More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1257 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1257  aminotransferase, class V  100 
 
 		 387 aa  769    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0530  cysteine desulfurase  88.89 
 
 		 387 aa  670    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.103474  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2182  aminotransferase, class V  88.63 
 
 		 388 aa  672    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.186921 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1558  cysteine desulfurase NifS  63.28 
 
 		 400 aa  496  1e-139  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0572612  normal  0.890663 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01630  Nitrogen fixation cysteine desulfurase, nifS  60.42 
 
 		 402 aa  480  1e-134  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1507  cysteine desulfurase  59.9 
 
 		 402 aa  480  1e-134  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3620  cysteine desulfurase NifS  64.08 
 
 		 400 aa  478  1e-133  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.190149 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1225  cysteine desulfurase NifS  60.16 
 
 		 397 aa  475  1e-133  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000944956 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1515  aminotransferase, class V:aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  59.02 
 
 		 404 aa  472  1e-132  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.894831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3581  cysteine desulfurase NifS  66.58 
 
 		 404 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.157563  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0108  aminotransferase class V  60.57 
 
 		 400 aa  464  1e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.702313 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0504  cysteine desulfurase NifS  60.68 
 
 		 402 aa  461  9.999999999999999e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  57.47 
 
 		 400 aa  458  9.999999999999999e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4451  aminotransferase, class V  59.38 
 
 		 397 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1356  cysteine desulfurase NifS  55.81 
 
 		 402 aa  441  1e-123  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2683  aminotransferase, class V  56.77 
 
 		 393 aa  444  1e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0397114 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  56.48 
 
 		 384 aa  438  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4245  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  56.85 
 
 		 398 aa  435  1e-121  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0981  aminotransferase, class V  59.48 
 
 		 407 aa  435  1e-121  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.318228 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0437  cysteine desulfurase NifS  53 
 
 		 386 aa  434  1e-120  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.361233 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5907  cysteine desulfurase  60.31 
 
 		 404 aa  433  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.469117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5089  cysteine desulfurase NifS  59.22 
 
 		 410 aa  434  1e-120  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1833  aminotransferase, class V  55.04 
 
 		 389 aa  430  1e-119  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0175075  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2122  cysteine desulfurase NifS  56.48 
 
 		 401 aa  428  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31758 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1085  aminotransferase, class V  58.75 
 
 		 407 aa  428  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2362  cysteine desulfurase NifS  55.61 
 
 		 399 aa  429  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  53.87 
 
 		 396 aa  426  1e-118  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2011  cysteine desulfurase  54.5 
 
 		 391 aa  421  1e-117  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.079673  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1607  cysteine desulfurase NifS  53.59 
 
 		 388 aa  423  1e-117  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.76832  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1783  cysteine desulfurase NifS  56.25 
 
 		 401 aa  422  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1811  cysteine desulfurase NifS  56.25 
 
 		 401 aa  422  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4134  aminotransferase, class V  53.63 
 
 		 400 aa  422  1e-117  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0486971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2015  aminotransferase, class V  54.36 
 
 		 391 aa  422  1e-117  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0118596  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  53.89 
 
 		 404 aa  419  1e-116  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2296  aminotransferase, class V  55.04 
 
 		 394 aa  418  1e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2647  cysteine desulfurase NifS  54.26 
 
 		 389 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00311085 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0992  cysteine desulfurase  52.7 
 
 		 391 aa  415  9.999999999999999e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00026474  normal  0.256714 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1569  cysteine desulfurase NifS  53.75 
 
 		 389 aa  415  9.999999999999999e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00349258  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  52.43 
 
 		 407 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0100  cysteine desulfurase NifS  52.6 
 
 		 400 aa  404  1e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  52.06 
 
 		 396 aa  382  1e-105  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  48.83 
 
 		 384 aa  372  1e-102  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  48.56 
 
 		 384 aa  371  1e-101  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  49.61 
 
 		 392 aa  370  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  50.52 
 
 		 399 aa  365  1e-99  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  48.17 
 
 		 398 aa  363  2e-99  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0688  cysteine desulfurase NifS  46.35 
 
 		 388 aa  364  2e-99  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0297222  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  49.48 
 
