More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2409 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_2409  aminotransferase class V  100 
 
 		 400 aa  771    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10430  cysteine desulfurase family protein  70 
 
 		 412 aa  520  1e-146  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.182592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1722  aminotransferase class V  62.88 
 
 		 412 aa  469  1.0000000000000001e-131  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.185065  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1105  Cysteine desulfurase  67.95 
 
 		 401 aa  462  1e-129  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.224155  hitchhiker  0.00251554 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2729  aminotransferase, class V  63.68 
 
 		 408 aa  461  9.999999999999999e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.560546  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2457  aminotransferase class V  63.78 
 
 		 407 aa  450  1e-125  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000191049 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8110  Cysteine desulfurase  62.31 
 
 		 387 aa  443  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3446  aminotransferase, class V  61.5 
 
 		 399 aa  442  1e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.311876  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1302  aminotransferase class V  62.21 
 
 		 390 aa  433  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0688  aminotransferase, class V  62.37 
 
 		 418 aa  430  1e-119  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.446364  normal  0.630962 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3569  aminotransferase class V  60.51 
 
 		 388 aa  420  1e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00955537  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2360  Cysteine desulfurase  59.64 
 
 		 387 aa  420  1e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.66071 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1443  Cysteine desulfurase  59.27 
 
 		 400 aa  417  9.999999999999999e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.751675  normal  0.957597 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2844  aminotransferase class V  59.74 
 
 		 384 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4089  Cysteine desulfurase  61.2 
 
 		 401 aa  409  1e-113  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08620  cysteine desulfurase family protein  58.99 
 
 		 398 aa  411  1e-113  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.702147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4255  aminotransferase, class V  57.72 
 
 		 422 aa  410  1e-113  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1079  aminotransferase class V  61.48 
 
 		 419 aa  402  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0595  putative pyridoxal-phosphate-dependent aminotransferase  59.68 
 
 		 390 aa  402  1e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3781  aminotransferase class V  58.84 
 
 		 391 aa  399  9.999999999999999e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.559401  normal  0.819909 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1213  aminotransferase, class V  64.63 
 
 		 424 aa  395  1e-109  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.885701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6046  aminotransferase class V  59.18 
 
 		 391 aa  391  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1106  aminotransferase class V  64.52 
 
 		 391 aa  392  1e-108  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00753492 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3650  aminotransferase, class V  57.39 
 
 		 416 aa  393  1e-108  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1307  aminotransferase class V  60.15 
 
 		 408 aa  375  1e-103  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.455149  normal  0.257454 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13041  cysteine desulfurase iscS  55.67 
 
 		 393 aa  377  1e-103  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315275  hitchhiker  0.00290952 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1875  aminotransferase, class V  55.98 
 
 		 397 aa  374  1e-102  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1921  aminotransferase, class V  55.98 
 
 		 397 aa  374  1e-102  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.173921  normal  0.388642 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2105  aminotransferase, class V  55.08 
 
 		 397 aa  374  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1855  aminotransferase, class V  55.98 
 
 		 397 aa  374  1e-102  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.712438  normal  0.9875 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2910  Cysteine desulfurase  55.98 
 
 		 401 aa  360  3e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3255  aminotransferase class V  53.28 
 
 		 413 aa  360  3e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14810  cysteine desulfurase family protein  55.24 
 
 		 400 aa  342  9e-93  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.213876  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1361  aminotransferase class V  56.74 
 
 		 407 aa  315  7e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.247137 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  47.18 
 
 		 399 aa  309  5.9999999999999995e-83  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  44.01 
 
 		 394 aa  307  2.0000000000000002e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  43.3 
 
 		 394 aa  306  5.0000000000000004e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1939  aminotransferase class V  45.74 
 
 		 388 aa  301  1e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024706 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  44.5 
 
