More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2498 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2498  aminotransferase class V  100 
 
 
381 aa  786    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0953  Cysteine desulfurase  79.74 
 
 
380 aa  631  1e-180  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4517  aminotransferase, class V  70.45 
 
 
381 aa  570  1e-161  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0024603  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0719  aminotransferase, class V  70.18 
 
 
381 aa  568  1e-161  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000547846  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4480  aminotransferase, class V  69.66 
 
 
381 aa  565  1e-160  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.921351  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4129  aminotransferase, class V  69.66 
 
 
381 aa  565  1e-160  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00019108  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4140  aminotransferase, class V  69.39 
 
 
381 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000996508  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4477  aminotransferase, class V  69.39 
 
 
381 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.508200000000001e-19 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3109  aminotransferase class V  69.66 
 
 
381 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00030249  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4244  aminotransferase class V  69.66 
 
 
381 aa  561  1.0000000000000001e-159  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00204023  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4530  aminotransferase, class V  69.39 
 
 
381 aa  562  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000702151  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4292  aminotransferase, class V  69.13 
 
 
381 aa  558  1e-158  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000991667  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4626  aminotransferase, class V  69.13 
 
 
381 aa  558  1e-158  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.058165  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0603  aminotransferase, class V  53.3 
 
 
384 aa  410  1e-113  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  51.84 
 
 
400 aa  403  1e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  52.91 
 
 
384 aa  402  1e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  54.13 
 
 
394 aa  401  9.999999999999999e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  52.38 
 
 
384 aa  397  1e-109  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  51.59 
 
 
392 aa  395  1e-109  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  52.77 
 
 
398 aa  395  1e-109  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  51.99 
 
 
404 aa  393  1e-108  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  50.4 
 
 
392 aa  389  1e-107  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  52 
 
 
398 aa  391  1e-107  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  52.76 
 
 
392 aa  385  1e-106  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  50.13 
 
 
388 aa  382  1e-105  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  51.73 
 
 
398 aa  383  1e-105  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  49.73 
 
 
394 aa  376  1e-103  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  50.4 
 
 
398 aa  377  1e-103  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  49.21 
 
 
396 aa  374  1e-102  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  52.27 
 
 
396 aa  372  1e-102  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  50.13 
 
 
398 aa  374  1e-102  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  50.13 
 
 
398 aa  374  1e-102  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  50 
 
 
379 aa  369  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  49.33 
 
 
394 aa  370  1e-101  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1191  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  50.13 
 
 
384 aa  370  1e-101  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  49.34 
 
 
414 aa  365  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  49.6 
 
 
399 aa  366  1e-100  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  46.95 
 
 
382 aa  361  1e-98  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  49.23 
 
 
409 aa  360  2e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  48.18 
 
 
396 aa  360  3e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  48.81 
 
 
393 aa  359  5e-98  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1098  cysteine desulphurase  47.99 
 
 
371 aa  358  9.999999999999999e-98  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  47.63 
 
 
394 aa  354  2e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4262  aminotransferase class V  47.53 
 
 
395 aa  353  2e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  46.44 
 
 
402 aa  353  2.9999999999999997e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1939  aminotransferase class V  49.18 
 
 
388 aa  353  2.9999999999999997e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00024706 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0872  cysteine desulfurase  50.79 
 
 
380 aa  351  1e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0149083 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1186  aminotransferase, class V  47.49 
 
 
380 aa  350  2e-95  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  45.77 
 
 
382 aa  349  4e-95  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1713  aminotransferase class V  47.76 
 
 
380 aa  348  9e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.229931  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1680  aminotransferase, class V  47.76 
 
 
380 aa  348  9e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.399532  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0341  cysteine desulfurase  46.56 
 
 
388 aa  344  2e-93  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2431  aminotransferase, class V  48.53 
 
 
390 aa  344  2e-93  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  46.4 
 
 
403 aa  342  8e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1932  cysteine desulfurase NifS  48.81 
 
 
393 aa  341  1e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  46.67 
 
 
389 aa  340  2e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2275  aminotransferase, class V  47.49 
 
