More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0097 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_0097  aminotransferase class V  100 
 
 
377 aa  776    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1142  cysteine desulfurase  52.27 
 
 
384 aa  414  1e-114  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.165458  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0988  cysteine desulfurase  52.27 
 
 
384 aa  411  1e-113  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00170746  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2719  aminotransferase class V  42.82 
 
 
380 aa  314  9.999999999999999e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0199  aminotransferase, class V  40.21 
 
 
382 aa  308  1.0000000000000001e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0720  Cysteine desulfurase  42.06 
 
 
381 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22050  aminotransferase class V  41.53 
 
 
381 aa  306  5.0000000000000004e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.718227  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  41.64 
 
 
394 aa  305  1.0000000000000001e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3320  aminotransferase class V  41.84 
 
 
380 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  42.02 
 
 
404 aa  301  1e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1667  aminotransferase, class V  41.8 
 
 
381 aa  300  2e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  42.02 
 
 
404 aa  300  4e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  40.05 
 
 
393 aa  299  6e-80  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1403  aminotransferase, class V  41.01 
 
 
381 aa  296  3e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.862736  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2352  aminotransferase class V  40.5 
 
 
388 aa  295  1e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  41.76 
 
 
407 aa  295  1e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1224  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  41.98 
 
 
384 aa  293  2e-78  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000183022  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  40.79 
 
 
399 aa  294  2e-78  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  41.49 
 
 
396 aa  293  3e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4479  aminotransferase class V  41.37 
 
 
380 aa  293  3e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0450  aminotransferase (class V), putative  42.93 
 
 
381 aa  293  5e-78  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0570589  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4757  aminotransferase, class V  41.1 
 
 
380 aa  292  6e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2025  aminotransferase, class V  40.58 
 
 
383 aa  292  7e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0478  aminotransferase, class V  41.37 
 
 
380 aa  291  2e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000122406 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0534  pyridoxal-phosphate dependent aminotransferase  39.79 
 
 
381 aa  290  2e-77  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  38.83 
 
 
394 aa  290  2e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  39.63 
 
 
384 aa  290  3e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0992  cysteine desulfurase  39.36 
 
 
391 aa  290  4e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00026474  normal  0.256714 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2011  cysteine desulfurase  39.26 
 
 
391 aa  289  7e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.079673  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  39.89 
 
 
384 aa  288  8e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  40.32 
 
 
382 aa  288  1e-76  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  40.11 
 
 
384 aa  287  2e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4785  aminotransferase, class V  40.82 
 
 
380 aa  287  2e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4546  aminotransferase, class V  40.82 
 
 
380 aa  287  2e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4382  cysteine desulfhydrase, aminotransferase, class V  40.82 
 
 
380 aa  287  2e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4392  cysteine desulfhydrase, aminotransferase, class V  40.82 
 
 
380 aa  287  2e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0502  aminotransferase, class V  41.55 
 
 
382 aa  287  2e-76  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000217795  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4783  aminotransferase, class V  40.82 
 
 
380 aa  287  2e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4900  aminotransferase, class V  40.82 
 
 
380 aa  287  2e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2683  aminotransferase, class V  41.76 
 
 
393 aa  287  2e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0397114 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  41.99 
 
 
396 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4766  aminotransferase, class V  40.82 
 
 
380 aa  286  4e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  40.98 
 
 
382 aa  286  4e-76  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1373  cysteine desulphurase  41.55 
 
 
381 aa  285  9e-76  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00618105  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2296  aminotransferase, class V  40.32 
 
 
394 aa  285  9e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1356  cysteine desulfurase NifS  40.16 
 
 
402 aa  285  1.0000000000000001e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  37.6 
 
 
392 aa  283  3.0000000000000004e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0100  cysteine desulfurase NifS  40.32 
 
 
400 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  38.46 
 
 
400 aa  281  2e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  44.07 
 
 
394 aa  280  3e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  38.4 
 
 
394 aa  280  3e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1569  cysteine desulfurase NifS  39.26 
 
