More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1426 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_1426  aminotransferase (class V), putative  100 
 
 
370 aa  761    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1098  cysteine desulphurase  61.99 
 
 
371 aa  483  1e-135  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0953  Cysteine desulfurase  46.92 
 
 
380 aa  346  4e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3109  aminotransferase class V  48.13 
 
 
381 aa  344  2e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00030249  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4480  aminotransferase, class V  47.86 
 
 
381 aa  342  4e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.921351  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4292  aminotransferase, class V  47.86 
 
 
381 aa  341  1e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000991667  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4129  aminotransferase, class V  47.86 
 
 
381 aa  341  1e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00019108  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4626  aminotransferase, class V  47.86 
 
 
381 aa  341  1e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.058165  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4477  aminotransferase, class V  47.86 
 
 
381 aa  341  1e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.508200000000001e-19 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4517  aminotransferase, class V  47.86 
 
 
381 aa  340  2e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0024603  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4244  aminotransferase class V  47.59 
 
 
381 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00204023  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4530  aminotransferase, class V  47.59 
 
 
381 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000702151  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0719  aminotransferase, class V  47.86 
 
 
381 aa  339  4e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000547846  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4140  aminotransferase, class V  47.59 
 
 
381 aa  339  5.9999999999999996e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000996508  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2498  aminotransferase class V  45.19 
 
 
381 aa  335  7e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  44.27 
 
 
394 aa  305  1.0000000000000001e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  42.4 
 
 
394 aa  303  4.0000000000000003e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0603  aminotransferase, class V  45.08 
 
 
384 aa  301  1e-80  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1713  aminotransferase class V  44.35 
 
 
380 aa  298  1e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.229931  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1680  aminotransferase, class V  44.35 
 
 
380 aa  298  1e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.399532  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  42.93 
 
 
398 aa  296  3e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  41.71 
 
 
384 aa  296  3e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  41.71 
 
 
384 aa  296  5e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1191  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  44.62 
 
 
384 aa  295  1e-78  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  43.39 
 
 
392 aa  293  2e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  42.02 
 
 
396 aa  293  4e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1186  aminotransferase, class V  43.85 
 
 
380 aa  291  1e-77  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  41.02 
 
 
404 aa  289  6e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  41.87 
 
 
392 aa  286  5e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  39.14 
 
 
392 aa  284  1.0000000000000001e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  42.93 
 
 
396 aa  282  7.000000000000001e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  40 
 
 
414 aa  282  8.000000000000001e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4262  aminotransferase class V  43.78 
 
 
395 aa  282  9e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  40.8 
 
 
398 aa  280  2e-74  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  39.89 
 
 
398 aa  281  2e-74  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  40.8 
 
 
399 aa  277  2e-73  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  41.3 
 
 
409 aa  276  6e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2719  aminotransferase class V  43.13 
 
 
380 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  40.69 
 
 
398 aa  274  2.0000000000000002e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  40.11 
 
 
382 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  40 
 
 
402 aa  273  3e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0720  Cysteine desulfurase  42.02 
 
 
381 aa  273  5.000000000000001e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  39.68 
 
 
398 aa  272  7e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  39.68 
 
 
398 aa  272  7e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  43.62 
 
 
394 aa  271  9e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22050  aminotransferase class V  42.82 
 
 
381 aa  271  1e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.718227  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3320  aminotransferase class V  42.13 
 
 
380 aa  270  2e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1939  aminotransferase class V  39.63 
 
 
388 aa  271  2e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00024706 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4757  aminotransferase, class V  42.47 
 
 
380 aa  269  5e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  39.89 
 
 
400 aa  269  5.9999999999999995e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  39.04 
 
 
393 aa  269  7e-71  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  40.91 
 
 
396 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0478  aminotransferase, class V  43.17 
 
 
380 aa  266  5e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000122406 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4785  aminotransferase, class V  41.92 
 
 
380 aa  265  7e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4546  aminotransferase, class V  41.92 
 
