More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_4043 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_4080  aminotransferase class V  99.49 
 
 
393 aa  795    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.575303  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4043  aminotransferase class V  100 
 
 
393 aa  795    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2295  aminotransferase class V  69.31 
 
 
394 aa  558  1e-158  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0121543 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1872  aminotransferase, class V  69.05 
 
 
400 aa  545  1e-154  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.175027  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4856  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  69.69 
 
 
389 aa  537  1e-151  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000224928 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5030  aminotransferase class V  70.05 
 
 
388 aa  523  1e-147  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4811  cysteine desulfurase  66.75 
 
 
398 aa  500  1e-140  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1929  cysteine desulfurase  57.88 
 
 
386 aa  400  9.999999999999999e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.685974  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  45.34 
 
 
388 aa  340  2e-92  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  43.49 
 
 
392 aa  332  7.000000000000001e-90  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  45.85 
 
 
392 aa  329  5.0000000000000004e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  44.94 
 
 
384 aa  317  2e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  43.23 
 
 
394 aa  317  3e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  44.53 
 
 
384 aa  315  9e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  44.56 
 
 
382 aa  315  9.999999999999999e-85  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  43.38 
 
 
414 aa  314  9.999999999999999e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  44.68 
 
 
394 aa  310  2e-83  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  43.08 
 
 
393 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  45.57 
 
 
403 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  45.34 
 
 
398 aa  309  5e-83  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  41.6 
 
 
400 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  42.45 
 
 
394 aa  306  5.0000000000000004e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  44.27 
 
 
392 aa  305  9.000000000000001e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  42.45 
 
 
399 aa  300  3e-80  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  43.52 
 
 
398 aa  300  4e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  41.41 
 
 
382 aa  297  2e-79  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  42.75 
 
 
402 aa  297  3e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  40.89 
 
 
398 aa  293  4e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1344  aminotransferase class V  40.93 
 
 
406 aa  292  6e-78  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  41.78 
 
 
404 aa  290  2e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  42.45 
 
 
398 aa  290  2e-77  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  40.26 
 
 
398 aa  289  6e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  40.26 
 
 
398 aa  289  6e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_70  aminotransferase, class V  43.26 
 
 
383 aa  285  7e-76  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2025  aminotransferase, class V  39.33 
 
 
383 aa  285  9e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1932  cysteine desulfurase NifS  42.45 
 
 
393 aa  284  2.0000000000000002e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1649  aminotransferase, class V  42.71 
 
 
385 aa  283  4.0000000000000003e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.251188  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1939  aminotransferase class V  44.67 
 
 
388 aa  281  1e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00024706 
 
 
-
 
NC_002936  DET0248  cysteine desulfurase  43.15 
 
 
383 aa  281  2e-74  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0166722  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0949  cysteine desulfurase IscS  41.19 
 
 
405 aa  279  5e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0399375 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0884  cysteine desulfurase IscS  41.19 
 
 
405 aa  279  5e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.293282  normal  0.187166 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  40.26 
 
 
389 aa  279  5e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1019  pyridoxal-phosphate-dependent aminotransferase (NIFS protein)  40.93 
 
 
405 aa  278  8e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.103423  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  40.21 
 
 
396 aa  278  8e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0437  cysteine desulfurase NifS  40.31 
 
 
386 aa  278  9e-74  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.361233 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1553  cysteine desulfurase  40.41 
 
 
407 aa  277  2e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0484493  normal  0.0430953 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1353  aminotransferase, class V  44.01 
 
 
389 aa  277  2e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0720  Cysteine desulfurase  40.1 
 
 
381 aa  277  2e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0341  cysteine desulfurase  39.43 
 
 
388 aa  277  3e-73  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1058  cysteine desulfurase  40.67 
 
 
405 aa  276  5e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0834623  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  41.56 
 
 
396 aa  276  5e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2579  cysteine desulfurase  40.16 
 
 
407 aa  276  6e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120053  hitchhiker  0.000683499 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02422  cysteine desulfurase  41.9 
 
