More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2729 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_2457  aminotransferase class V  86.7 
 
 		 407 aa  677    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000191049 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2729  aminotransferase, class V  100 
 
 		 408 aa  809    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.560546  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10430  cysteine desulfurase family protein  62.76 
 
 		 412 aa  477  1e-133  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.182592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4255  aminotransferase, class V  62.02 
 
 		 422 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1302  aminotransferase class V  63.08 
 
 		 390 aa  464  1e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8110  Cysteine desulfurase  61.08 
 
 		 387 aa  461  1e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2409  aminotransferase class V  63.68 
 
 		 400 aa  461  9.999999999999999e-129  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3446  aminotransferase, class V  61.95 
 
 		 399 aa  460  9.999999999999999e-129  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.311876  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0688  aminotransferase, class V  62.63 
 
 		 418 aa  456  1e-127  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.446364  normal  0.630962 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2844  aminotransferase class V  60 
 
 		 384 aa  450  1e-125  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2360  Cysteine desulfurase  60.62 
 
 		 387 aa  448  1e-125  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.66071 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2105  aminotransferase, class V  60.47 
 
 		 397 aa  449  1e-125  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08620  cysteine desulfurase family protein  59.64 
 
 		 398 aa  447  1.0000000000000001e-124  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.702147  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1105  Cysteine desulfurase  63.92 
 
 		 401 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.224155  hitchhiker  0.00251554 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1722  aminotransferase class V  57.54 
 
 		 412 aa  441  9.999999999999999e-123  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.185065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3650  aminotransferase, class V  59.95 
 
 		 416 aa  439  9.999999999999999e-123  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3569  aminotransferase class V  60.47 
 
 		 388 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00955537  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6046  aminotransferase class V  62.02 
 
 		 391 aa  434  1e-120  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1443  Cysteine desulfurase  57.37 
 
 		 400 aa  425  1e-118  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.751675  normal  0.957597 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4089  Cysteine desulfurase  59.37 
 
 		 401 aa  425  1e-118  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1855  aminotransferase, class V  59.79 
 
 		 397 aa  426  1e-118  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.712438  normal  0.9875 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1079  aminotransferase class V  62.86 
 
 		 419 aa  428  1e-118  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1875  aminotransferase, class V  60.05 
 
 		 397 aa  428  1e-118  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1921  aminotransferase, class V  60.05 
 
 		 397 aa  428  1e-118  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.173921  normal  0.388642 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13041  cysteine desulfurase iscS  60.58 
 
 		 393 aa  422  1e-117  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315275  hitchhiker  0.00290952 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0595  putative pyridoxal-phosphate-dependent aminotransferase  58.56 
 
 		 390 aa  418  1e-116  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1307  aminotransferase class V  63.14 
 
 		 408 aa  417  9.999999999999999e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.455149  normal  0.257454 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1106  aminotransferase class V  62.27 
 
 		 391 aa  408  1.0000000000000001e-112  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00753492 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1213  aminotransferase, class V  61.76 
 
 		 424 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.885701  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3781  aminotransferase class V  55.64 
 
 		 391 aa  397  1e-109  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.559401  normal  0.819909 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2910  Cysteine desulfurase  57.84 
 
 		 401 aa  394  1e-108  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3255  aminotransferase class V  56.67 
 
 		 413 aa  387  1e-106  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14810  cysteine desulfurase family protein  56.07 
 
 		 400 aa  366  1e-100  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.213876  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1361  aminotransferase class V  56.23 
 
 		 407 aa  335  7.999999999999999e-91  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.247137 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  46.61 
 
 		 400 aa  333  3e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  43.49 
 
 		 384 aa  332  8e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  43.6 
 
 		 384 aa  327  3e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  43.75 
 
 		 394 aa  324  2e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  46.21 
 
 		 396 aa  323  5e-87  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  42.71 
 
 		 392 aa  321  1.9999999999999998e-86  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  47.01 
 
 		 399 aa  319  6e-86  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  45.31 
 
 		 379 aa  316  5e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  43.9 
 
 		 392 aa  316  6e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  42.97 
 
 		 394 aa  315  9e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  44.16 
 
 		 402 aa  314  9.999999999999999e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  42.97 
 
