More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1929 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1929  cysteine desulfurase  100 
 
 		 386 aa  759    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.685974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1872  aminotransferase, class V  56.88 
 
 		 400 aa  444  1.0000000000000001e-124  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.175027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4856  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  57.77 
 
 		 389 aa  429  1e-119  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000224928 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4043  aminotransferase class V  57.88 
 
 		 393 aa  425  1e-118  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4080  aminotransferase class V  57.88 
 
 		 393 aa  426  1e-118  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.575303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5030  aminotransferase class V  59.31 
 
 		 388 aa  418  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2295  aminotransferase class V  57.29 
 
 		 394 aa  421  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0121543 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4811  cysteine desulfurase  59.37 
 
 		 398 aa  413  1e-114  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  45.9 
 
 		 388 aa  323  3e-87  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  44.13 
 
 		 393 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  42.93 
 
 		 392 aa  315  6e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  42.6 
 
 		 399 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  44.66 
 
 		 392 aa  306  3e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1939  aminotransferase class V  47.67 
 
 		 388 aa  306  5.0000000000000004e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024706 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  41.93 
 
 		 384 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  42.78 
 
 		 382 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  46.7 
 
 		 403 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  42.7 
 
 		 394 aa  302  7.000000000000001e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  41.45 
 
 		 404 aa  300  2e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  43.66 
 
 		 394 aa  301  2e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  42.7 
 
 		 400 aa  299  6e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  43.87 
 
 		 398 aa  298  8e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  40.55 
 
 		 396 aa  298  1e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0341  cysteine desulfurase  39.27 
 
 		 388 aa  297  2e-79  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  40.79 
 
 		 384 aa  297  3e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  40.05 
 
 		 382 aa  295  8e-79  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1649  aminotransferase, class V  42.18 
 
 		 385 aa  295  9e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.251188  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0248  cysteine desulfurase  44.09 
 
 		 383 aa  294  2e-78  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0166722  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1551  aminotransferase class V  43.9 
 
 		 383 aa  291  2e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_70  aminotransferase, class V  43.28 
 
 		 383 aa  290  2e-77  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2558  cysteine desulfurase NifS  45.73 
 
 		 388 aa  291  2e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.947611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1068  aminotransferase, class V  46.05 
 
 		 393 aa  291  2e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0344653  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  42.89 
 
 		 398 aa  290  2e-77  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  41.19 
 
 		 398 aa  290  3e-77  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1353  aminotransferase, class V  45.57 
 
 		 389 aa  288  1e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  43.24 
 
 		 404 aa  287  2e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  42.86 
 
 		 396 aa  287  2.9999999999999996e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  43.41 
 
 		 414 aa  284  1.0000000000000001e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  41.95 
 
 		 394 aa  283  3.0000000000000004e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2025  aminotransferase, class V  38.06 
 
 		 383 aa  283  5.000000000000001e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  40.36 
 
 		 398 aa  282  6.000000000000001e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  42.01 
 
 		 379 aa  282  8.000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01630  Nitrogen fixation cysteine desulfurase, nifS  42.47 
 
 		 402 aa  281  1e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  43.2 
 
 		 409 aa  281  2e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  42.08 
 
 		 407 aa  281  2e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  41.48 
 
 		 402 aa  281  2e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2683  aminotransferase, class V  40.47 
 
 		 393 aa  279  6e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0397114 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3109  aminotransferase class V  40.81 
 
 		 381 aa  279  7e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00030249  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0437  cysteine desulfurase NifS  40 
 
 		 386 aa  278  8e-74  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.361233 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  39.02 
 
 		 398 aa  278  8e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  39.02 
 
 		 398 aa  278  8e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1568  cysteine desulfurase  44.26 
 
 		 373 aa  278  1e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0379  cysteine desulfurase  44.26 
 
 		 373 aa  278  1e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0422  cysteine desulfurase  44.26 
 
 		 373 aa  278  1e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  42.31 
 
 		 396 aa  278  1e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  42.58 
 
 		 384 aa  278  1e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1755  cysteine desulfurase  44.26 
 
