More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13041 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_13041  cysteine desulfurase iscS  100 
 
 
393 aa  780    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315275  hitchhiker  0.00290952 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4255  aminotransferase, class V  77.58 
 
 
422 aa  596  1e-169  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1875  aminotransferase, class V  78.97 
 
 
397 aa  574  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1921  aminotransferase, class V  78.97 
 
 
397 aa  574  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.173921  normal  0.388642 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1855  aminotransferase, class V  78.72 
 
 
397 aa  573  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.712438  normal  0.9875 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2105  aminotransferase, class V  73.71 
 
 
397 aa  544  1e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2360  Cysteine desulfurase  63.14 
 
 
387 aa  480  1e-134  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.66071 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08620  cysteine desulfurase family protein  62.12 
 
 
398 aa  461  1e-129  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.702147  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4089  Cysteine desulfurase  63.32 
 
 
401 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2844  aminotransferase class V  60.05 
 
 
384 aa  440  9.999999999999999e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1302  aminotransferase class V  62.27 
 
 
390 aa  439  9.999999999999999e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10430  cysteine desulfurase family protein  57.93 
 
 
412 aa  440  9.999999999999999e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.182592  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2729  aminotransferase, class V  60.41 
 
 
408 aa  436  1e-121  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.560546  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8110  Cysteine desulfurase  60.31 
 
 
387 aa  434  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6046  aminotransferase class V  61.76 
 
 
391 aa  434  1e-120  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3569  aminotransferase class V  58.72 
 
 
388 aa  434  1e-120  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00955537  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0688  aminotransferase, class V  60.31 
 
 
418 aa  432  1e-120  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.446364  normal  0.630962 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3255  aminotransferase class V  60.81 
 
 
413 aa  424  1e-117  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3446  aminotransferase, class V  58.66 
 
 
399 aa  420  1e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.311876  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2457  aminotransferase class V  58.72 
 
 
407 aa  418  9.999999999999999e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000191049 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1443  Cysteine desulfurase  58.29 
 
 
400 aa  418  9.999999999999999e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.751675  normal  0.957597 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2910  Cysteine desulfurase  61.48 
 
 
401 aa  410  1e-113  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1106  aminotransferase class V  63.12 
 
 
391 aa  410  1e-113  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00753492 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1105  Cysteine desulfurase  59.13 
 
 
401 aa  408  1.0000000000000001e-112  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.224155  hitchhiker  0.00251554 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1213  aminotransferase, class V  62.95 
 
 
424 aa  401  1e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.885701  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3781  aminotransferase class V  57.26 
 
 
391 aa  400  9.999999999999999e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.559401  normal  0.819909 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1079  aminotransferase class V  58.55 
 
 
419 aa  396  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1722  aminotransferase class V  53.42 
 
 
412 aa  397  1e-109  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.185065  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3650  aminotransferase, class V  56.42 
 
 
416 aa  392  1e-108  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2409  aminotransferase class V  55.3 
 
 
400 aa  390  1e-107  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0595  putative pyridoxal-phosphate-dependent aminotransferase  55.95 
 
 
390 aa  390  1e-107  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1307  aminotransferase class V  57.92 
 
 
408 aa  384  1e-105  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.455149  normal  0.257454 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  48.04 
 
 
394 aa  356  5e-97  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  45.85 
 
 
394 aa  347  3e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  45.81 
 
 
392 aa  344  1e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  43.57 
 
 
392 aa  328  8e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  45.45 
 
 
396 aa  328  8e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  46.5 
 
 
409 aa  327  3e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  46.46 
 
 
398 aa  325  7e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  46.86 
 
 
392 aa  324  1e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  44.36 
 
 
384 aa  322  9.000000000000001e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  45.95 
 
 
399 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  44.62 
 
 
384 aa  321  1.9999999999999998e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14810  cysteine desulfurase family protein  51.04 
 
 
400 aa  319  5e-86  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.213876  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  43.86 
 
 
398 aa  319  6e-86  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  43.49 
 
 
404 aa  317  2e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1939  aminotransferase class V  45.5 
 
