More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2773 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_2773  aminotransferase class V  100 
 
 
388 aa  748    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.120783 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2557  aminotransferase, class V  58.79 
 
 
381 aa  395  1e-109  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.102305  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2294  aminotransferase class V  60.38 
 
 
385 aa  389  1e-107  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000279611 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3560  aminotransferase class V  61.38 
 
 
377 aa  383  1e-105  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0251631  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03780  cysteine desulfurase family protein  57.34 
 
 
380 aa  351  1e-95  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  49.49 
 
 
409 aa  345  6e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  45.95 
 
 
389 aa  342  5.999999999999999e-93  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  45.41 
 
 
394 aa  340  2.9999999999999998e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4262  aminotransferase class V  50.13 
 
 
395 aa  337  1.9999999999999998e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  45.12 
 
 
382 aa  335  1e-90  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  43.49 
 
 
394 aa  330  2e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  43.75 
 
 
398 aa  330  3e-89  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  43.41 
 
 
398 aa  329  5.0000000000000004e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1833  aminotransferase, class V  45.95 
 
 
389 aa  328  9e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0175075  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  47.54 
 
 
388 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  43.83 
 
 
384 aa  327  3e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  42.08 
 
 
404 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  45.19 
 
 
399 aa  325  7e-88  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  43.42 
 
 
393 aa  324  2e-87  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1939  aminotransferase class V  48.43 
 
 
388 aa  323  2e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00024706 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  44.21 
 
 
384 aa  323  4e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  43.23 
 
 
394 aa  322  7e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  45.95 
 
 
398 aa  322  7e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  45.31 
 
 
396 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  44.09 
 
 
398 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  42.52 
 
 
392 aa  321  1.9999999999999998e-86  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  44.09 
 
 
402 aa  319  6e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  44.36 
 
 
392 aa  318  1e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  44.21 
 
 
396 aa  317  2e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2647  cysteine desulfurase NifS  45.43 
 
 
389 aa  315  8e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00311085 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1569  cysteine desulfurase NifS  45.43 
 
 
389 aa  315  9e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00349258  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  42.64 
 
 
414 aa  314  9.999999999999999e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  37.76 
 
 
382 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  45.79 
 
 
379 aa  312  7.999999999999999e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  44.79 
 
 
404 aa  308  9e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_002936  DET0248  cysteine desulfurase  44.62 
 
 
383 aa  307  2.0000000000000002e-82  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0166722  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_70  aminotransferase, class V  44.76 
 
 
383 aa  307  2.0000000000000002e-82  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  44.53 
 
 
392 aa  306  3e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  43.75 
 
 
403 aa  306  4.0000000000000004e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  42.67 
 
 
400 aa  305  9.000000000000001e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4134  aminotransferase, class V  44.29 
 
 
400 aa  305  9.000000000000001e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0486971  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2296  aminotransferase, class V  45.57 
 
 
394 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1811  cysteine desulfurase NifS  43.42 
 
 
401 aa  303  3.0000000000000004e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1783  cysteine desulfurase NifS  43.42 
 
 
401 aa  303  3.0000000000000004e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0992  cysteine desulfurase  42.86 
 
 
391 aa  302  5.000000000000001e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00026474  normal  0.256714 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0100  cysteine desulfurase NifS  44.59 
 
 
400 aa  303  5.000000000000001e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2011  cysteine desulfurase  43.38 
 
 
391 aa  301  1e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.079673  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  42.63 
 
 
407 aa  301  1e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  43.68 
 
 
384 aa  301  1e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2498  aminotransferase class V  43.04 
 
 
381 aa  296  3e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2015  aminotransferase, class V  43.86 
 
 
391 aa  296  3e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0118596  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4292  aminotransferase, class V  42.3 
 
 
381 aa  296  6e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000991667  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  42.3 
 
 
400 aa  296  6e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4626  aminotransferase, class V  42.3 
 
