More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1297 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1297  aminotransferase class V  100 
 
 		 403 aa  827    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.216598  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1344  aminotransferase class V  65.06 
 
 		 406 aa  554  1e-156  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  51.18 
 
 		 384 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  50.52 
 
 		 384 aa  401  1e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  49.61 
 
 		 403 aa  398  9.999999999999999e-111  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  49.35 
 
 		 394 aa  389  1e-107  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  46.07 
 
 		 392 aa  384  1e-105  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  47.41 
 
 		 394 aa  384  1e-105  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  47.93 
 
 		 393 aa  380  1e-104  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  47.8 
 
 		 400 aa  374  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  48.05 
 
 		 398 aa  373  1e-102  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  46.37 
 
 		 414 aa  372  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  46.49 
 
 		 396 aa  369  1e-101  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  45.01 
 
 		 404 aa  365  1e-100  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  48.05 
 
 		 396 aa  368  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  47.3 
 
 		 399 aa  367  1e-100  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  47.84 
 
 		 394 aa  365  1e-99  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  47.53 
 
 		 382 aa  363  3e-99  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  46.02 
 
 		 392 aa  362  6e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  46.68 
 
 		 396 aa  360  2e-98  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  47.42 
 
 		 388 aa  360  3e-98  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  43.64 
 
 		 398 aa  360  3e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  44.86 
 
 		 398 aa  358  8e-98  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  46.39 
 
 		 398 aa  358  9e-98  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  46.39 
 
 		 398 aa  358  9e-98  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  45.84 
 
 		 402 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2431  aminotransferase, class V  46.65 
 
 		 390 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  48.06 
 
 		 392 aa  355  1e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  46.75 
 
 		 398 aa  355  1e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1932  cysteine desulfurase NifS  45.09 
 
 		 393 aa  348  1e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  47.77 
 
 		 379 aa  345  1e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  45.1 
 
 		 389 aa  343  4e-93  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  45.57 
 
 		 409 aa  339  5e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2243  aminotransferase class V  44.94 
 
 		 380 aa  330  2e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0992  cysteine desulfurase  44.99 
 
 		 391 aa  331  2e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00026474  normal  0.256714 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4262  aminotransferase class V  45.69 
 
 		 395 aa  327  3e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  44.39 
 
 		 404 aa  326  5e-88  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1833  aminotransferase, class V  43.7 
 
 		 389 aa  325  9e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0175075  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  43.64 
 
 		 396 aa  325  9e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2011  cysteine desulfurase  43.44 
 
 		 391 aa  324  1e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.079673  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3031  cysteine desulfurase  45.02 
 
 		 404 aa  322  7e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.563846  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1939  aminotransferase class V  45.05 
 
 		 388 aa  321  1.9999999999999998e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024706 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01630  Nitrogen fixation cysteine desulfurase, nifS  42.56 
 
 		 402 aa  320  3.9999999999999996e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  43.26 
 
 		 384 aa  319  6e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  42.3 
 
 		 382 aa  318  1e-85  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1244  cysteine desulfurase  44.78 
 
 		 404 aa  318  1e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  41.29 
 
 		 407 aa  317  2e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1569  cysteine desulfurase NifS  42.93 
 
 		 389 aa  317  2e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00349258  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2647  cysteine desulfurase NifS  42.93 
 
 		 389 aa  316  4e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00311085 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2275  aminotransferase, class V  42.6 
 
 		 386 aa  315  7e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0248  cysteine desulfurase  43.01 
 
 		 383 aa  315  9.999999999999999e-85  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0166722  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1558  cysteine desulfurase NifS  42.36 
 
 		 400 aa  314  1.9999999999999998e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0572612  normal  0.890663 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4245  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  43.85 
 
 		 398 aa  313  2.9999999999999996e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2317  cysteine desulfurase  44.25 
 
 		 404 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.459864  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1104  cysteine desulfurase  43.03 
 
 		 404 aa  312  4.999999999999999e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.013649  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  43.08 
 
 		 400 aa  312  5.999999999999999e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3627  cysteine desulfurase  43.03 
 
 		 404 aa  312  5.999999999999999e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0168495  normal  0.888851 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2917  cysteine desulfurase  43.03 
 
