More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1353 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1353  aminotransferase, class V  100 
 
 		 389 aa  752    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  48.43 
 
 		 384 aa  375  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  45.57 
 
 		 392 aa  369  1e-101  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  47.37 
 
 		 384 aa  364  1e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  47.79 
 
 		 396 aa  359  4e-98  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  49.61 
 
 		 404 aa  356  2.9999999999999997e-97  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  47.4 
 
 		 394 aa  354  2e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  49.34 
 
 		 382 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  48.95 
 
 		 388 aa  352  5e-96  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  46.75 
 
 		 394 aa  350  2e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  47.78 
 
 		 400 aa  350  3e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  43.42 
 
 		 382 aa  347  2e-94  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0248  cysteine desulfurase  49.61 
 
 		 383 aa  346  3e-94  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0166722  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  48.68 
 
 		 403 aa  346  4e-94  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  47.77 
 
 		 392 aa  346  5e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0341  cysteine desulfurase  43.57 
 
 		 388 aa  344  1e-93  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  45.26 
 
 		 398 aa  343  2.9999999999999997e-93  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_70  aminotransferase, class V  48.82 
 
 		 383 aa  342  7e-93  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  47.92 
 
 		 398 aa  342  9e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1649  aminotransferase, class V  46.15 
 
 		 385 aa  337  1.9999999999999998e-91  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.251188  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  48.33 
 
 		 409 aa  337  1.9999999999999998e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  45.05 
 
 		 398 aa  337  1.9999999999999998e-91  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  46.79 
 
 		 398 aa  336  2.9999999999999997e-91  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3627  cysteine desulfurase  46.25 
 
 		 404 aa  335  5.999999999999999e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0168495  normal  0.888851 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  43.26 
 
 		 404 aa  335  7.999999999999999e-91  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3031  cysteine desulfurase  45.99 
 
 		 404 aa  333  3e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.563846  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  44.88 
 
 		 407 aa  333  3e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0717  cysteine desulfurase  44.44 
 
 		 406 aa  333  4e-90  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  49.07 
 
 		 394 aa  332  6e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  44.76 
 
 		 384 aa  332  7.000000000000001e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  47.12 
 
 		 396 aa  331  1e-89  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4665  cysteine desulfurase IscS  47.56 
 
 		 436 aa  331  2e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  48.03 
 
 		 399 aa  330  2e-89  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3698  cysteine desulfurase IscS  47.56 
 
 		 436 aa  331  2e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.789582  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4262  aminotransferase class V  48.98 
 
 		 395 aa  329  4e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2412  cysteine desulfurase IscS  48.17 
 
 		 403 aa  329  4e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1932  cysteine desulfurase NifS  45.05 
 
 		 393 aa  329  6e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0830  cysteine desulfurase IscS  46.8 
 
 		 407 aa  328  7e-89  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.184128 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3823  cysteine desulfurase IscS  48.43 
 
 		 403 aa  328  7e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.474065 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1104  cysteine desulfurase  45.48 
 
 		 404 aa  328  8e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.013649  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3027  cysteine desulfurase  44.96 
 
 		 404 aa  328  1.0000000000000001e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0576674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2742  cysteine desulfurase  44.96 
 
 		 404 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.46384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2917  cysteine desulfurase  44.96 
 
 		 404 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2805  cysteine desulfurase  44.96 
 
 		 404 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2698  cysteine desulfurase  44.96 
 
 		 404 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.016381  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2579  cysteine desulfurase  45.03 
 
 		 407 aa  327  3e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120053  hitchhiker  0.000683499 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2783  cysteine desulfurase  44.96 
 
 		 404 aa  326  3e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0158517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  45.43 
 
 		 396 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  45.05 
 
 		 396 aa  326  4.0000000000000003e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0949  cysteine desulfurase IscS  43.96 
 
 		 405 aa  326  5e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0399375 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0884  cysteine desulfurase IscS  43.96 
 
 		 405 aa  326  5e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.293282  normal  0.187166 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  48.94 
 
 		 379 aa  326  5e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2178  cysteine desulfurase IscS  44.73 
 
 		 405 aa  325  8.000000000000001e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000963732  normal  0.389244 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1458  cysteine desulfurase  45.03 
 
