More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1186 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1186  aminotransferase, class V  100 
 
 		 380 aa  781    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1680  aminotransferase, class V  80 
 
 		 380 aa  643    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.399532  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1713  aminotransferase class V  80 
 
 		 380 aa  643    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.229931  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3109  aminotransferase class V  49.34 
 
 		 381 aa  372  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00030249  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4129  aminotransferase, class V  47.75 
 
 		 381 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00019108  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4477  aminotransferase, class V  47.75 
 
 		 381 aa  356  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.508200000000001e-19 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4480  aminotransferase, class V  47.75 
 
 		 381 aa  356  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.921351  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4244  aminotransferase class V  47.48 
 
 		 381 aa  354  1e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00204023  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4530  aminotransferase, class V  47.48 
 
 		 381 aa  354  1e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000702151  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4140  aminotransferase, class V  47.48 
 
 		 381 aa  354  2e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000996508  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4517  aminotransferase, class V  46.68 
 
 		 381 aa  353  2e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0024603  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0719  aminotransferase, class V  46.68 
 
 		 381 aa  353  2e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000547846  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4292  aminotransferase, class V  47.48 
 
 		 381 aa  352  8.999999999999999e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000991667  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4626  aminotransferase, class V  47.48 
 
 		 381 aa  352  8.999999999999999e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.058165  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2498  aminotransferase class V  47.49 
 
 		 381 aa  350  2e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0953  Cysteine desulfurase  47.34 
 
 		 380 aa  349  4e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  45.38 
 
 		 394 aa  335  1e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  44.85 
 
 		 398 aa  333  3e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  45.29 
 
 		 398 aa  332  5e-90  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  45.29 
 
 		 398 aa  332  5e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  46.03 
 
 		 398 aa  329  6e-89  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  46.01 
 
 		 384 aa  328  9e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  45.74 
 
 		 384 aa  326  4.0000000000000003e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  43.8 
 
 		 392 aa  325  6e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  44.06 
 
 		 400 aa  321  9.999999999999999e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  44.33 
 
 		 404 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  44.09 
 
 		 398 aa  317  2e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  43.65 
 
 		 394 aa  315  6e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  43.15 
 
 		 409 aa  315  9e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2431  aminotransferase, class V  44.15 
 
 		 390 aa  315  9.999999999999999e-85  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  44.44 
 
 		 396 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  42.59 
 
 		 398 aa  312  5.999999999999999e-84  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  42.06 
 
 		 389 aa  311  9e-84  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  43.27 
 
 		 393 aa  311  2e-83  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4262  aminotransferase class V  42.12 
 
 		 395 aa  309  5.9999999999999995e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  42.97 
 
 		 396 aa  308  6.999999999999999e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  41.25 
 
 		 414 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  41.69 
 
 		 392 aa  307  2.0000000000000002e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  43.83 
 
 		 392 aa  305  6e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  41.53 
 
 		 399 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1098  cysteine desulphurase  45.72 
 
 		 371 aa  303  3.0000000000000004e-81  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  44.41 
 
 		 394 aa  303  4.0000000000000003e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1932  cysteine desulfurase NifS  43.92 
 
 		 393 aa  302  8.000000000000001e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1191  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  42.22 
 
 		 384 aa  302  8.000000000000001e-81  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2025  aminotransferase, class V  44.02 
 
 		 383 aa  301  1e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  41.38 
 
 		 379 aa  298  1e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1939  aminotransferase class V  44.41 
 
 		 388 aa  296  4e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024706 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0603  aminotransferase, class V  44.06 
 
 		 384 aa  296  6e-79  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1458  cysteine desulfurase  43.36 
 
 		 407 aa  295  9e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0365  aminotransferase class V  41.45 
 
 		 401 aa  294  2e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0437125  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2175  aminotransferase class V  42.23 
 
 		 398 aa  293  3e-78  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.670004  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  40.32 
 
 		 402 aa  293  3e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1708  cysteine desulfurase  43.36 
 
 		 407 aa  293  3e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3103  cysteine desulfurase  43.36 
 
 		 407 aa  293  3e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.412431  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1553  cysteine desulfurase  42.82 
 
 		 407 aa  293  3e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0484493  normal  0.0430953 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1489  cysteine desulfurase  43.36 
 
 		 407 aa  293  3e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.71249  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2217  cysteine desulfurase  43.36 
 