 
388 aa  315  9e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00024706 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  44.91 
 
 
396 aa  313  4.999999999999999e-84  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  43.72 
 
 
400 aa  313  4.999999999999999e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  44.53 
 
 
394 aa  311  1e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  44.76 
 
 
388 aa  311  1e-83  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  44.88 
 
 
398 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  43.98 
 
 
402 aa  309  4e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  44.36 
 
 
389 aa  308  9e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  43.19 
 
 
394 aa  305  7e-82  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  44.62 
 
 
382 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  42.97 
 
 
398 aa  304  2.0000000000000002e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  42.97 
 
 
398 aa  304  2.0000000000000002e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  42.09 
 
 
414 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  42.78 
 
 
396 aa  301  9e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4262  aminotransferase class V  47.09 
 
 
395 aa  301  1e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  44.13 
 
 
379 aa  301  2e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2431  aminotransferase, class V  46.19 
 
 
390 aa  300  3e-80  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  38.34 
 
 
382 aa  299  7e-80  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3560  aminotransferase class V  47.64 
 
 
377 aa  296  4e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0251631  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  40.41 
 
 
398 aa  295  1e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1932  cysteine desulfurase NifS  41.21 
 
 
393 aa  294  2e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1361  aminotransferase class V  50.4 
 
 
407 aa  291  1e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.247137 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  41.65 
 
 
396 aa  290  2e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  42.31 
 
 
404 aa  290  3e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0341  cysteine desulfurase  40.31 
 
 
388 aa  289  7e-77  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2296  aminotransferase, class V  43.57 
 
 
394 aa  287  2e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  41.25 
 
 
393 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2363  aminotransferase, class V  40.21 
 
 
398 aa  285  8e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.197402  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  42.41 
 
 
384 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  40.94 
 
 
407 aa  283  5.000000000000001e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2362  cysteine desulfurase NifS  41.99 
 
 
399 aa  281  2e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1356  cysteine desulfurase NifS  41.21 
 
 
402 aa  278  1e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  41.47 
 
 
400 aa  277  2e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2232  aminotransferase class V  39.33 
 
 
401 aa  278  2e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2275  aminotransferase, class V  40.84 
 
 
386 aa  278  2e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1833  aminotransferase, class V  40.42 
 
 
389 aa  276  5e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0175075  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1558  cysteine desulfurase NifS  41.62 
 
 
400 aa  276  5e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0572612  normal  0.890663 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1515  aminotransferase, class V:aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  39.69 
 
 
404 aa  275  7e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.894831  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2683  aminotransferase, class V  40.68 
 
 
393 aa  274  2.0000000000000002e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0397114 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2498  aminotransferase class V  41.67 
 
 
381 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0235  IscS protein  39.43 
 
 
398 aa  272  7e-72  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1068  aminotransferase, class V  44.82 
 
 
393 aa  271  1e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0344653  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1507  cysteine desulfurase  40.62 
 
 
402 aa  271  2e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3063  aminotransferase, class V  41.99 
 
 
383 aa  270  2e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0588987  unclonable  0.000000817205 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  40.99 
 
 
403 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0100  cysteine desulfurase NifS  40.94 
 
 
400 aa  270  2.9999999999999997e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_70  aminotransferase, class V  41.41 
 
 
383 aa  269  5e-71  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2175  aminotransferase class V  38.92 
 
 
398 aa  268  1e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.670004  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2002  aminotransferase class V  37.89 
 
 
401 aa  268  1e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.557544 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0206  IscS protein  38.24 
 
 
397 aa  268  1e-70  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.264012  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0953  Cysteine desulfurase  42.2 
 
 
380 aa  267  2e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01630  Nitrogen fixation cysteine desulfurase, nifS  40.21 
 
 
402 aa  267  2e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0437  cysteine desulfurase NifS  38.64 
 
 
386 aa  267  2.9999999999999995e-70  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.361233 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1225  cysteine desulfurase NifS  40.31 
 
 
397 aa  266  4e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000944956 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>