 
380 aa  265  7e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4382  cysteine desulfhydrase, aminotransferase, class V  41.92 
 
 
380 aa  265  7e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4900  aminotransferase, class V  41.92 
 
 
380 aa  265  7e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4783  aminotransferase, class V  41.92 
 
 
380 aa  265  7e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4392  cysteine desulfhydrase, aminotransferase, class V  41.92 
 
 
380 aa  265  1e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4479  aminotransferase class V  42.62 
 
 
380 aa  265  1e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4766  aminotransferase, class V  41.92 
 
 
380 aa  264  2e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2025  aminotransferase, class V  40.48 
 
 
383 aa  264  2e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2362  cysteine desulfurase NifS  41.55 
 
 
399 aa  262  6e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  40.48 
 
 
396 aa  262  8e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2352  aminotransferase class V  39.58 
 
 
388 aa  261  1e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1099  aminotransferase class V  40.05 
 
 
378 aa  259  4e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.386639  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  39.95 
 
 
404 aa  258  1e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1932  cysteine desulfurase NifS  40.53 
 
 
393 aa  258  1e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0248  cysteine desulfurase  40 
 
 
383 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0166722  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6331  cysteine desulfurase IscS  39.08 
 
 
405 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.134755  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  37.43 
 
 
382 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  38.2 
 
 
389 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1475  Cysteine desulfurase  40 
 
 
371 aa  254  2.0000000000000002e-66  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004360  cysteine desulfurase  39.52 
 
 
404 aa  253  5.000000000000001e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.591204  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  39.04 
 
 
394 aa  253  6e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1215  aminotransferase class V  39.02 
 
 
390 aa  252  7e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.727858  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1656  cysteine desulfurase IscS  37.99 
 
 
408 aa  251  2e-65  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0819836  unclonable  0.0000556983 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  37.07 
 
 
388 aa  251  2e-65  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  38.67 
 
 
403 aa  250  3e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0199  aminotransferase, class V  41.76 
 
 
382 aa  250  3e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4665  cysteine desulfurase IscS  38.03 
 
 
436 aa  250  3e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3698  cysteine desulfurase IscS  38.03 
 
 
436 aa  250  3e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.789582  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2431  aminotransferase, class V  40.11 
 
 
390 aa  250  3e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2412  cysteine desulfurase IscS  37.5 
 
 
403 aa  249  4e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1064  aminotransferase, class V  39.04 
 
 
387 aa  249  5e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3823  cysteine desulfurase IscS  37.77 
 
 
403 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.474065 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_70  aminotransferase, class V  38.93 
 
 
383 aa  248  1e-64  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01055  cysteine desulfurase  38.77 
 
 
404 aa  248  1e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  38.13 
 
 
379 aa  247  2e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2002  aminotransferase class V  39.9 
 
 
401 aa  248  2e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.557544 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1770  NifS family cysteine desulfurase  39.89 
 
 
396 aa  246  6e-64  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.406981  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2179  cysteine desulfurase  38.13 
 
 
373 aa  246  6e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1477  putative cysteine desulfurase  37.73 
 
 
408 aa  245  6.999999999999999e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.339117  hitchhiker  0.000732384 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1403  aminotransferase, class V  39.89 
 
 
381 aa  245  6.999999999999999e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.862736  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0277  cysteine desulfurase  40.34 
 
 
404 aa  245  9.999999999999999e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0284858  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1667  aminotransferase, class V  39.89 
 
 
381 aa  244  9.999999999999999e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1684  aminotransferase class V  39.47 
 
 
387 aa  244  9.999999999999999e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4044  aminotransferase, class V  39.78 
 
 
389 aa  244  1.9999999999999999e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.159236 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1629  cysteine desulfurase IscS  38.1 
 
 
408 aa  243  3e-63  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000331255  hitchhiker  0.0000285871 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0100  cysteine desulfurase NifS  38.61 
 
 
400 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.873822 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>