 		 388 aa  300  3e-80  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  40.6 
 
 		 392 aa  298  1e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  41.6 
 
 		 384 aa  298  1e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  43.67 
 
 		 398 aa  294  2e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  41.65 
 
 		 392 aa  294  2e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  41.6 
 
 		 384 aa  294  2e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  41.34 
 
 		 398 aa  294  2e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  41.34 
 
 		 398 aa  294  2e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  41.34 
 
 		 398 aa  292  7e-78  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  45.83 
 
 		 404 aa  291  1e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  43.23 
 
 		 396 aa  291  1e-77  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  43.81 
 
 		 392 aa  290  2e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  43.93 
 
 		 402 aa  291  2e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  42.67 
 
 		 396 aa  290  4e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  42.13 
 
 		 394 aa  289  7e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  42.49 
 
 		 400 aa  288  1e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  40.89 
 
 		 404 aa  286  4e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  45.29 
 
 		 409 aa  284  2.0000000000000002e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  41.18 
 
 		 398 aa  283  4.0000000000000003e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  41.23 
 
 		 398 aa  281  2e-74  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0244  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  45.98 
 
 		 415 aa  280  3e-74  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  41.03 
 
 		 393 aa  279  6e-74  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  41.34 
 
 		 389 aa  278  1e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0341  cysteine desulfurase  38.97 
 
 		 388 aa  277  2e-73  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  42.71 
 
 		 382 aa  277  2e-73  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4262  aminotransferase class V  45.73 
 
 		 395 aa  276  3e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  37.4 
 
 		 382 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2296  aminotransferase, class V  45.85 
 
 		 394 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1932  cysteine desulfurase NifS  41.71 
 
 		 393 aa  273  5.000000000000001e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  41.71 
 
 		 407 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2294  aminotransferase class V  45.28 
 
 		 385 aa  270  4e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000279611 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  42.86 
 
 		 396 aa  268  8.999999999999999e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  42.34 
 
 		 379 aa  268  1e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  40.82 
 
 		 414 aa  268  1e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2232  aminotransferase class V  39.49 
 
 		 401 aa  267  2e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  40.41 
 
 		 396 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2431  aminotransferase, class V  44.36 
 
 		 390 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  40.36 
 
 		 384 aa  265  7e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1551  aminotransferase class V  41.94 
 
 		 383 aa  265  1e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0809  aminotransferase, class V  41.65 
 
 		 382 aa  265  2e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2557  aminotransferase, class V  47.24 
 
 		 381 aa  264  2e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.102305  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  40.83 
 
 		 403 aa  261  1e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2175  aminotransferase class V  39.59 
 
 		 398 aa  260  2e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.670004  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2002  aminotransferase class V  37.94 
 
 		 401 aa  261  2e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.557544 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1068  aminotransferase, class V  45.19 
 
 		 393 aa  260  2e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0344653  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0953  Cysteine desulfurase  42.67 
 
 		 380 aa  261  2e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2773  aminotransferase class V  48.54 
 
 		 388 aa  260  3e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.120783 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3560  aminotransferase class V  46.86 
 
 		 377 aa  259  7e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0251631  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  41.37 
 
 		 394 aa  258  9e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1949  aminotransferase, class V  42.05 
 
 		 385 aa  256  4e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000781244  normal  0.177382 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18960  cysteine desulfurase family protein  47.74 
 
 		 399 aa  254  1.0000000000000001e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.477328  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2630  aminotransferase class V  43.28 
 
 		 1143 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1833  aminotransferase, class V  40 
 
 		 389 aa  252  7e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0175075  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0100  cysteine desulfurase NifS  40.36 
 
 		 400 aa  251  1e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0624  aminotransferase, class V  42.31 
 
 		 385 aa  251  1e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292698 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2683  aminotransferase, class V  39.79 
 
 		 393 aa  251  1e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0397114 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2275  aminotransferase, class V  40.26 
 
 		 386 aa  251  2e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1104  aminotransferase class V  44.44 
 
 		 381 aa  250  3e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.141104  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3109  aminotransferase class V  38.24 
 
 		 381 aa  249  4e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00030249  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2362  cysteine desulfurase NifS  39.29 
 
 		 399 aa  249  4e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1048  aminotransferase, class V  43.93 
 
 		 381 aa  249  7e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1811  cysteine desulfurase NifS  38.78 
 
 		 401 aa  248  1e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>