More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_1475 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_1475  Cysteine desulfurase  100 
 
 		 371 aa  746    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1099  aminotransferase class V  42.9 
 
 		 378 aa  293  2e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.386639  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  39.52 
 
 		 394 aa  282  8.000000000000001e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  40.86 
 
 		 384 aa  279  5e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  38.01 
 
 		 392 aa  278  1e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  40.21 
 
 		 384 aa  278  1e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  39.52 
 
 		 404 aa  278  2e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  39.35 
 
 		 398 aa  275  9e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0720  Cysteine desulfurase  40.64 
 
 		 381 aa  272  7e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1098  cysteine desulphurase  41.02 
 
 		 371 aa  272  9e-72  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  40.11 
 
 		 396 aa  271  9e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  39.78 
 
 		 394 aa  271  1e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  37.47 
 
 		 399 aa  270  4e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  38.93 
 
 		 400 aa  268  1e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1403  aminotransferase, class V  40.32 
 
 		 381 aa  261  1e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.862736  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  37.27 
 
 		 403 aa  261  2e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1667  aminotransferase, class V  40.58 
 
 		 381 aa  261  2e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  36.93 
 
 		 393 aa  260  3e-68  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  37.5 
 
 		 398 aa  260  3e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  37.5 
 
 		 398 aa  260  3e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  39.63 
 
 		 392 aa  258  8e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2719  aminotransferase class V  38.44 
 
 		 380 aa  257  2e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  36.1 
 
 		 398 aa  256  3e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1142  cysteine desulfurase  39.57 
 
 		 384 aa  256  4e-67  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.165458  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  35.66 
 
 		 396 aa  255  7e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2498  aminotransferase class V  35.71 
 
 		 381 aa  255  8e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  36.36 
 
 		 392 aa  254  1.0000000000000001e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1426  aminotransferase (class V), putative  40 
 
 		 370 aa  254  2.0000000000000002e-66  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0953  Cysteine desulfurase  35.12 
 
 		 380 aa  253  3e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0988  cysteine desulfurase  39.04 
 
 		 384 aa  253  5.000000000000001e-66  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00170746  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  35.29 
 
 		 382 aa  252  7e-66  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  38.98 
 
 		 382 aa  252  8.000000000000001e-66  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0719  aminotransferase, class V  38.38 
 
 		 381 aa  252  9.000000000000001e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000547846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2025  aminotransferase, class V  39.78 
 
 		 383 aa  251  1e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  36.29 
 
 		 379 aa  251  1e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2122  cysteine desulfurase NifS  37.57 
 
 		 401 aa  250  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31758 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  37.57 
 
 		 396 aa  251  2e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  40.11 
 
 		 394 aa  251  2e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  35.83 
 
 		 414 aa  249  4e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1932  cysteine desulfurase NifS  38.44 
 
 		 393 aa  249  5e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22050  aminotransferase class V  37.5 
 
 		 381 aa  249  5e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.718227  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  37.02 
 
 		 398 aa  249  6e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1356  cysteine desulfurase NifS  38.81 
 
 		 402 aa  249  6e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  36.83 
 
 		 396 aa  249  8e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0097  aminotransferase class V  40.48 
 
 		 377 aa  248  9e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4129  aminotransferase, class V  37.84 
 
 		 381 aa  248  1e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00019108  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  37.17 
 
 		 402 aa  248  1e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4517  aminotransferase, class V  37.84 
 
 		 381 aa  248  1e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0024603  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3109  aminotransferase class V  36.91 
 
 		 381 aa  248  1e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00030249  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4480  aminotransferase, class V  37.57 
 
 		 381 aa  247  2e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.921351  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4479  aminotransferase class V  37.36 
 
 		 380 aa  247  2e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  38.01 
 
 		 400 aa  246  4.9999999999999997e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  34.14 
 
 		 394 aa  245  6.999999999999999e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4477  aminotransferase, class V  37.57 
 
 		 381 aa  245  6.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.508200000000001e-19 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  35.04 
 
 		 398 aa  245  8e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4140  aminotransferase, class V  37.57 
 
