More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1667 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1667  aminotransferase, class V  100 
 
 		 381 aa  775    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1403  aminotransferase, class V  96.33 
 
 		 381 aa  754    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.862736  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1684  aminotransferase class V  45.79 
 
 		 387 aa  338  8e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1547  aminotransferase class V  44.68 
 
 		 382 aa  335  7e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2025  aminotransferase, class V  46.11 
 
 		 383 aa  333  3e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22050  aminotransferase class V  43.98 
 
 		 381 aa  329  6e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.718227  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2719  aminotransferase class V  44.09 
 
 		 380 aa  326  4.0000000000000003e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1064  aminotransferase, class V  44.62 
 
 		 387 aa  325  6e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2302  aminotransferase class V  44.53 
 
 		 395 aa  323  3e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.729781  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2352  aminotransferase class V  45.14 
 
 		 388 aa  321  9.999999999999999e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0199  aminotransferase, class V  44.33 
 
 		 382 aa  317  3e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0720  Cysteine desulfurase  43.72 
 
 		 381 aa  317  3e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1273  cysteine desulfhydrase  43.19 
 
 		 380 aa  315  9.999999999999999e-85  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.000000190468  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1331  aminotransferase, class V  43.19 
 
 		 380 aa  315  9.999999999999999e-85  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000957833  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4479  aminotransferase class V  43.68 
 
 		 380 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3320  aminotransferase class V  42.56 
 
 		 380 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0478  aminotransferase, class V  43.13 
 
 		 380 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000122406 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  42.3 
 
 		 392 aa  306  3e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4757  aminotransferase, class V  42.86 
 
 		 380 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4785  aminotransferase, class V  42.58 
 
 		 380 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4546  aminotransferase, class V  42.58 
 
 		 380 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4382  cysteine desulfhydrase, aminotransferase, class V  42.58 
 
 		 380 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4783  aminotransferase, class V  42.58 
 
 		 380 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4900  aminotransferase, class V  42.58 
 
 		 380 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4392  cysteine desulfhydrase, aminotransferase, class V  42.58 
 
 		 380 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4766  aminotransferase, class V  42.58 
 
 		 380 aa  302  5.000000000000001e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0988  cysteine desulfurase  42.11 
 
 		 384 aa  301  9e-81  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00170746  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0097  aminotransferase class V  41.8 
 
 		 377 aa  300  2e-80  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1142  cysteine desulfurase  41.84 
 
 		 384 aa  298  7e-80  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.165458  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2011  cysteine desulfurase  41.36 
 
 		 391 aa  294  2e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.079673  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  41.99 
 
 		 404 aa  294  2e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0992  cysteine desulfurase  40.05 
 
 		 391 aa  293  5e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00026474  normal  0.256714 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  39.58 
 
 		 398 aa  290  3e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  41.36 
 
 		 382 aa  289  7e-77  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1833  aminotransferase, class V  40.84 
 
 		 389 aa  289  7e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0175075  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  40.16 
 
 		 396 aa  288  1e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  38.85 
 
 		 404 aa  287  2e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1224  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  42.41 
 
 		 384 aa  287  2e-76  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000183022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  39.11 
 
 		 400 aa  284  2.0000000000000002e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1132  cysteine desulfurase  41.45 
 
 		 404 aa  282  7.000000000000001e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2647  cysteine desulfurase NifS  39.53 
 
 		 389 aa  281  1e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00311085 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  41.25 
 
 		 398 aa  281  1e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  41.25 
 
 		 398 aa  281  1e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0277  cysteine desulfurase  40.93 
 
 		 404 aa  280  3e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0284858  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3109  aminotransferase class V  42.78 
 
 		 381 aa  280  4e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00030249  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4134  aminotransferase, class V  41.1 
 
 		 400 aa  280  4e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0486971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1569  cysteine desulfurase NifS  39.27 
 
 		 389 aa  279  5e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00349258  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  40.58 
 
 		 398 aa  279  6e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2296  aminotransferase, class V  39.11 
 
 		 394 aa  278  1e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  40.84 
 
 		 394 aa  278  1e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08616  iron-sulfur cofactor synthesis protein  42.22 
 
 		 382 aa  277  2e-73  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  41.75 
 
 		 394 aa  276  3e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0717  cysteine desulfurase  39.12 
 