 		 407 aa  293  3e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2655  cysteine desulfurase  43.36 
 
 		 407 aa  292  5e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2733  cysteine desulfurase  43.09 
 
 		 407 aa  292  7e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  41.22 
 
 		 382 aa  292  7e-78  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2599  cysteine desulfurase  43.09 
 
 		 407 aa  291  1e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129174  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1058  cysteine desulfurase  42.78 
 
 		 405 aa  291  1e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0834623  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5432  cysteine desulfurase  41.78 
 
 		 407 aa  291  1e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.116144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0235  IscS protein  41.9 
 
 		 398 aa  291  1e-77  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1144  cysteine desulfurase  42.04 
 
 		 407 aa  291  1e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282524  normal  0.237339 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1426  aminotransferase (class V), putative  43.85 
 
 		 370 aa  291  1e-77  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2363  aminotransferase, class V  41.65 
 
 		 398 aa  291  1e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.197402  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2579  cysteine desulfurase  42.82 
 
 		 407 aa  290  3e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120053  hitchhiker  0.000683499 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  41.42 
 
 		 396 aa  290  3e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1875  cysteine desulfurase  43.09 
 
 		 407 aa  290  3e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.795233  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1019  pyridoxal-phosphate-dependent aminotransferase (NIFS protein)  41.19 
 
 		 405 aa  290  4e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.103423  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1950  cysteine desulfurase IscS  42.38 
 
 		 405 aa  289  4e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000000843977  normal  0.404205 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2143  cysteine desulfurase  41.78 
 
 		 407 aa  290  4e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.950908 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5951  cysteine desulfurase  41.78 
 
 		 407 aa  290  4e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.350283  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2126  cysteine desulfurase  41.78 
 
 		 407 aa  290  4e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  40.51 
 
 		 388 aa  289  7e-77  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  41.42 
 
 		 404 aa  288  1e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2205  cysteine desulfurase IscS  41.47 
 
 		 403 aa  288  1e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00230458  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2036  cysteine desulfurase  41.25 
 
 		 407 aa  287  2e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.639443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1360  cysteine desulfurase IscS  42.93 
 
 		 408 aa  287  2e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2163  cysteine desulfurase  41.25 
 
 		 407 aa  287  2e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.675105  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0949  cysteine desulfurase IscS  40.99 
 
 		 405 aa  287  2.9999999999999996e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0399375 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0884  cysteine desulfurase IscS  40.99 
 
 		 405 aa  287  2.9999999999999996e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.293282  normal  0.187166 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2751  cysteine desulfurase  42.23 
 
 		 404 aa  286  5e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.173578  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1025  cysteine desulfurase  41.99 
 
 		 406 aa  286  5e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00998384  normal  0.30784 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2290  cysteine desulfurase IscS  41.21 
 
 		 405 aa  285  5.999999999999999e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00326388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1299  cysteine desulfurase  41.9 
 
 		 404 aa  286  5.999999999999999e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0382772  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2373  cysteine desulfurase IscS  40.68 
 
 		 406 aa  285  8e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.934758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1629  cysteine desulfurase IscS  42.08 
 
 		 408 aa  285  9e-76  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000331255  hitchhiker  0.0000285871 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14730  cysteine desulfurase  42.16 
 
 		 404 aa  285  9e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.179473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0469  cysteine desulfurase IscS  41.88 
 
 		 419 aa  285  1.0000000000000001e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00221025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1833  aminotransferase, class V  40.63 
 
 		 389 aa  284  1.0000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0175075  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0435  cysteine desulfurase  43.49 
 
 		 409 aa  284  1.0000000000000001e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000194235 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1344  aminotransferase class V  41.47 
 
 		 406 aa  285  1.0000000000000001e-75  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1168  cysteine desulfurase  43.49 
 
 		 409 aa  284  2.0000000000000002e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00941489  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  41.93 
 
 		 396 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2719  aminotransferase class V  40.21 
 
 		 380 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1276  cysteine desulfurase  43.49 
 
 		 409 aa  284  2.0000000000000002e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00157162  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1132  cysteine desulfurase  42.74 
 
 		 404 aa  283  3.0000000000000004e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1104  cysteine desulfurase  41.97 
 
 		 404 aa  283  3.0000000000000004e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.013649  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>