 
381 aa  296  6e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.058165  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1872  aminotransferase, class V  42.24 
 
 
400 aa  296  6e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.175027  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2683  aminotransferase, class V  44.03 
 
 
393 aa  295  7e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0397114 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2122  cysteine desulfurase NifS  44.54 
 
 
401 aa  295  8e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31758 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4477  aminotransferase, class V  42.3 
 
 
381 aa  295  8e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.508200000000001e-19 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4480  aminotransferase, class V  42.3 
 
 
381 aa  295  9e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.921351  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4129  aminotransferase, class V  42.3 
 
 
381 aa  295  1e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00019108  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4244  aminotransferase class V  42.3 
 
 
381 aa  295  1e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00204023  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  43.31 
 
 
396 aa  295  1e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0688  cysteine desulfurase NifS  41.49 
 
 
388 aa  294  2e-78  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0297222  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1068  aminotransferase, class V  47.7 
 
 
393 aa  294  2e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0344653  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1932  cysteine desulfurase NifS  40.94 
 
 
393 aa  294  2e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  40.84 
 
 
398 aa  294  2e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  40.84 
 
 
398 aa  294  2e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  40.58 
 
 
396 aa  293  3e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4530  aminotransferase, class V  42.04 
 
 
381 aa  293  3e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000702151  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3109  aminotransferase class V  42.56 
 
 
381 aa  293  3e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00030249  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2630  aminotransferase class V  47.01 
 
 
1143 aa  291  1e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15700  cysteine desulfurase family protein  54.5 
 
 
390 aa  291  1e-77  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0624  aminotransferase, class V  43.52 
 
 
385 aa  291  1e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00292698 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1607  cysteine desulfurase NifS  43.08 
 
 
388 aa  291  1e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.76832  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  44.24 
 
 
394 aa  290  2e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4140  aminotransferase, class V  42.04 
 
 
381 aa  290  2e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000996508  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1583  aminotransferase class V  48.75 
 
 
1139 aa  290  2e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4856  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  43.41 
 
 
389 aa  289  7e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000224928 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0719  aminotransferase, class V  41.78 
 
 
381 aa  288  8e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000547846  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8110  Cysteine desulfurase  48.92 
 
 
387 aa  288  1e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1356  cysteine desulfurase NifS  40.36 
 
 
402 aa  288  1e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2844  aminotransferase class V  46.61 
 
 
384 aa  288  1e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4255  aminotransferase, class V  47.44 
 
 
422 aa  288  2e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0341  cysteine desulfurase  39.84 
 
 
388 aa  287  2e-76  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0595  putative pyridoxal-phosphate-dependent aminotransferase  48.42 
 
 
390 aa  287  2e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4245  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  42.48 
 
 
398 aa  287  2e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1568  cysteine desulfurase  44.33 
 
 
373 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1755  cysteine desulfurase  44.33 
 
 
373 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.983783  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0379  cysteine desulfurase  44.33 
 
 
373 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4517  aminotransferase, class V  41.51 
 
 
381 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0024603  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1225  cysteine desulfurase  44.33 
 
 
414 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.738138  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0422  cysteine desulfurase  44.33 
 
 
373 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2865  cysteine desulfurase  44.33 
 
 
373 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1344  aminotransferase class V  38.4 
 
 
406 aa  286  4e-76  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2179  cysteine desulfurase  39.32 
 
 
373 aa  286  4e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2362  cysteine desulfurase NifS  43.45 
 
 
399 aa  285  7e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0347  aminotransferase class V  60.27 
 
 
454 aa  284  2.0000000000000002e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5030  aminotransferase class V  43.85 
 
 
388 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0688  aminotransferase, class V  47.33 
 
 
418 aa  283  3.0000000000000004e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.446364  normal  0.630962 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3446  aminotransferase, class V  48.66 
 
 
399 aa  283  4.0000000000000003e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.311876  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>