 		 373 aa  278  1e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.983783  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2412  cysteine desulfurase IscS  40.84 
 
 		 403 aa  277  2e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2296  aminotransferase, class V  44.23 
 
 		 394 aa  277  2e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2865  cysteine desulfurase  43.55 
 
 		 373 aa  276  3e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  42.19 
 
 		 396 aa  277  3e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1225  cysteine desulfurase  43.55 
 
 		 414 aa  276  5e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.738138  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4665  cysteine desulfurase IscS  40.84 
 
 		 436 aa  276  5e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4044  aminotransferase, class V  40.99 
 
 		 389 aa  276  5e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.159236 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3698  cysteine desulfurase IscS  40.84 
 
 		 436 aa  276  5e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.789582  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0595  putative pyridoxal-phosphate-dependent aminotransferase  45.36 
 
 		 390 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2498  aminotransferase class V  38.42 
 
 		 381 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3823  cysteine desulfurase IscS  40.58 
 
 		 403 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.474065 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2015  aminotransferase, class V  41.95 
 
 		 391 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0118596  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0624  aminotransferase, class V  43.41 
 
 		 385 aa  273  4.0000000000000004e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292698 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2290  cysteine desulfurase IscS  40.05 
 
 		 405 aa  273  5.000000000000001e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00326388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4262  aminotransferase class V  43.48 
 
 		 395 aa  273  5.000000000000001e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0720  Cysteine desulfurase  39.47 
 
 		 381 aa  273  5.000000000000001e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1833  aminotransferase, class V  41.32 
 
 		 389 aa  272  7e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0175075  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  41.53 
 
 		 389 aa  272  8.000000000000001e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1515  aminotransferase, class V:aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  41.6 
 
 		 404 aa  271  2e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.894831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1950  cysteine desulfurase IscS  40.47 
 
 		 405 aa  271  2e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000000843977  normal  0.404205 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6331  cysteine desulfurase IscS  40.21 
 
 		 405 aa  270  2e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.134755  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0437  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  41.97 
 
 		 388 aa  270  2.9999999999999997e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00696357  normal  0.223385 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2431  aminotransferase, class V  40.82 
 
 		 390 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1489  cysteine desulfurase  39.53 
 
 		 407 aa  270  4e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.71249  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1708  cysteine desulfurase  39.53 
 
 		 407 aa  270  4e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3103  cysteine desulfurase  39.53 
 
 		 407 aa  270  4e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.412431  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2217  cysteine desulfurase  39.53 
 
 		 407 aa  270  4e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1063  aminotransferase class V  39.9 
 
 		 388 aa  270  4e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2773  aminotransferase class V  45.88 
 
 		 388 aa  269  5e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.120783 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2733  cysteine desulfurase  39.79 
 
 		 407 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1932  cysteine desulfurase NifS  41.1 
 
 		 393 aa  269  8e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1058  cysteine desulfurase  40.05 
 
 		 405 aa  268  8.999999999999999e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0834623  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2655  cysteine desulfurase  39.53 
 
 		 407 aa  268  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4244  aminotransferase class V  37.89 
 
 		 381 aa  268  1e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00204023  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0100  cysteine desulfurase NifS  40.61 
 
 		 400 aa  268  1e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1583  aminotransferase class V  42.78 
 
 		 1139 aa  268  1e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1592  Cysteine desulfurase  45.26 
 
 		 378 aa  268  1e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0178166 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3569  aminotransferase class V  44.97 
 
 		 388 aa  268  1e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00955537  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4277  cysteine desulfurase  38.77 
 
 		 380 aa  268  1e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000827813  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2579  cysteine desulfurase  39.01 
 
 		 407 aa  267  2e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120053  hitchhiker  0.000683499 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1356  cysteine desulfurase NifS  40.77 
 
 		 402 aa  268  2e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2599  cysteine desulfurase  39.53 
 
 		 407 aa  268  2e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129174  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0884  cysteine desulfurase IscS  39.79 
 
 		 405 aa  267  2e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.293282  normal  0.187166 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>