 
386 aa  340  2.9999999999999998e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  45.5 
 
 
396 aa  338  7e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1426  aminotransferase (class V), putative  45.19 
 
 
370 aa  335  7e-91  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  48.17 
 
 
400 aa  334  1e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4134  aminotransferase, class V  46.4 
 
 
400 aa  334  2e-90  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0486971  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0484  aminotransferase, class V  47.63 
 
 
417 aa  333  3e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0750137  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0248  cysteine desulfurase  47.12 
 
 
383 aa  330  3e-89  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0166722  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0907  aminotransferase, class V  47.37 
 
 
383 aa  330  3e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000245321  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3416  aminotransferase class V  46.84 
 
 
399 aa  330  4e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.425221  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_70  aminotransferase, class V  46.89 
 
 
383 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1356  cysteine desulfurase NifS  45.62 
 
 
402 aa  327  2.0000000000000001e-88  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0992  cysteine desulfurase  45.79 
 
 
391 aa  327  3e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00026474  normal  0.256714 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2243  aminotransferase class V  45.87 
 
 
380 aa  326  4.0000000000000003e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4044  aminotransferase, class V  45.38 
 
 
389 aa  325  8.000000000000001e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.159236 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2122  cysteine desulfurase NifS  47.11 
 
 
401 aa  325  1e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31758 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2002  aminotransferase class V  45.55 
 
 
401 aa  324  2e-87  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.557544 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2296  aminotransferase, class V  47.35 
 
 
394 aa  324  2e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0100  cysteine desulfurase NifS  46.56 
 
 
400 aa  324  2e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0356  aminotransferase, class V  47.27 
 
 
390 aa  323  3e-87  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.230832 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4245  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  46.56 
 
 
398 aa  322  5e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1811  cysteine desulfurase NifS  45.41 
 
 
401 aa  322  7e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1783  cysteine desulfurase NifS  45.41 
 
 
401 aa  322  7e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2362  cysteine desulfurase NifS  46.03 
 
 
399 aa  322  7e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  44.71 
 
 
404 aa  322  9.000000000000001e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0437  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  45.43 
 
 
388 aa  322  9.000000000000001e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00696357  normal  0.223385 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1215  aminotransferase class V  47.26 
 
 
390 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.727858  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01630  Nitrogen fixation cysteine desulfurase, nifS  45.57 
 
 
402 aa  320  1.9999999999999998e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2412  cysteine desulfurase IscS  44.76 
 
 
403 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2232  aminotransferase class V  46.22 
 
 
401 aa  321  1.9999999999999998e-86  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1551  aminotransferase class V  44.97 
 
 
383 aa  320  3e-86  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0673  cysteine desulfurase IscS  46.74 
 
 
407 aa  320  3e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.752721  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0822  cysteine desulfurase IscS  46.74 
 
 
421 aa  320  3e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.02372  normal  0.880264 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1833  aminotransferase, class V  45.77 
 
 
389 aa  320  3.9999999999999996e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0175075  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4665  cysteine desulfurase IscS  44.24 
 
 
436 aa  318  9e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3698  cysteine desulfurase IscS  44.24 
 
 
436 aa  318  9e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.789582  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2719  aminotransferase class V  45.48 
 
 
380 aa  318  1e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1371  aminotransferase class V  45.65 
 
 
387 aa  318  1e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00447816  normal  0.862029 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3031  cysteine desulfurase  45.85 
 
 
404 aa  318  1e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.563846  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6331  cysteine desulfurase IscS  44.85 
 
 
405 aa  317  2e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.134755  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3823  cysteine desulfurase IscS  44.5 
 
 
403 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.474065 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85588  predicted protein  44.85 
 
 
493 aa  317  2e-85  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.464986  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2011  cysteine desulfurase  44.74 
 
 
391 aa  316  4e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.079673  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3063  aminotransferase, class V  42.97 
 
 
383 aa  316  4e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0588987  unclonable  0.000000817205 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02508  cysteine desulfurase, alanine biosynthesis, putative (Eurofung)  45.88 
 
 
507 aa  316  5e-85  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>