More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1872 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_1872  aminotransferase, class V  100 
 
 		 400 aa  825    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.175027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2295  aminotransferase class V  70.26 
 
 		 394 aa  558  1e-158  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0121543 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4856  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  70.88 
 
 		 389 aa  555  1e-157  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000224928 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4043  aminotransferase class V  69.05 
 
 		 393 aa  545  1e-154  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4080  aminotransferase class V  69.05 
 
 		 393 aa  545  1e-154  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.575303  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4811  cysteine desulfurase  70.51 
 
 		 398 aa  545  1e-154  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5030  aminotransferase class V  68.05 
 
 		 388 aa  525  1e-148  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1929  cysteine desulfurase  56.88 
 
 		 386 aa  418  1e-116  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.685974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  47.56 
 
 		 388 aa  374  1e-102  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  46.75 
 
 		 403 aa  355  7.999999999999999e-97  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  44.7 
 
 		 392 aa  348  9e-95  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  44.94 
 
 		 394 aa  340  2e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  43.59 
 
 		 400 aa  339  4e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  44.73 
 
 		 392 aa  334  1e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  42.6 
 
 		 394 aa  334  2e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  43.96 
 
 		 382 aa  332  8e-90  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  45.08 
 
 		 394 aa  332  1e-89  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  43.85 
 
 		 414 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  44.19 
 
 		 398 aa  326  5e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  43.56 
 
 		 384 aa  323  2e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  43.56 
 
 		 384 aa  322  7e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  41.67 
 
 		 393 aa  319  3.9999999999999996e-86  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  43.18 
 
 		 409 aa  319  7e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  43.93 
 
 		 398 aa  318  1e-85  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_70  aminotransferase, class V  44.07 
 
 		 383 aa  317  2e-85  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  43.38 
 
 		 399 aa  315  9.999999999999999e-85  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2025  aminotransferase, class V  42.34 
 
 		 383 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  44.42 
 
 		 379 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  40.41 
 
 		 398 aa  313  3.9999999999999997e-84  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  40.41 
 
 		 398 aa  313  3.9999999999999997e-84  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2599  cysteine desulfurase  42.93 
 
 		 407 aa  311  1e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129174  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  44.53 
 
 		 392 aa  311  1e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2205  cysteine desulfurase IscS  42.89 
 
 		 403 aa  311  1e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00230458  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0248  cysteine desulfurase  43.75 
 
 		 383 aa  310  2e-83  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0166722  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  43.67 
 
 		 394 aa  310  2e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1458  cysteine desulfurase  42.38 
 
 		 407 aa  311  2e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2733  cysteine desulfurase  42.67 
 
 		 407 aa  310  2e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1489  cysteine desulfurase  42.67 
 
 		 407 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.71249  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1019  pyridoxal-phosphate-dependent aminotransferase (NIFS protein)  42.12 
 
 		 405 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.103423  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1708  cysteine desulfurase  42.67 
 
 		 407 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2655  cysteine desulfurase  42.67 
 
 		 407 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2217  cysteine desulfurase  42.67 
 
 		 407 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3103  cysteine desulfurase  42.67 
 
 		 407 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.412431  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02422  cysteine desulfurase  44.25 
 
 		 404 aa  310  4e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.657115  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1138  cysteine desulfurase IscS  44.25 
 
 		 404 aa  310  4e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3762  cysteine desulfurase  44.25 
 
 		 404 aa  310  4e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00149492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2681  cysteine desulfurase  44.25 
 
 		 404 aa  310  4e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.174524  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2683  cysteine desulfurase  44.25 
 
 		 404 aa  310  4e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.980146  normal  0.976252 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1147  cysteine desulfurase  44.25 
 
 		 404 aa  310  4e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0105086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2815  cysteine desulfurase  44.25 
 
 		 404 aa  310  4e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00976282  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2905  cysteine desulfurase  44.25 
 
 		 404 aa  310  4e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0404853  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02386  hypothetical protein  44.25 
 
 		 404 aa  310  4e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.730969  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4262  aminotransferase class V  43.43 
 