 		 406 aa  276  3e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2362  cysteine desulfurase NifS  39.47 
 
 		 399 aa  276  3e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  41.73 
 
 		 400 aa  276  4e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  38.85 
 
 		 384 aa  276  5e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1099  aminotransferase class V  41.99 
 
 		 378 aa  276  5e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.386639  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1356  cysteine desulfurase NifS  39.11 
 
 		 402 aa  276  6e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  41.1 
 
 		 384 aa  276  6e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004360  cysteine desulfurase  39.64 
 
 		 404 aa  275  7e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.591204  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  38.58 
 
 		 407 aa  275  9e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1186  aminotransferase, class V  40.53 
 
 		 380 aa  275  1.0000000000000001e-72  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01055  cysteine desulfurase  39.38 
 
 		 404 aa  274  2.0000000000000002e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  40.05 
 
 		 399 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  40.42 
 
 		 396 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0502  aminotransferase, class V  40.98 
 
 		 382 aa  274  2.0000000000000002e-72  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000217795  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0450  aminotransferase (class V), putative  39.07 
 
 		 381 aa  274  2.0000000000000002e-72  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0570589  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  41.36 
 
 		 382 aa  273  3e-72  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85588  predicted protein  40.52 
 
 		 493 aa  273  3e-72  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.464986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  41.1 
 
 		 384 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2122  cysteine desulfurase NifS  39.9 
 
 		 401 aa  271  1e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31758 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1680  aminotransferase, class V  41.33 
 
 		 380 aa  271  1e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.399532  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1713  aminotransferase class V  41.33 
 
 		 380 aa  271  1e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.229931  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0713  Cysteine desulfurase  39.16 
 
 		 380 aa  271  1e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4245  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  40.68 
 
 		 398 aa  270  2.9999999999999997e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4480  aminotransferase, class V  41.69 
 
 		 381 aa  269  5e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.921351  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0953  Cysteine desulfurase  39.58 
 
 		 380 aa  269  5.9999999999999995e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  38.44 
 
 		 392 aa  269  5.9999999999999995e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3416  aminotransferase class V  38.9 
 
 		 399 aa  269  7e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.425221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2154  cysteine desulfurase, NifS family  40.31 
 
 		 396 aa  268  1e-70  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3485  cysteine desulfurase  41.21 
 
 		 375 aa  268  1e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0611643 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02508  cysteine desulfurase, alanine biosynthesis, putative (Eurofung)  39.64 
 
 		 507 aa  266  2.9999999999999995e-70  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4244  aminotransferase class V  41.42 
 
 		 381 aa  266  4e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00204023  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5432  cysteine desulfurase  39.38 
 
 		 407 aa  266  4e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.116144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4530  aminotransferase, class V  41.42 
 
 		 381 aa  266  4e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000702151  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1373  cysteine desulphurase  39.62 
 
 		 381 aa  266  5e-70  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00618105  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2733  cysteine desulfurase  39.06 
 
 		 407 aa  266  5e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0172  aminotransferase class V  40.84 
 
 		 384 aa  266  5e-70  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.921523  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  39.74 
 
 		 398 aa  266  5e-70  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1144  cysteine desulfurase  39.38 
 
 		 407 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282524  normal  0.237339 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2205  cysteine desulfurase IscS  39.58 
 
 		 403 aa  266  7e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00230458  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4140  aminotransferase, class V  40.6 
 
 		 381 aa  265  8e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000996508  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0719  aminotransferase, class V  41.69 
 
 		 381 aa  265  8e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000547846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2579  cysteine desulfurase  39.32 
 
 		 407 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120053  hitchhiker  0.000683499 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  36.03 
 
 		 403 aa  265  8.999999999999999e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2655  cysteine desulfurase  38.8 
 
 		 407 aa  265  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2599  cysteine desulfurase  38.8 
 
 		 407 aa  265  1e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129174  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2317  cysteine desulfurase  37.89 
 
 		 404 aa  265  1e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.459864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4477  aminotransferase, class V  40.6 
 
 		 381 aa  265  1e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.508200000000001e-19 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1489  cysteine desulfurase  38.6 
 
 		 407 aa  264  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.71249  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>