 
404 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.657115  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1138  cysteine desulfurase IscS  41.9 
 
 
404 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2905  cysteine desulfurase  41.9 
 
 
404 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0404853  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2683  cysteine desulfurase  41.9 
 
 
404 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.980146  normal  0.976252 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2815  cysteine desulfurase  41.9 
 
 
404 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00976282  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1147  cysteine desulfurase  41.9 
 
 
404 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0105086  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3109  aminotransferase class V  39.13 
 
 
381 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00030249  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02386  hypothetical protein  41.9 
 
 
404 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.730969  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2681  cysteine desulfurase  41.9 
 
 
404 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.174524  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3762  cysteine desulfurase  41.9 
 
 
404 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00149492  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2630  aminotransferase class V  42.44 
 
 
1143 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1458  cysteine desulfurase  40.16 
 
 
407 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1068  aminotransferase, class V  43.59 
 
 
393 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0344653  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0229  Cysteine desulfurase  40.62 
 
 
405 aa  273  5.000000000000001e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2719  aminotransferase class V  38.8 
 
 
380 aa  272  6e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2275  aminotransferase, class V  41.75 
 
 
386 aa  272  6e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  40.78 
 
 
404 aa  272  7e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2036  cysteine desulfurase  39.9 
 
 
407 aa  272  7e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.639443  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2163  cysteine desulfurase  39.9 
 
 
407 aa  272  7e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.675105  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2558  cysteine desulfurase NifS  42.44 
 
 
388 aa  272  9e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.947611  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3560  aminotransferase class V  43.28 
 
 
377 aa  271  1e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0251631  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4244  aminotransferase class V  38.72 
 
 
381 aa  271  2e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00204023  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3031  cysteine desulfurase  41.39 
 
 
404 aa  270  2e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.563846  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4262  aminotransferase class V  41.27 
 
 
395 aa  270  2e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0281  cysteine desulfurase  40.72 
 
 
404 aa  271  2e-71  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.910551  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  39.48 
 
 
407 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  40.76 
 
 
409 aa  270  2.9999999999999997e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1581  aminotransferase, class V  44.67 
 
 
1135 aa  269  5e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.863454  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2205  cysteine desulfurase IscS  40.16 
 
 
403 aa  269  5.9999999999999995e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00230458  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1551  aminotransferase class V  41.03 
 
 
383 aa  269  7e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0624  aminotransferase, class V  40.83 
 
 
385 aa  269  7e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00292698 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2217  cysteine desulfurase  39.38 
 
 
407 aa  268  8e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1708  cysteine desulfurase  39.38 
 
 
407 aa  268  8e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3103  cysteine desulfurase  39.38 
 
 
407 aa  268  8e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.412431  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1489  cysteine desulfurase  39.38 
 
 
407 aa  268  8e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.71249  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2698  cysteine desulfurase  41.39 
 
 
404 aa  268  8.999999999999999e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.016381  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0379  cysteine desulfurase  42.05 
 
 
373 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0422  cysteine desulfurase  42.05 
 
 
373 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2805  cysteine desulfurase  41.39 
 
 
404 aa  268  8.999999999999999e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2742  cysteine desulfurase  41.39 
 
 
404 aa  268  8.999999999999999e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.46384  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1755  cysteine desulfurase  42.05 
 
 
373 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.983783  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1592  Cysteine desulfurase  44.5 
 
 
378 aa  268  8.999999999999999e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0178166 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2917  cysteine desulfurase  41.39 
 
 
404 aa  268  8.999999999999999e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1568  cysteine desulfurase  42.05 
 
 
373 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1225  cysteine desulfurase  42.05 
 
 
414 aa  268  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.738138  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  39.59 
 
 
379 aa  268  1e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2865  cysteine desulfurase  41.32 
 
 
373 aa  268  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1025  cysteine desulfurase  39.9 
 
 
406 aa  268  1e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00998384  normal  0.30784 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>