More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1558 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1558  cysteine desulfurase NifS  100 
 
 		 400 aa  813    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0572612  normal  0.890663 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0108  aminotransferase class V  71.03 
 
 		 400 aa  588  1e-167  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.702313 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1515  aminotransferase, class V:aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  66.25 
 
 		 404 aa  565  1e-160  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.894831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3620  cysteine desulfurase NifS  67.75 
 
 		 400 aa  551  1e-156  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.190149 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1507  cysteine desulfurase  64.18 
 
 		 402 aa  543  1e-153  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3581  cysteine desulfurase NifS  70.96 
 
 		 404 aa  542  1e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.157563  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1225  cysteine desulfurase NifS  64.48 
 
 		 397 aa  537  1e-151  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000944956 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01630  Nitrogen fixation cysteine desulfurase, nifS  63.68 
 
 		 402 aa  536  1e-151  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5907  cysteine desulfurase  69.87 
 
 		 404 aa  520  1e-146  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.469117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  62.47 
 
 		 404 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2683  aminotransferase, class V  61.82 
 
 		 393 aa  492  9.999999999999999e-139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0397114 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5089  cysteine desulfurase NifS  62.92 
 
 		 410 aa  488  1e-137  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  62.05 
 
 		 396 aa  490  1e-137  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4451  aminotransferase, class V  64.57 
 
 		 397 aa  490  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  60.15 
 
 		 400 aa  487  1e-136  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0504  cysteine desulfurase NifS  59.7 
 
 		 402 aa  486  1e-136  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1085  aminotransferase, class V  63.97 
 
 		 407 aa  487  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1833  aminotransferase, class V  62.5 
 
 		 389 aa  485  1e-136  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0175075  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1257  aminotransferase, class V  63.28 
 
 		 387 aa  484  1e-135  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0530  cysteine desulfurase  63.8 
 
 		 387 aa  481  1e-135  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.103474  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2182  aminotransferase, class V  63.54 
 
 		 388 aa  482  1e-135  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.186921 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  60.36 
 
 		 384 aa  478  1e-134  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  59.44 
 
 		 407 aa  479  1e-134  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0981  aminotransferase, class V  62.92 
 
 		 407 aa  476  1e-133  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.318228 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1607  cysteine desulfurase NifS  61.98 
 
 		 388 aa  473  1e-132  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.76832  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1356  cysteine desulfurase NifS  58.25 
 
 		 402 aa  471  1e-132  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2011  cysteine desulfurase  61.14 
 
 		 391 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.079673  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0437  cysteine desulfurase NifS  57.29 
 
 		 386 aa  469  1.0000000000000001e-131  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.361233 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2362  cysteine desulfurase NifS  59.79 
 
 		 399 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2296  aminotransferase, class V  61.46 
 
 		 394 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4245  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  59.38 
 
 		 398 aa  464  1e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2015  aminotransferase, class V  60.16 
 
 		 391 aa  463  1e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0118596  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4134  aminotransferase, class V  58.31 
 
 		 400 aa  462  1e-129  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0486971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1811  cysteine desulfurase NifS  58.46 
 
 		 401 aa  460  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1783  cysteine desulfurase NifS  58.46 
 
 		 401 aa  460  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1569  cysteine desulfurase NifS  60.68 
 
 		 389 aa  456  1e-127  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00349258  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0992  cysteine desulfurase  58.55 
 
 		 391 aa  457  1e-127  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00026474  normal  0.256714 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2647  cysteine desulfurase NifS  59.9 
 
 		 389 aa  451  1.0000000000000001e-126  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00311085 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2122  cysteine desulfurase NifS  57.44 
 
 		 401 aa  444  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31758 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0100  cysteine desulfurase NifS  56.92 
 
 		 400 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  52.28 
 
 		 396 aa  412  1e-114  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  51.04 
 
 		 398 aa  394  1e-108  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  48.56 
 
 		 384 aa  385  1e-106  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  48.59 
 
 		 400 aa  383  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  47.78 
 
 		 384 aa  380  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  47.59 
 
 		 392 aa  377  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0688  cysteine desulfurase NifS  48.7 
 