 		 392 aa  353  4e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  46.34 
 
 		 394 aa  352  5.9999999999999994e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  48.99 
 
 		 398 aa  352  8.999999999999999e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  46.39 
 
 		 404 aa  351  1e-95  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  44.56 
 
 		 414 aa  350  2e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  46.48 
 
 		 392 aa  349  5e-95  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  45.29 
 
 		 394 aa  348  6e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  47.68 
 
 		 396 aa  345  6e-94  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  45.13 
 
 		 398 aa  345  8.999999999999999e-94  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  45.13 
 
 		 398 aa  345  8.999999999999999e-94  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  46.39 
 
 		 396 aa  342  5.999999999999999e-93  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  44.59 
 
 		 393 aa  341  1e-92  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  49.34 
 
 		 379 aa  341  1e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  43.95 
 
 		 382 aa  340  2e-92  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  43.81 
 
 		 398 aa  340  2.9999999999999998e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2275  aminotransferase, class V  48.44 
 
 		 386 aa  339  4e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  45.22 
 
 		 400 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  48.85 
 
 		 409 aa  336  3.9999999999999995e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  44.62 
 
 		 398 aa  334  1e-90  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  46.34 
 
 		 382 aa  333  4e-90  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  44.76 
 
 		 402 aa  330  2e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2232  aminotransferase class V  46.27 
 
 		 401 aa  330  2e-89  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1939  aminotransferase class V  48.18 
 
 		 388 aa  330  2e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024706 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  47.04 
 
 		 394 aa  329  5.0000000000000004e-89  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0534  aminotransferase class V  46.27 
 
 		 394 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  45.05 
 
 		 388 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  44.36 
 
 		 389 aa  327  3e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0403  aminotransferase class V  49.08 
 
 		 378 aa  325  8.000000000000001e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2431  aminotransferase, class V  47.83 
 
 		 390 aa  324  1e-87  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  49.6 
 
 		 394 aa  323  2e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1068  aminotransferase, class V  48.45 
 
 		 393 aa  323  4e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0344653  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1163  NifS family cysteine desulfurase  44.65 
 
 		 396 aa  323  4e-87  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0206  IscS protein  46.25 
 
 		 397 aa  322  5e-87  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.264012  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2002  aminotransferase class V  45.74 
 
 		 401 aa  319  3.9999999999999996e-86  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.557544 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2154  cysteine desulfurase, NifS family  44.13 
 
 		 396 aa  318  7e-86  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1932  cysteine desulfurase NifS  41.88 
 
 		 393 aa  318  1e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0365  aminotransferase class V  44.7 
 
 		 401 aa  317  2e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0437125  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  44.27 
 
 		 403 aa  316  4e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0235  IscS protein  43.67 
 
 		 398 aa  315  9.999999999999999e-85  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2175  aminotransferase class V  44.7 
 
 		 398 aa  313  1.9999999999999998e-84  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.670004  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4262  aminotransferase class V  47.06 
 
 		 395 aa  313  2.9999999999999996e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2363  aminotransferase, class V  43.93 
 
 		 398 aa  313  2.9999999999999996e-84  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.197402  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2243  aminotransferase class V  47.76 
 
 		 380 aa  313  3.9999999999999997e-84  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1581  aminotransferase, class V  47.79 
 
 		 1135 aa  312  5.999999999999999e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.863454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0042  NifS family cysteine desulfurase  42.97 
 
 		 396 aa  312  6.999999999999999e-84  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1696  cysteine desulfurase  43.44 
 
 		 396 aa  310  2.9999999999999997e-83  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3063  aminotransferase, class V  46.7 
 
 		 383 aa  308  8e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0588987  unclonable  0.000000817205 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1563  cysteine desulfurase IscS  43.78 
 
 		 403 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0341  cysteine desulfurase  39.69 
 
 		 388 aa  305  8.000000000000001e-82  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0248  cysteine desulfurase  44.5 
 
 		 383 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0166722  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_70  aminotransferase, class V  43.72 
 
 		 383 aa  303  3.0000000000000004e-81  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1770  NifS family cysteine desulfurase  42.82 
 
 		 396 aa  302  7.000000000000001e-81  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.406981  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1537  cysteine desulfurase  49.48 
 
 		 393 aa  301  1e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.417733  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>