 		 404 aa  312  6.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2698  cysteine desulfurase  43.03 
 
 		 404 aa  312  6.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.016381  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2805  cysteine desulfurase  43.03 
 
 		 404 aa  312  6.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2742  cysteine desulfurase  43.03 
 
 		 404 aa  312  6.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.46384  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02422  cysteine desulfurase  43.28 
 
 		 404 aa  312  7.999999999999999e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.657115  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1138  cysteine desulfurase IscS  43.28 
 
 		 404 aa  312  7.999999999999999e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2681  cysteine desulfurase  43.28 
 
 		 404 aa  312  7.999999999999999e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.174524  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2905  cysteine desulfurase  43.28 
 
 		 404 aa  312  7.999999999999999e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0404853  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1147  cysteine desulfurase  43.28 
 
 		 404 aa  312  7.999999999999999e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0105086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2815  cysteine desulfurase  43.28 
 
 		 404 aa  312  7.999999999999999e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00976282  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3762  cysteine desulfurase  43.28 
 
 		 404 aa  312  7.999999999999999e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00149492  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02386  hypothetical protein  43.28 
 
 		 404 aa  312  7.999999999999999e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.730969  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2683  cysteine desulfurase  43.28 
 
 		 404 aa  312  7.999999999999999e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.980146  normal  0.976252 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1553  cysteine desulfurase  42.35 
 
 		 407 aa  311  1e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0484493  normal  0.0430953 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2783  cysteine desulfurase  43.03 
 
 		 404 aa  311  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0158517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2579  cysteine desulfurase  42.35 
 
 		 407 aa  311  2e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120053  hitchhiker  0.000683499 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2751  cysteine desulfurase  43.5 
 
 		 404 aa  310  2e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.173578  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_70  aminotransferase, class V  42.23 
 
 		 383 aa  310  4e-83  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2290  cysteine desulfurase IscS  41.62 
 
 		 405 aa  309  5e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00326388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1507  cysteine desulfurase  41.16 
 
 		 402 aa  309  6.999999999999999e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1875  cysteine desulfurase  42.86 
 
 		 407 aa  308  8e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.795233  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1144  cysteine desulfurase  42.86 
 
 		 407 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282524  normal  0.237339 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3027  cysteine desulfurase  42.54 
 
 		 404 aa  308  1.0000000000000001e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0576674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1489  cysteine desulfurase  42.6 
 
 		 407 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.71249  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1708  cysteine desulfurase  42.6 
 
 		 407 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2217  cysteine desulfurase  42.6 
 
 		 407 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3103  cysteine desulfurase  42.6 
 
 		 407 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.412431  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2190  Cysteine desulfurase  44.42 
 
 		 406 aa  307  3e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.980213  normal  0.0116553 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_34119  precursor of desulfurase cysteine desulfurase IscS  42.27 
 
 		 400 aa  306  3e-82  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.275152  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1515  aminotransferase, class V:aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  42.04 
 
 		 404 aa  306  3e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.894831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2733  cysteine desulfurase  42.86 
 
 		 407 aa  307  3e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3620  cysteine desulfurase NifS  42.86 
 
 		 400 aa  306  3e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.190149 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2655  cysteine desulfurase  42.6 
 
 		 407 aa  306  3e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1019  pyridoxal-phosphate-dependent aminotransferase (NIFS protein)  41.88 
 
 		 405 aa  306  4.0000000000000004e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.103423  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004360  cysteine desulfurase  40.75 
 
 		 404 aa  306  4.0000000000000004e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.591204  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2599  cysteine desulfurase  42.6 
 
 		 407 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129174  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2163  cysteine desulfurase  42.6 
 
 		 407 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.675105  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2036  cysteine desulfurase  42.6 
 
 		 407 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.639443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2015  aminotransferase, class V  41.65 
 
 		 391 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0118596  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0437  cysteine desulfurase NifS  42.19 
 
 		 386 aa  305  6e-82  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.361233 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1225  cysteine desulfurase NifS  41.01 
 
 		 397 aa  306  6e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000944956 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0673  cysteine desulfurase IscS  42.28 
 
 		 407 aa  305  7e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.752721  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0822  cysteine desulfurase IscS  42.28 
 
 		 421 aa  305  7e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.02372  normal  0.880264 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>