 		 407 aa  325  1e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2290  cysteine desulfurase IscS  45.03 
 
 		 405 aa  325  1e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00326388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  45.41 
 
 		 402 aa  325  1e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4856  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  46.72 
 
 		 389 aa  324  1e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000224928 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2751  cysteine desulfurase  45.22 
 
 		 404 aa  325  1e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.173578  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1638  cysteine desulfurase IscS  45.81 
 
 		 406 aa  325  1e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1360  cysteine desulfurase IscS  47.12 
 
 		 408 aa  324  2e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1058  cysteine desulfurase  44.47 
 
 		 405 aa  324  2e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0834623  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5432  cysteine desulfurase  45.03 
 
 		 407 aa  323  2e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.116144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1875  cysteine desulfurase  45.81 
 
 		 407 aa  324  2e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.795233  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1244  cysteine desulfurase  45.22 
 
 		 404 aa  324  2e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1553  cysteine desulfurase  45.29 
 
 		 407 aa  324  2e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0484493  normal  0.0430953 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02422  cysteine desulfurase  44.96 
 
 		 404 aa  323  3e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.657115  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1138  cysteine desulfurase IscS  44.96 
 
 		 404 aa  323  3e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2815  cysteine desulfurase  44.96 
 
 		 404 aa  323  3e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00976282  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02386  hypothetical protein  44.96 
 
 		 404 aa  323  3e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.730969  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2681  cysteine desulfurase  44.96 
 
 		 404 aa  323  3e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.174524  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1147  cysteine desulfurase  44.96 
 
 		 404 aa  323  3e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0105086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3762  cysteine desulfurase  44.96 
 
 		 404 aa  323  3e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00149492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2905  cysteine desulfurase  44.96 
 
 		 404 aa  323  3e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0404853  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  49.22 
 
 		 392 aa  323  3e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2683  cysteine desulfurase  44.96 
 
 		 404 aa  323  3e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.980146  normal  0.976252 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02508  cysteine desulfurase, alanine biosynthesis, putative (Eurofung)  45.05 
 
 		 507 aa  323  4e-87  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2177  cysteine desulfurase IscS  45.29 
 
 		 430 aa  323  4e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00159504  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  45.57 
 
 		 414 aa  322  5e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2144  cysteine desulfurase IscS  45.55 
 
 		 406 aa  322  6e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124025 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1708  cysteine desulfurase  45.29 
 
 		 407 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1489  cysteine desulfurase  45.29 
 
 		 407 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.71249  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3103  cysteine desulfurase  45.29 
 
 		 407 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.412431  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1487  cysteine desulfurase IscS  46.53 
 
 		 406 aa  322  9.000000000000001e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.000124631  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2217  cysteine desulfurase  45.29 
 
 		 407 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1551  aminotransferase class V  46.32 
 
 		 383 aa  321  9.999999999999999e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2143  cysteine desulfurase  44.76 
 
 		 407 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.950908 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5951  cysteine desulfurase  44.76 
 
 		 407 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.350283  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  43.86 
 
 		 398 aa  321  9.999999999999999e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  43.86 
 
 		 398 aa  321  9.999999999999999e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2126  cysteine desulfurase  44.76 
 
 		 407 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1019  pyridoxal-phosphate-dependent aminotransferase (NIFS protein)  44.47 
 
 		 405 aa  321  1.9999999999999998e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.103423  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2655  cysteine desulfurase  45.29 
 
 		 407 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2036  cysteine desulfurase  44.5 
 
 		 407 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.639443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2163  cysteine desulfurase  44.5 
 
 		 407 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.675105  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2733  cysteine desulfurase  45.03 
 
 		 407 aa  320  3e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1025  cysteine desulfurase  45.55 
 
 		 406 aa  320  3e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00998384  normal  0.30784 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2373  cysteine desulfurase IscS  45.55 
 
 		 406 aa  319  3.9999999999999996e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.934758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  44.68 
 
 		 389 aa  320  3.9999999999999996e-86  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  41.62 
 
 		 393 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4044  aminotransferase, class V  44.39 
 
 		 389 aa  319  3.9999999999999996e-86  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.159236 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>