 		 398 aa  314  1.9999999999999998e-84  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  44.16 
 
 		 392 aa  311  2e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  44.56 
 
 		 388 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  43.77 
 
 		 409 aa  303  5.000000000000001e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  42.89 
 
 		 396 aa  302  9e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  41.56 
 
 		 398 aa  301  2e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  41.56 
 
 		 398 aa  301  2e-80  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  43.52 
 
 		 398 aa  301  2e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  42.24 
 
 		 396 aa  300  4e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  38.8 
 
 		 382 aa  299  6e-80  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  44.33 
 
 		 394 aa  297  2e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2431  aminotransferase, class V  46.88 
 
 		 390 aa  298  2e-79  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  41.45 
 
 		 414 aa  298  2e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  41.93 
 
 		 398 aa  296  3e-79  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  41.96 
 
 		 394 aa  294  2e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  40.62 
 
 		 398 aa  294  2e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2175  aminotransferase class V  41.84 
 
 		 398 aa  290  2e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.670004  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2363  aminotransferase, class V  42.09 
 
 		 398 aa  290  2e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.197402  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4262  aminotransferase class V  45.73 
 
 		 395 aa  289  6e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0235  IscS protein  41.84 
 
 		 398 aa  287  2e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0341  cysteine desulfurase  39.69 
 
 		 388 aa  287  2.9999999999999996e-76  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  42.04 
 
 		 382 aa  286  4e-76  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2002  aminotransferase class V  41.43 
 
 		 401 aa  286  5e-76  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.557544 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2232  aminotransferase class V  41.54 
 
 		 401 aa  286  5e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  40.41 
 
 		 393 aa  286  5e-76  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  39.22 
 
 		 404 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2294  aminotransferase class V  46.34 
 
 		 385 aa  282  8.000000000000001e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000279611 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3560  aminotransferase class V  46.37 
 
 		 377 aa  281  1e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0251631  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1939  aminotransferase class V  42.04 
 
 		 388 aa  280  2e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024706 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0953  Cysteine desulfurase  45.43 
 
 		 380 aa  281  2e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2498  aminotransferase class V  42.16 
 
 		 381 aa  278  1e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0365  aminotransferase class V  41.07 
 
 		 401 aa  278  1e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0437125  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0100  cysteine desulfurase NifS  42.56 
 
 		 400 aa  278  1e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  39.58 
 
 		 384 aa  276  6e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1068  aminotransferase, class V  45.12 
 
 		 393 aa  273  3e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0344653  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1356  cysteine desulfurase NifS  41.78 
 
 		 402 aa  273  6e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  40.26 
 
 		 396 aa  271  1e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  40.1 
 
 		 407 aa  271  2e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0206  IscS protein  39.9 
 
 		 397 aa  271  2e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.264012  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  40.52 
 
 		 404 aa  271  2e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2557  aminotransferase, class V  45.92 
 
 		 381 aa  270  2.9999999999999997e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.102305  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1932  cysteine desulfurase NifS  39.06 
 
 		 393 aa  270  4e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  39.9 
 
 		 389 aa  269  7e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01630  Nitrogen fixation cysteine desulfurase, nifS  40 
 
 		 402 aa  268  1e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1551  aminotransferase class V  41.44 
 
 		 383 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2630  aminotransferase class V  44.47 
 
 		 1143 aa  266  4e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1507  cysteine desulfurase  39.9 
 
 		 402 aa  266  4e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0108  aminotransferase class V  42.23 
 
 		 400 aa  266  4e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.702313 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0907  aminotransferase, class V  46.67 
 
 		 383 aa  266  5e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000245321  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2296  aminotransferase, class V  41.29 
 
 		 394 aa  266  5e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3109  aminotransferase class V  40.62 
 
 		 381 aa  266  7e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00030249  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  39.44 
 
 		 403 aa  266  7e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1515  aminotransferase, class V:aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  39.53 
 
 		 404 aa  265  1e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.894831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1583  aminotransferase class V  44.3 
 
 		 1139 aa  264  2e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0719  aminotransferase, class V  41.04 
 
 		 381 aa  264  3e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000547846  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>