aminotransferase class V  80.4 
 
 		 401 aa  680    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0437125  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2232  aminotransferase class V  74.81 
 
 		 401 aa  624  1e-177  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2002  aminotransferase class V  73.3 
 
 		 401 aa  613  9.999999999999999e-175  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.557544 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0534  aminotransferase class V  63.99 
 
 		 394 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  44.7 
 
 		 392 aa  364  2e-99  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  47.93 
 
 		 394 aa  363  3e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  47.12 
 
 		 400 aa  360  2e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  46.21 
 
 		 384 aa  357  9.999999999999999e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  47.79 
 
 		 414 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  46.09 
 
 		 384 aa  357  2.9999999999999997e-97  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  46.49 
 
 		 402 aa  356  2.9999999999999997e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  47.52 
 
 		 396 aa  355  1e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  46.13 
 
 		 392 aa  354  1e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  47.26 
 
 		 404 aa  347  1e-94  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  45.52 
 
 		 394 aa  348  1e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  45.43 
 
 		 384 aa  347  2e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  46.63 
 
 		 396 aa  345  6e-94  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  47.92 
 
 		 394 aa  345  8e-94  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  47.66 
 
 		 382 aa  342  5.999999999999999e-93  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  47 
 
 		 399 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0100  cysteine desulfurase NifS  45.43 
 
 		 400 aa  338  7e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  44.3 
 
 		 404 aa  338  9e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  44.87 
 
 		 398 aa  338  9.999999999999999e-92  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2296  aminotransferase, class V  46.74 
 
 		 394 aa  335  5.999999999999999e-91  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0992  cysteine desulfurase  44.3 
 
 		 391 aa  333  4e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00026474  normal  0.256714 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2647  cysteine desulfurase NifS  45.57 
 
 		 389 aa  332  5e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00311085 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  47.18 
 
 		 392 aa  332  8e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2011  cysteine desulfurase  44.82 
 
 		 391 aa  331  1e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.079673  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0108  aminotransferase class V  44.47 
 
 		 400 aa  330  2e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.702313 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1833  aminotransferase, class V  44.01 
 
 		 389 aa  329  5.0000000000000004e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0175075  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  44.3 
 
 		 398 aa  329  6e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  45.24 
 
 		 398 aa  329  6e-89  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  45.24 
 
 		 398 aa  329  6e-89  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  44.04 
 
 		 398 aa  329  7e-89  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  43.52 
 
 		 407 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1932  cysteine desulfurase NifS  44.82 
 
 		 393 aa  327  2.0000000000000001e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0504  cysteine desulfurase NifS  44.84 
 
 		 402 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  44.13 
 
 		 379 aa  327  3e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1569  cysteine desulfurase NifS  44.79 
 
 		 389 aa  327  3e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00349258  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  45.31 
 
 		 393 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  43.08 
 
 		 400 aa  326  5e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2431  aminotransferase, class V  46.74 
 
 		 390 aa  326  5e-88  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0437  cysteine desulfurase NifS  43.75 
 
 		 386 aa  324  2e-87  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.361233 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01630  Nitrogen fixation cysteine desulfurase, nifS  43.11 
 
 		 402 aa  324  2e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1558  cysteine desulfurase NifS  44.59 
 
 		 400 aa  323  3e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0572612  normal  0.890663 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  44.7 
 
 		 396 aa  322  6e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1583  aminotransferase class V  46.26 
 
 		 1139 aa  322  6e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2015  aminotransferase, class V  42.97 
 
 		 391 aa  322  6e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0118596  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2683  aminotransferase, class V  43.96 
 
 		 393 aa  322  6e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0397114 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2362  cysteine desulfurase NifS  43.6 
 
 		 399 aa  321  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2630  aminotransferase class V  46.34 
 
 		 1143 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1507  cysteine desulfurase  44.02 
 
 		 402 aa  321  1.9999999999999998e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  43.99 
 
 		 396 aa  320  3e-86  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4245  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  43.49 
 
 		 398 aa  319  5e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2275  aminotransferase, class V  43.99 
 
 		 386 aa  319  7e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1225  cysteine desulfurase NifS  43.88 
 
 		 397 aa  318  2e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000944956 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  44.75 
 
 		 409 aa  317  3e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1257  aminotransferase, class V  46.25 
 
 		 387 aa  315  7e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1811  cysteine desulfurase NifS  44.53 
 
 		 401 aa  315  8e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1783  cysteine desulfurase NifS  44.53 
 
 		 401 aa  315  8e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  43.9 
 
 		 388 aa  315  9e-85  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1515  aminotransferase, class V:aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  41.94 
 
 		 404 aa  315  9.999999999999999e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.894831  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1356  cysteine desulfurase NifS  42.82 
 
 		 402 aa  314  9.999999999999999e-85  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1607  cysteine desulfurase NifS  42.86 
 
 		 388 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.76832  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4134  aminotransferase, class V  44.27 
 
 		 400 aa  313  2.9999999999999996e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0486971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  41.13 
 
 		 398 aa  311  9e-84  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5907  cysteine desulfurase  44.36 
 
 		 404 aa  311  1e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.469117  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  42.89 
 
 		 394 aa  311  2e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1068  aminotransferase, class V  44.1 
 
 		 393 aa  310  2e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0344653  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4262  aminotransferase class V  45.92 
 
 		 395 aa  310  2.9999999999999997e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0953  Cysteine desulfurase  43.6 
 
 		 380 aa  308  6.999999999999999e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3620  cysteine desulfurase NifS  42.46 
 
 		 400 aa  308  8e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.190149 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  40.41 
 
 		 382 aa  308  8e-83  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2122  cysteine desulfurase NifS  44.13 
 
 		 401 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31758 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1551  aminotransferase class V  41.71 
 
 		 383 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1939  aminotransferase class V  42.97 
 
 		 388 aa  303  4.0000000000000003e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024706 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0341  cysteine desulfurase  40.73 
 
 		 388 aa  301  1e-80  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3109  aminotransferase class V  44.99 
 
 		 381 aa  300  2e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00030249  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2498  aminotransferase class V  42.71 
 
 		 381 aa  299  5e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3581  cysteine desulfurase NifS  43.94 
 
 		 404 aa  298  1e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.157563  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  42.17 
 
 		 403 aa  298  1e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1581  aminotransferase, class V  44.47 
 
 		 1135 aa  298  1e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.863454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1344  aminotransferase class V  40.67 
 
 		 406 aa  297  2e-79  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5089  cysteine desulfurase NifS  41.21 
 
 		 410 aa  296  4e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4480  aminotransferase, class V  42.93 
 
 		 381 aa  295  1e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.921351  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2182  aminotransferase, class V  44.04 
 
 		 388 aa  294  1e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.186921 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0719  aminotransferase, class V  43.21 
 
 		 381 aa  294  2e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000547846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0484  aminotransferase, class V  42.09 
 
 		 417 aa  294  2e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0750137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4477  aminotransferase, class V  42.66 
 
 		 381 aa  293  3e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.508200000000001e-19 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0624  aminotransferase, class V  42.89 
 
 		 385 aa  293  3e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292698 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4129  aminotransferase, class V  42.66 
 
 		 381 aa  293  5e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00019108  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4530  aminotransferase, class V  42.66 
 
 		 381 aa  292  7e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000702151  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4140  aminotransferase, class V  42.39 
 
 		 381 aa  292  7e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000996508  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  41.3 
 
 		 389 aa  292  8e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0530  cysteine desulfurase  44.3 
 
 		 387 aa  292  9e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.103474  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0981  aminotransferase, class V  41.82 
 
 		 407 aa  291  2e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.318228 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>