More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0953 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0953  Cysteine desulfurase  100 
 
 
380 aa  776    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2498  aminotransferase class V  79.74 
 
 
381 aa  631  1e-180  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4517  aminotransferase, class V  70.71 
 
 
381 aa  554  1e-157  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0024603  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4480  aminotransferase, class V  69.39 
 
 
381 aa  551  1e-156  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.921351  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4129  aminotransferase, class V  69.92 
 
 
381 aa  552  1e-156  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00019108  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4244  aminotransferase class V  69.66 
 
 
381 aa  553  1e-156  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00204023  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0719  aminotransferase, class V  70.45 
 
 
381 aa  553  1e-156  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000547846  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4530  aminotransferase, class V  69.13 
 
 
381 aa  548  1e-155  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000702151  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4477  aminotransferase, class V  69.66 
 
 
381 aa  550  1e-155  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.508200000000001e-19 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3109  aminotransferase class V  69.39 
 
 
381 aa  548  1e-155  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00030249  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4292  aminotransferase, class V  69.39 
 
 
381 aa  546  1e-154  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000991667  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4140  aminotransferase, class V  69.39 
 
 
381 aa  546  1e-154  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000996508  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4626  aminotransferase, class V  69.39 
 
 
381 aa  546  1e-154  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.058165  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  53.28 
 
 
400 aa  411  1e-113  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0603  aminotransferase, class V  51.85 
 
 
384 aa  403  1e-111  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  51.71 
 
 
404 aa  393  1e-108  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  52.37 
 
 
384 aa  393  1e-108  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  51.84 
 
 
384 aa  392  1e-108  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  52.51 
 
 
392 aa  389  1e-107  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  53.65 
 
 
398 aa  385  1e-106  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  52.27 
 
 
394 aa  385  1e-106  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  52.52 
 
 
398 aa  382  1e-105  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  50.26 
 
 
392 aa  384  1e-105  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  49.87 
 
 
398 aa  379  1e-104  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  52.23 
 
 
392 aa  379  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  52 
 
 
399 aa  375  1e-103  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  49.87 
 
 
398 aa  369  1e-101  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  49.87 
 
 
398 aa  369  1e-101  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  50 
 
 
394 aa  367  1e-100  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  49.6 
 
 
398 aa  363  3e-99  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  49.34 
 
 
414 aa  362  8e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  50.93 
 
 
396 aa  360  2e-98  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  48.81 
 
 
388 aa  360  2e-98  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  50.65 
 
 
409 aa  360  3e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  48.94 
 
 
396 aa  359  4e-98  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1191  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  48.42 
 
 
384 aa  359  4e-98  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  47.23 
 
 
402 aa  358  7e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  48.94 
 
 
396 aa  358  9.999999999999999e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  49.87 
 
 
393 aa  357  9.999999999999999e-98  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2431  aminotransferase, class V  51.18 
 
 
390 aa  357  9.999999999999999e-98  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  48.55 
 
 
394 aa  358  9.999999999999999e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4262  aminotransferase class V  50.13 
 
 
395 aa  357  1.9999999999999998e-97  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  49.6 
 
 
379 aa  355  7.999999999999999e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  45.36 
 
 
382 aa  352  7e-96  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  48.41 
 
 
382 aa  352  7e-96  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1186  aminotransferase, class V  47.34 
 
 
380 aa  349  4e-95  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1426  aminotransferase (class V), putative  46.92 
 
 
370 aa  346  4e-94  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1098  cysteine desulphurase  48.12 
 
 
371 aa  345  5e-94  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1932  cysteine desulfurase NifS  48.81 
 
 
393 aa  345  6e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  48 
 
 
389 aa  344  1e-93  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1713  aminotransferase class V  47.58 
 
 
380 aa  343  2.9999999999999997e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.229931  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1680  aminotransferase, class V  47.58 
 
 
380 aa  343  2.9999999999999997e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.399532  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1939  aminotransferase class V  48.81 
 
 
388 aa  340  2e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00024706 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  46.93 
 
 
403 aa  335  1e-90  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2275  aminotransferase, class V  47.23 
 