 		 388 aa  378  1e-103  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0297222  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  48.05 
 
 		 394 aa  374  1e-102  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  50.13 
 
 		 392 aa  372  1e-102  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  48.72 
 
 		 414 aa  368  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  50.13 
 
 		 396 aa  370  1e-101  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  47.92 
 
 		 398 aa  371  1e-101  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  48.45 
 
 		 398 aa  369  1e-101  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  48.45 
 
 		 398 aa  369  1e-101  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  50 
 
 		 404 aa  366  1e-100  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  49.09 
 
 		 388 aa  365  1e-100  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  45.94 
 
 		 392 aa  368  1e-100  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  50 
 
 		 399 aa  367  1e-100  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  48.05 
 
 		 398 aa  365  1e-99  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  49.74 
 
 		 379 aa  362  5.0000000000000005e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  50.38 
 
 		 409 aa  362  9e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  45.83 
 
 		 394 aa  361  1e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  44.65 
 
 		 382 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  46.82 
 
 		 396 aa  355  5.999999999999999e-97  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1932  cysteine desulfurase NifS  46.55 
 
 		 393 aa  354  1e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  47.79 
 
 		 398 aa  352  5e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  46.6 
 
 		 382 aa  351  1e-95  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  47.8 
 
 		 402 aa  350  2e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  46.86 
 
 		 393 aa  350  3e-95  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0484  aminotransferase, class V  46.53 
 
 		 417 aa  346  4e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0750137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2154  cysteine desulfurase, NifS family  46.34 
 
 		 396 aa  345  6e-94  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2275  aminotransferase, class V  47.41 
 
 		 386 aa  345  7e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1563  cysteine desulfurase IscS  45.36 
 
 		 403 aa  345  8e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4262  aminotransferase class V  51.41 
 
 		 395 aa  344  2e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0403  aminotransferase class V  50.54 
 
 		 378 aa  343  2.9999999999999997e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0042  NifS family cysteine desulfurase  46.34 
 
 		 396 aa  343  2.9999999999999997e-93  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  48.44 
 
 		 394 aa  339  5.9999999999999996e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2002  aminotransferase class V  46.67 
 
 		 401 aa  337  1.9999999999999998e-91  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.557544 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1939  aminotransferase class V  46.34 
 
 		 388 aa  335  9e-91  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024706 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1163  NifS family cysteine desulfurase  46.34 
 
 		 396 aa  334  1e-90  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2431  aminotransferase, class V  47.78 
 
 		 390 aa  333  4e-90  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2175  aminotransferase class V  44.87 
 
 		 398 aa  330  3e-89  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.670004  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0229  Cysteine desulfurase  44.59 
 
 		 405 aa  329  5.0000000000000004e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1875  cysteine desulfurase  46.25 
 
 		 407 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.795233  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0365  aminotransferase class V  44.99 
 
 		 401 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0437125  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  46.15 
 
 		 394 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1144  cysteine desulfurase  45.74 
 
 		 407 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282524  normal  0.237339 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1770  NifS family cysteine desulfurase  46.07 
 
 		 396 aa  327  2.0000000000000001e-88  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.406981  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0534  aminotransferase class V  47.69 
 
 		 394 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2163  cysteine desulfurase  45.74 
 
 		 407 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.675105  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2232  aminotransferase class V  45.13 
 
 		 401 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2036  cysteine desulfurase  45.74 
 
 		 407 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.639443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2599  cysteine desulfurase  45.99 
 
 		 407 aa  327  3e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129174  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  43.01 
 
 		 389 aa  326  5e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0872  cysteine desulfurase  49.34 
 
 		 380 aa  326  6e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0149083 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2733  cysteine desulfurase  45.74 
 
 		 407 aa  325  7e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1696  cysteine desulfurase  43.22 
 
 		 396 aa  325  7e-88  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  43.43 
 
 		 403 aa  325  9e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2655  cysteine desulfurase  45.74 
 
 		 407 aa  325  9e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1019  pyridoxal-phosphate-dependent aminotransferase (NIFS protein)  44.96 
 
 		 405 aa  323  3e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.103423  normal  0.217288 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>