 		 381 aa  245  8e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000996508  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4757  aminotransferase, class V  37.09 
 
 		 380 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4292  aminotransferase, class V  37.57 
 
 		 381 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000991667  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4244  aminotransferase class V  37.19 
 
 		 381 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00204023  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4626  aminotransferase, class V  37.57 
 
 		 381 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.058165  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3320  aminotransferase class V  36.73 
 
 		 380 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4530  aminotransferase, class V  37.03 
 
 		 381 aa  243  3e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000702151  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  33.42 
 
 		 389 aa  243  3e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0478  aminotransferase, class V  37.09 
 
 		 380 aa  242  7.999999999999999e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000122406 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0100  cysteine desulfurase NifS  36.29 
 
 		 400 aa  241  1e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4783  aminotransferase, class V  36.54 
 
 		 380 aa  241  2e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4785  aminotransferase, class V  36.54 
 
 		 380 aa  241  2e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4546  aminotransferase, class V  36.54 
 
 		 380 aa  241  2e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4382  cysteine desulfhydrase, aminotransferase, class V  36.54 
 
 		 380 aa  241  2e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4392  cysteine desulfhydrase, aminotransferase, class V  36.54 
 
 		 380 aa  240  2e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4900  aminotransferase, class V  36.54 
 
 		 380 aa  241  2e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2511  aminotransferase, class V  40.48 
 
 		 389 aa  240  2.9999999999999997e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4766  aminotransferase, class V  36.54 
 
 		 380 aa  240  4e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  35.31 
 
 		 407 aa  239  5.999999999999999e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3063  aminotransferase, class V  32.44 
 
 		 383 aa  239  5.999999999999999e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0588987  unclonable  0.000000817205 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2243  aminotransferase class V  34.85 
 
 		 380 aa  238  1e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2008  aminotransferase, class V  37.5 
 
 		 404 aa  238  1e-61  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.475663  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0172  aminotransferase class V  36.58 
 
 		 384 aa  238  1e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.921523  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1811  cysteine desulfurase NifS  36.49 
 
 		 401 aa  237  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1783  cysteine desulfurase NifS  36.49 
 
 		 401 aa  237  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3627  cysteine desulfurase  37.33 
 
 		 404 aa  237  2e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0168495  normal  0.888851 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2683  aminotransferase, class V  36.07 
 
 		 393 aa  238  2e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0397114 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2431  aminotransferase, class V  34.68 
 
 		 390 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  33.78 
 
 		 404 aa  236  5.0000000000000005e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2630  aminotransferase class V  36.54 
 
 		 1143 aa  236  6e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1186  aminotransferase, class V  36.34 
 
 		 380 aa  234  1.0000000000000001e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4044  aminotransferase, class V  36.78 
 
 		 389 aa  235  1.0000000000000001e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.159236 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1939  aminotransferase class V  34.22 
 
 		 388 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024706 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2275  aminotransferase, class V  33.42 
 
 		 386 aa  234  2.0000000000000002e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  34.23 
 
 		 384 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2011  cysteine desulfurase  34.76 
 
 		 391 aa  233  3e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.079673  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0341  cysteine desulfurase  36.19 
 
 		 388 aa  233  3e-60  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3031  cysteine desulfurase  36.63 
 
 		 404 aa  233  5e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.563846  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2179  cysteine desulfurase  38.67 
 
 		 373 aa  232  6e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3027  cysteine desulfurase  36.24 
 
 		 404 aa  232  7.000000000000001e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0576674  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02508  cysteine desulfurase, alanine biosynthesis, putative (Eurofung)  35.11 
 
 		 507 aa  232  8.000000000000001e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1569  cysteine desulfurase NifS  35.31 
 
 		 389 aa  232  8.000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00349258  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1244  cysteine desulfurase  36.1 
 
 		 404 aa  231  1e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1680  aminotransferase, class V  36.07 
 
 		 380 aa  231  1e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.399532  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2296  aminotransferase, class V  33.42 
 
 		 394 aa  231  1e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>