 
386 aa  332  6e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0341  cysteine desulfurase  45.87 
 
 
388 aa  331  1e-89  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0248  cysteine desulfurase  47.48 
 
 
383 aa  329  4e-89  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0166722  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_70  aminotransferase, class V  47.24 
 
 
383 aa  329  6e-89  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  47.35 
 
 
400 aa  327  2.0000000000000001e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  46.83 
 
 
396 aa  327  3e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2002  aminotransferase class V  45.95 
 
 
401 aa  326  4.0000000000000003e-88  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.557544 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2232  aminotransferase class V  46.49 
 
 
401 aa  325  9e-88  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  45.87 
 
 
394 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2025  aminotransferase, class V  43.39 
 
 
383 aa  319  5e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  46.56 
 
 
404 aa  317  2e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0356  aminotransferase, class V  46.72 
 
 
390 aa  315  8e-85  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.230832 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1551  aminotransferase class V  45.5 
 
 
383 aa  315  9e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0907  aminotransferase, class V  49.08 
 
 
383 aa  315  9.999999999999999e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000245321  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2122  cysteine desulfurase NifS  46.84 
 
 
401 aa  313  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31758 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4245  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  45.5 
 
 
398 aa  313  1.9999999999999998e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1811  cysteine desulfurase NifS  45.79 
 
 
401 aa  314  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1783  cysteine desulfurase NifS  45.79 
 
 
401 aa  314  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1356  cysteine desulfurase NifS  46.13 
 
 
402 aa  314  1.9999999999999998e-84  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0872  cysteine desulfurase  47.73 
 
 
380 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0149083 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2719  aminotransferase class V  44.53 
 
 
380 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2363  aminotransferase, class V  43.49 
 
 
398 aa  313  2.9999999999999996e-84  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.197402  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0365  aminotransferase class V  44.16 
 
 
401 aa  309  5e-83  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0437125  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0484  aminotransferase, class V  45.12 
 
 
417 aa  309  5.9999999999999995e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0750137  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0720  Cysteine desulfurase  46.86 
 
 
381 aa  308  6.999999999999999e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0206  IscS protein  43.6 
 
 
397 aa  308  6.999999999999999e-83  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.264012  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2412  cysteine desulfurase IscS  45.36 
 
 
403 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2175  aminotransferase class V  43.75 
 
 
398 aa  307  2.0000000000000002e-82  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.670004  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4134  aminotransferase, class V  44.85 
 
 
400 aa  307  2.0000000000000002e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0486971  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1371  aminotransferase class V  44.06 
 
 
387 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00447816  normal  0.862029 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  45.5 
 
 
384 aa  306  3e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1215  aminotransferase class V  47.26 
 
 
390 aa  307  3e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.727858  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1344  aminotransferase class V  43.12 
 
 
406 aa  306  5.0000000000000004e-82  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0199  aminotransferase, class V  45.17 
 
 
382 aa  305  7e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4665  cysteine desulfurase IscS  44.56 
 
 
436 aa  305  7e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3698  cysteine desulfurase IscS  44.56 
 
 
436 aa  305  7e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.789582  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3416  aminotransferase class V  45.26 
 
 
399 aa  305  9.000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.425221  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2352  aminotransferase class V  40.63 
 
 
388 aa  304  1.0000000000000001e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1563  cysteine desulfurase IscS  43.01 
 
 
403 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2296  aminotransferase, class V  46.3 
 
 
394 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2362  cysteine desulfurase NifS  45.48 
 
 
399 aa  303  4.0000000000000003e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3823  cysteine desulfurase IscS  44.3 
 
 
403 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.474065 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4757  aminotransferase, class V  44.23 
 
 
380 aa  302  6.000000000000001e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4044  aminotransferase, class V  43.27 
 
 
389 aa  302  6.000000000000001e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.159236 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4479  aminotransferase class V  43.51 
 
 
380 aa  302  7.000000000000001e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0478  aminotransferase, class V  43.68 
 
 
380 aa  302  8.000000000000001e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000122406 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>