 
389 aa  279  4e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00349258  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2122  cysteine desulfurase NifS  41.32 
 
 
401 aa  280  4e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31758 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  38.79 
 
 
400 aa  279  6e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1783  cysteine desulfurase NifS  39.52 
 
 
401 aa  278  8e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1811  cysteine desulfurase NifS  39.52 
 
 
401 aa  278  8e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  39.05 
 
 
396 aa  278  8e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  40.89 
 
 
392 aa  278  9e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  38.1 
 
 
403 aa  278  1e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  39.95 
 
 
402 aa  278  1e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  38.26 
 
 
414 aa  278  2e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  37.04 
 
 
388 aa  277  3e-73  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  38.99 
 
 
398 aa  277  3e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  37.53 
 
 
409 aa  276  4e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2647  cysteine desulfurase NifS  38.73 
 
 
389 aa  275  7e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00311085 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4262  aminotransferase class V  40.47 
 
 
395 aa  275  9e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2362  cysteine desulfurase NifS  40.17 
 
 
399 aa  275  9e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  38.46 
 
 
398 aa  275  1.0000000000000001e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0248  cysteine desulfurase  39.61 
 
 
383 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0166722  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2154  cysteine desulfurase, NifS family  43.25 
 
 
396 aa  273  3e-72  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4051  Cysteine desulfurase  38.64 
 
 
380 aa  272  6e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0863916  normal  0.93961 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  38.12 
 
 
398 aa  272  7e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_70  aminotransferase, class V  39.12 
 
 
383 aa  272  7e-72  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1684  aminotransferase class V  38.3 
 
 
387 aa  272  7e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1833  aminotransferase, class V  38.83 
 
 
389 aa  271  1e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0175075  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4134  aminotransferase, class V  40.5 
 
 
400 aa  271  1e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0486971  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2015  aminotransferase, class V  38.99 
 
 
391 aa  271  1e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0118596  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  39.47 
 
 
398 aa  270  2.9999999999999997e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  39.47 
 
 
398 aa  270  2.9999999999999997e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  37.57 
 
 
396 aa  270  4e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  37.23 
 
 
398 aa  269  5.9999999999999995e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1025  cysteine desulfurase  40.75 
 
 
406 aa  268  1e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00998384  normal  0.30784 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  37.3 
 
 
389 aa  267  2e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4245  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  41.1 
 
 
398 aa  267  2e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2143  cysteine desulfurase  40.21 
 
 
407 aa  267  2e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.950908 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5951  cysteine desulfurase  40.21 
 
 
407 aa  267  2e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.350283  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2126  cysteine desulfurase  40.21 
 
 
407 aa  267  2e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  37.93 
 
 
379 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1583  aminotransferase class V  40.53 
 
 
1139 aa  266  4e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2630  aminotransferase class V  40.93 
 
 
1143 aa  266  4e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1297  aminotransferase class V  37.2 
 
 
403 aa  266  4e-70  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.216598  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0907  aminotransferase, class V  38.34 
 
 
383 aa  266  5.999999999999999e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000245321  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2190  Cysteine desulfurase  37.9 
 
 
406 aa  265  7e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.980213  normal  0.0116553 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1144  cysteine desulfurase  39.68 
 
 
407 aa  265  7e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282524  normal  0.237339 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1507  cysteine desulfurase  39.58 
 
 
402 aa  265  8.999999999999999e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2036  cysteine desulfurase  39.68 
 
 
407 aa  265  1e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.639443  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5432  cysteine desulfurase  39.95 
 
 
407 aa  265  1e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.116144  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0484  aminotransferase, class V  38.95 
 
 
417 aa  265  1e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0750137  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2163  cysteine desulfurase  39.68 
 
 
407 aa  265  1e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.675105  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2733  cysteine desulfurase  39.68 
 
 
407 aa  264  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>