 		 395 aa  309  5e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2036  cysteine desulfurase  42.38 
 
 		 407 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.639443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  41.45 
 
 		 396 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2163  cysteine desulfurase  42.38 
 
 		 407 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.675105  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  41.39 
 
 		 402 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  41.67 
 
 		 404 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2579  cysteine desulfurase  42.12 
 
 		 407 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120053  hitchhiker  0.000683499 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1553  cysteine desulfurase  42.12 
 
 		 407 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0484493  normal  0.0430953 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  42.6 
 
 		 398 aa  307  2.0000000000000002e-82  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3031  cysteine desulfurase  44.5 
 
 		 404 aa  306  3e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.563846  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14730  cysteine desulfurase  43.19 
 
 		 404 aa  306  3e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.179473  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1104  cysteine desulfurase  43.99 
 
 		 404 aa  306  4.0000000000000004e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.013649  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1875  cysteine desulfurase  42.16 
 
 		 407 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.795233  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1144  cysteine desulfurase  42.12 
 
 		 407 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282524  normal  0.237339 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1058  cysteine desulfurase  41.86 
 
 		 405 aa  306  5.0000000000000004e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0834623  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1299  cysteine desulfurase  42.93 
 
 		 404 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0382772  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0949  cysteine desulfurase IscS  41.86 
 
 		 405 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0399375 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0884  cysteine desulfurase IscS  41.86 
 
 		 405 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.293282  normal  0.187166 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  40.52 
 
 		 382 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2805  cysteine desulfurase  43.73 
 
 		 404 aa  303  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2742  cysteine desulfurase  43.73 
 
 		 404 aa  303  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.46384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2698  cysteine desulfurase  43.73 
 
 		 404 aa  303  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.016381  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2917  cysteine desulfurase  43.73 
 
 		 404 aa  303  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1244  cysteine desulfurase  44.25 
 
 		 404 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2751  cysteine desulfurase  43.99 
 
 		 404 aa  303  3.0000000000000004e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.173578  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  41.3 
 
 		 398 aa  303  3.0000000000000004e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2143  cysteine desulfurase  41.86 
 
 		 407 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.950908 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2290  cysteine desulfurase IscS  41.6 
 
 		 405 aa  303  4.0000000000000003e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00326388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5951  cysteine desulfurase  41.86 
 
 		 407 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.350283  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2126  cysteine desulfurase  41.86 
 
 		 407 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  42.34 
 
 		 396 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1025  cysteine desulfurase  41.86 
 
 		 406 aa  302  5.000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00998384  normal  0.30784 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3027  cysteine desulfurase  43.48 
 
 		 404 aa  302  5.000000000000001e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0576674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5432  cysteine desulfurase  41.86 
 
 		 407 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.116144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3627  cysteine desulfurase  43.73 
 
 		 404 aa  302  6.000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0168495  normal  0.888851 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1649  aminotransferase, class V  44.3 
 
 		 385 aa  302  7.000000000000001e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.251188  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2783  cysteine desulfurase  43.48 
 
 		 404 aa  302  8.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0158517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2558  cysteine desulfurase NifS  44.97 
 
 		 388 aa  301  1e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.947611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6331  cysteine desulfurase IscS  42.78 
 
 		 405 aa  301  2e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.134755  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0808  cysteine desulfurase IscS  41.75 
 
 		 405 aa  301  2e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000772731  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2142  cysteine desulfurase IscS  40.57 
 
 		 406 aa  300  3e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.456248  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1164  cysteine desulfurase IscS  41.69 
 
 		 402 aa  300  3e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000196201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  41.6 
 
 		 407 aa  300  3e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  41.54 
 
 		 396 aa  300  3e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4336  cysteine desulfurase  42.16 
 
 		 404 aa  300  3e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.180367  hitchhiker  0.00000000219205 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3109  aminotransferase class V  41.73 
 
 		 381 aa  300  3e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00030249  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02508  cysteine desulfurase, alanine biosynthesis, putative (Eurofung)  43.22 
 
 		 507 aa  300  4e-80  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2498  aminotransferase class V  42.46 
 
 		 381 aa  300  4e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>